RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 CHIC1Q5VXU3 224 aa18.67■□□□□ 0.58
CTPS1-201ENST00000372616 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTPS1-201ENST00000372616 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
CTPS1-201ENST00000372616 PLPPR3Q6T4P5 718 aa15.48■□□□□ 0.07
CTPS1-201ENST00000372616 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
CTPS1-201ENST00000372616 NISCHQ9Y2I1 1504 aa15.11■□□□□ 0.01
CTPS1-201ENST00000372616 ADRA2BP18089 450 aa14.78□□□□□ -0.04
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CTPS1-201ENST00000372616 KCNA4P22459 653 aa14.56□□□□□ -0.08
CTPS1-201ENST00000372616 PPP6R1Q9UPN7 881 aa14.53□□□□□ -0.08
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD1Q16676 465 aa14.31□□□□□ -0.12
CTPS1-201ENST00000372616 CSRNP3Q8WYN3 585 aa14□□□□□ -0.17
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CTPS1-201ENST00000372616 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.84□□□□□ -0.19
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CTPS1-201ENST00000372616 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
CTPS1-201ENST00000372616 NPM3O75607 178 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB22O15209 634 aa13.46□□□□□ -0.25
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa13.3□□□□□ -0.28
CTPS1-201ENST00000372616 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa13.17□□□□□ -0.3
CTPS1-201ENST00000372616 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CTPS1-201ENST00000372616 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-201ENST00000372616 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-201ENST00000372616 FOXD4L1Q9NU39 408 aa12.99□□□□□ -0.33
CTPS1-201ENST00000372616 SLC24A1O60721 1099 aa12.95□□□□□ -0.34
CTPS1-201ENST00000372616 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.73□□□□□ -0.37
CTPS1-201ENST00000372616 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP12.68□□□□□ -0.38
CTPS1-201ENST00000372616 DNAJC5BQ9UF47 199 aa12.68□□□□□ -0.38
CTPS1-201ENST00000372616 MSH5O43196 834 aa12.65□□□□□ -0.38
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A2P04920 1241 aa12.63□□□□□ -0.39
CTPS1-201ENST00000372616 FKBP8Q14318 412 aa12.61□□□□□ -0.39
CTPS1-201ENST00000372616 POTEDQ86YR6 584 aa12.61□□□□□ -0.39
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa12.57□□□□□ -0.4
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC9O60706 1549 aa12.5□□□□□ -0.41
CTPS1-201ENST00000372616 MYO15BQ96JP2 1530 aa12.47□□□□□ -0.41
CTPS1-201ENST00000372616 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP12.44□□□□□ -0.42
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF8L2P0C7V8 631 aa12.42□□□□□ -0.42
CTPS1-201ENST00000372616 DMRT2Q9Y5R5 561 aa12.39□□□□□ -0.43
CTPS1-201ENST00000372616 NACADO15069 1562 aa12.39□□□□□ -0.43
CTPS1-201ENST00000372616 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
CTPS1-201ENST00000372616 ATXN8OSP0DMR3 200 aa12.32□□□□□ -0.44
CTPS1-201ENST00000372616 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa12.29□□□□□ -0.44
CTPS1-201ENST00000372616 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
CTPS1-201ENST00000372616 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa12.14□□□□□ -0.47
CTPS1-201ENST00000372616 SCRIBQ14160 1630 aa12.1□□□□□ -0.47
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF8L1A6NGE4 600 aa12.04□□□□□ -0.48
CTPS1-201ENST00000372616 UNC13AQ9UPW8 1703 aa11.99□□□□□ -0.49
CTPS1-201ENST00000372616 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.53e-6■■□□□ 13.3
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CTPS1-201ENST00000372616 BICRAQ9NZM4 1560 aa11.84□□□□□ -0.51
CTPS1-201ENST00000372616 HRCP23327 699 aa11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-201ENST00000372616 PLCB2Q00722 1185 aa11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-201ENST00000372616 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.52
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CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 SPDYE4A6NLX3 237 aa11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP11.73□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO3Q9UK99 471 aa11.7□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 CECR2Q9BXF3 1484 aa11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCA4P51532 1647 aa11.64□□□□□ -0.55
CTPS1-201ENST00000372616 MROH2BQ7Z745 1585 aa11.62□□□□□ -0.55
CTPS1-201ENST00000372616 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CTPS1-201ENST00000372616 PKD2Q13563 968 aa11.56□□□□□ -0.56
CTPS1-201ENST00000372616 PEG3Q9GZU2 1588 aa11.53□□□□□ -0.56
CTPS1-201ENST00000372616 WIZO95785 1651 aa11.53□□□□□ -0.56
CTPS1-201ENST00000372616 PROM2Q8N271 834 aa11.53□□□□□ -0.56
CTPS1-201ENST00000372616 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 BCANQ96GW7 911 aa11.51□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCA2P51531 1590 aa11.5□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 PCGF6Q9BYE7 350 aa11.48□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 TAOK2Q9UL54 1235 aa11.48□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
CTPS1-201ENST00000372616 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa11.45□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 FBLN2P98095 1184 aa11.44□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa11.44□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 POLA2Q14181 598 aa11.42□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.41□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 HMGXB3Q12766 1538 aa11.4□□□□□ -0.58
CTPS1-201ENST00000372616 NCAPD3P42695 1498 aa11.4□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP11.39□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.37□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 CFAP44Q96MT7 982 aa11.36□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 APLP2Q06481 763 aa11.36□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa11.35□□□□□ -0.59
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
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