RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 PBRM1Q86U86 1689 aa10.58□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 STK24Q9Y6E0 443 aa10.58□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 GRIN2BQ13224 1484 aa10.56□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.55□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 CEP162Q5TB80 1403 aa10.55□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CTPS1-201ENST00000372616 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP10.53□□□□□ -0.721e-6■■■■■ 29
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CTPS1-201ENST00000372616 FHAD1B1AJZ9 1412 aa10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM132AQ24JP5 1023 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 ADAMTS12P58397 1594 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 PYGBP11216 843 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 RASEFQ8IZ41 740 aa10.51□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 FAM212AQ96EL1 285 aa10.49□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CADPS2Q86UW7 1296 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CLIP1P30622 1438 aa10.48□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 CREBZFQ9NS37 354 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa10.46□□□□□ -0.73
CTPS1-201ENST00000372616 KCNV2Q8TDN2 545 aa10.45□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 SYNJ2O15056 1496 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 C14orf37Q86TY3 774 aa10.44□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 LMOD2Q6P5Q4 547 aa10.43□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 GRIN2AQ12879 1464 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB5A4FU69 1503 aa10.42□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 ARXQ96QS3 562 aa10.41□□□□□ -0.74
CTPS1-201ENST00000372616 PRR29P0C7W0 189 aa10.4□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 VPS8Q8N3P4 1428 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 IQGAP2Q13576 1575 aa10.39□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 P3H3Q8IVL6 736 aa10.38□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 WDR70Q9NW82 654 aa10.38□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa10.38□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa10.37□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD9Q5K651 1589 aa10.35□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 ARAP1Q96P48 1450 aa10.35□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 SGIP1Q9BQI5 828 aa10.35□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 NUP160Q12769 1436 aa10.35□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 UGGT2Q9NYU1 1516 aa10.34□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 CHD1O14646 1710 aa10.34□□□□□ -0.75
CTPS1-201ENST00000372616 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 CEP170Q5SW79 1584 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 FMN1Q68DA7 1419 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH6Q7L0X2 663 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 FHOD3Q2V2M9 1422 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA0556O60303 1618 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K1Q13233 1512 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 NEUROD2Q15784 382 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 ANP32EQ9BTT0 268 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 FYCO1Q9BQS8 1478 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 SEMA3EO15041 775 aa10.26□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa10.25□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R37O75864 691 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 HOMEZQ8IX15 550 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 JPH4Q96JJ6 628 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 DISP1Q96F81 1524 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 MFRPQ9BY79 579 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 SHROOM2Q13796 1616 aa10.24□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP43Q8NDM7 1665 aa10.22□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 CLASP1Q7Z460 1538 aa10.22□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 TIAM1Q13009 1591 aa10.21□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 AKT1S1Q96B36 256 aa10.21□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 HECW1Q76N89 1606 aa10.21□□□□□ -0.77
CTPS1-201ENST00000372616 CHADLQ6NUI6 762 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC18Q5T9S5 1454 aa10.2□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa10.17□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 E2F4Q16254 413 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa10.16□□□□□ -0.78
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
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