RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.34■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.33■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 NEUROD2Q15784 382 aa21.33■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 RALBP1Q15311 655 aa21.32■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 RCAN3Q9UKA8 241 aa21.32■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa21.32■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa21.32■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 DEKP35659 375 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.28■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.28■■□□□ 1
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.27■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.26■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.25■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 CFAP53Q96M91 514 aa21.25■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 NCOA2Q15596 1464 aa21.24■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 TIAM1Q13009 1591 aa21.24■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 NLRP13Q86W25 1043 aa21.23■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 BICRAQ9NZM4 1560 aa21.23■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 FYCO1Q9BQS8 1478 aa21.22■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC7Q96M83 1385 aa21.22■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 USP47Q96K76 1375 aa21.21■□□□□ 0.99
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 JPH4Q96JJ6 628 aa21.2■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 WDR97A6NE52 1622 aa21.19■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.19■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 HMGXB3Q12766 1538 aa21.17■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.16■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 KIF15Q9NS87 1388 aa21.16■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.15■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
MEGF6-201ENST00000294599 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.12■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 PDE3BQ13370 1112 aa21.12■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 HFM1A2PYH4 1435 aa21.11■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 PEG3Q9GZU2 1588 aa21.09■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 EFCAB5A4FU69 1503 aa21.08■□□□□ 0.97
MEGF6-201ENST00000294599 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.08■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.08■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 KANK1Q14678 1352 aa21.07■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.07■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 PLEKHG5O94827 1062 aa21.07■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 MORC1Q86VD1 984 aa21.06■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.06■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 PANK3Q9H999 370 aa21.05■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.05■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 NESP48681 1621 aa21.05■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.05■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC144AA2RUR9 1427 aa21.04■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.04■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 NBPF8Q3BBV2 869 aa21.04■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.04■□□□□ 0.962e-9■■■■■ 39.6
MEGF6-201ENST00000294599 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.03■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 C14orf37Q86TY3 774 aa21.03■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 TOPBP1Q92547 1522 aa21.02■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA2Q08379 1002 aa21.02■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC184Q52MB2 194 aa21.02■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 PLIN1O60240 522 aa21.02■□□□□ 0.96
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB7CA1YPR0 619 aa21.01■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 NAIPQ13075 1403 aa21.01■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.99■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 POGKQ9P215 609 aa20.99■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 PDE4AP27815 886 aa20.97■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP20.97■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 MAP3K1Q13233 1512 aa20.96■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.95■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 KIF3BO15066 747 aa20.95■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 GGT6Q6P531 493 aa20.95■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.95■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.94■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 CASC1Q6TDU7 716 aa20.94■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 MS4A1P11836 297 aa20.94■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 TPRNQ4KMQ1 711 aa20.93■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 UNC13AQ9UPW8 1703 aa20.93■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.93■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.92■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 CRBNQ96SW2 442 aa20.91■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 MIA2Q96PC5 1412 aa20.91■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP20.91■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 PTPRGP23470 1445 aa20.91■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP20.9■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP20.9■□□□□ 0.94
MEGF6-201ENST00000294599 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP20.89■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP20.88■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 PRDM2Q13029 1718 aa20.88■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa20.88■□□□□ 0.93
MEGF6-201ENST00000294599 DNMBPQ6XZF7 1577 aa20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms