Protein–RNA interactions for Protein: Q7L2E3

DHX30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX30Q7L2E3 SGPL1-204ENST00000486993 537 ntTSL 1 (best)24.14■■□□□ 1.452e-107■■■■■ 542.7
DHX30Q7L2E3 SGPL1-202ENST00000373202 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.582e-107■■■■■ 542.7
DHX30Q7L2E3 SMC4-221ENST00000489573 1553 ntTSL 1 (best)24.41■■□□□ 1.51e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-209ENST00000468653 1756 ntTSL 221.12■□□□□ 0.971e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-211ENST00000469858 1971 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.561e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.291e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-219ENST00000487747 637 ntTSL 511.61□□□□□ -0.551e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-227ENST00000497984 563 ntTSL 510.96□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.661e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-213ENST00000472282 667 ntTSL 310.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 SMC4-214ENST00000472991 582 ntTSL 510.68□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 SMC4-208ENST00000467468 566 ntTSL 49.3□□□□□ -0.921e-6■■■■■ 406.9
DHX30Q7L2E3 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.71□□□□□ -1.661e-6■■■■■ 406.9
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DHX30Q7L2E3 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.124e-7■■■■■ 353.7
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DHX30Q7L2E3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.144e-50■■■■■ 143.6
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DHX30Q7L2E3 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.044e-50■■■■■ 143.6
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DHX30Q7L2E3 OPA1-214ENST00000482865 567 ntTSL 48.18□□□□□ -1.14e-50■■■■■ 143.6
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DHX30Q7L2E3 MST1R-215ENST00000621387 4449 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.346e-18■■■■■ 108.8
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DHX30Q7L2E3 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 512.76□□□□□ -0.378e-11■■■■■ 90.3
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DHX30Q7L2E3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 79.9
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DHX30Q7L2E3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.383e-7■■■■■ 79.9
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DHX30Q7L2E3 C19orf81-202ENST00000458538 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.67■□□□□ 0.424e-13■■■■■ 79.5
DHX30Q7L2E3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.461e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 ADAM23-203ENST00000444281 460 ntTSL 39.16□□□□□ -0.941e-11■■■■■ 78.5
DHX30Q7L2E3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.154e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.394e-10■■■■■ 77.9
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DHX30Q7L2E3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.014e-10■■■■■ 77.9
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DHX30Q7L2E3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.794e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.734e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-202ENST00000518277 788 ntTSL 219.27■□□□□ 0.684e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.664e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.654e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-211ENST00000524138 682 ntTSL 318.92■□□□□ 0.624e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.534e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.314e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.074e-10■■■■■ 77.9
DHX30Q7L2E3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-8■■■■■ 76.6
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