RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
NISCH-201ENST00000345716 RGS3P49796 1198 aa26.93■■□□□ 1.9
NISCH-201ENST00000345716 MORC1Q86VD1 984 aa26.93■■□□□ 1.9
NISCH-201ENST00000345716 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.91■■□□□ 1.9
NISCH-201ENST00000345716 NCAPD3P42695 1498 aa26.89■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 RALBP1Q15311 655 aa26.87■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.86■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 A0A0G2JS52 829 aa26.86■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 KIF3BO15066 747 aa26.86■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 STK26Q9P289 416 aa26.84■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.84■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.83■■□□□ 1.89
NISCH-201ENST00000345716 HDGFP51858 240 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 MS4A1P11836 297 aa26.81■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 KIF21BO75037 1637 aa26.79■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 LMOD2Q6P5Q4 547 aa26.79■■□□□ 1.88
NISCH-201ENST00000345716 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 PTPRGP23470 1445 aa26.72■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 ERICH6BQ5W0A0 696 aa26.72■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.71■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 CASC1Q6TDU7 716 aa26.71■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 SOX12O15370 315 aa26.71■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
NISCH-201ENST00000345716 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA6L22H0YM25 854 aa26.67■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa26.66■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 PHLDB1Q86UU1 1377 aa26.66■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 NLRP13Q86W25 1043 aa26.66■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 SYNJ1O43426 1573 aa26.65■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 FGD6Q6ZV73 1430 aa26.65■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.64■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
NISCH-201ENST00000345716 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.62■■□□□ 1.85
NISCH-201ENST00000345716 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa26.62■■□□□ 1.85
NISCH-201ENST00000345716 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.61■■□□□ 1.85
NISCH-201ENST00000345716 CFTRP13569 1480 aa26.6■■□□□ 1.85
NISCH-201ENST00000345716 NCLP19338 710 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
NISCH-201ENST00000345716 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.841e-6■■■■■ 27.8
NISCH-201ENST00000345716 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.58■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 KIF15Q9NS87 1388 aa26.56■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 ARAP1Q96P48 1450 aa26.56■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 CUX1P39880 1505 aa26.54■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.54■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 USP47Q96K76 1375 aa26.52■■□□□ 1.84
NISCH-201ENST00000345716 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 GOLGA2Q08379 1002 aa26.51■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 PANK3Q9H999 370 aa26.5■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 TRAK1Q9UPV9 953 aa26.5■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 PDE3BQ13370 1112 aa26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 CCDC146Q8IYE0 955 aa26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 TERF2IPQ9NYB0 399 aa26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 UACAQ9BZF9 1416 aa26.48■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 NCOA2Q15596 1464 aa26.46■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
NISCH-201ENST00000345716 PRXQ9BXM0 1461 aa26.44■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa26.43■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.42■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 TOP2BQ02880 1626 aa26.41■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.4■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 NESP48681 1621 aa26.39■■□□□ 1.82
NISCH-201ENST00000345716 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 GRIN2BQ13224 1484 aa26.38■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 HSCBQ8IWL3 235 aa26.38■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 TPRNQ4KMQ1 711 aa26.37■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 HMGXB3Q12766 1538 aa26.36■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 PRDM2Q13029 1718 aa26.35■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.34■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.33■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
NISCH-201ENST00000345716 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.32■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 VGFO15240 615 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 APBB1O00213 710 aa26.31■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 KCNJ4P48050 445 aa26.31■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 CLUAP1Q96AJ1 413 aa26.31■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa26.3■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 EID1Q9Y6B2 187 aa26.29■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 CCDC7Q96M83 1385 aa26.29■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 TOPBP1Q92547 1522 aa26.29■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.28■■□□□ 1.8
NISCH-201ENST00000345716 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.28■■□□□ 1.8
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