RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.32□□□□□ -1.56
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.29□□□□□ -1.56
MEGF6-201ENST00000294599 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
MEGF6-201ENST00000294599 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.24□□□□□ -1.57
MEGF6-201ENST00000294599 SPRR2DP22532 72 aa5.23□□□□□ -1.57
MEGF6-201ENST00000294599 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.2□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.19□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.19□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.17□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 MT1MQ8N339 61 aa5.17□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.15□□□□□ -1.58
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.1□□□□□ -1.59
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.1□□□□□ -1.59
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.1□□□□□ -1.59
MEGF6-201ENST00000294599 USH2AO75445 5202 aa5.07□□□□□ -1.6
MEGF6-201ENST00000294599 KMT2DO14686 5537 aa5.03□□□□□ -1.6
MEGF6-201ENST00000294599 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
MEGF6-201ENST00000294599 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
MEGF6-201ENST00000294599 PRM1P04553 51 aa4.87□□□□□ -1.63
MEGF6-201ENST00000294599 MT3P25713 68 aa4.87□□□□□ -1.63
MEGF6-201ENST00000294599 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.81□□□□□ -1.64
MEGF6-201ENST00000294599 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
MEGF6-201ENST00000294599 MT1AP04731 61 aa4.73□□□□□ -1.65
MEGF6-201ENST00000294599 MT4P47944 62 aa4.71□□□□□ -1.66
MEGF6-201ENST00000294599 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.68□□□□□ -1.66
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.66□□□□□ -1.66
MEGF6-201ENST00000294599 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.65□□□□□ -1.67
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.63□□□□□ -1.67
MEGF6-201ENST00000294599 SSPOA2VEC9 5147 aa4.6□□□□□ -1.67
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.59□□□□□ -1.67
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1DQ5T752 114 aa4.59□□□□□ -1.67
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.46□□□□□ -1.69
MEGF6-201ENST00000294599 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.37□□□□□ -1.71
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.36□□□□□ -1.71
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.36□□□□□ -1.71
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.24□□□□□ -1.73
MEGF6-201ENST00000294599 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.24□□□□□ -1.73
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.19□□□□□ -1.74
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-9P26371 169 aa4.07□□□□□ -1.76
MEGF6-201ENST00000294599 MDN1Q9NU22 5596 aa4.04□□□□□ -1.76
MEGF6-201ENST00000294599 LCE4AQ5TA78 99 aa4.03□□□□□ -1.76
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.03□□□□□ -1.76
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.93□□□□□ -1.78
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.78□□□□□ -1.8
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1CQ5T751 118 aa3.75□□□□□ -1.81
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1EQ5T753 118 aa3.75□□□□□ -1.81
MEGF6-201ENST00000294599 LCE1FQ5T754 118 aa3.75□□□□□ -1.81
MEGF6-201ENST00000294599 NEBP20929 6669 aa3.71□□□□□ -1.82
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.66□□□□□ -1.82
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.63□□□□□ -1.83
MEGF6-201ENST00000294599 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.53□□□□□ -1.84
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.41□□□□□ -1.86
MEGF6-201ENST00000294599 MUC5ACP98088 5654 aa3.38□□□□□ -1.87
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.36□□□□□ -1.87
MEGF6-201ENST00000294599 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.3□□□□□ -1.88
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.3□□□□□ -1.88
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.19□□□□□ -1.9
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.19□□□□□ -1.9
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.07□□□□□ -1.92
MEGF6-201ENST00000294599 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.03□□□□□ -1.93
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3□□□□□ -1.93
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.99□□□□□ -1.93
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-8O75690 187 aa2.7□□□□□ -1.98
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.67□□□□□ -1.98
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.63□□□□□ -1.99
MEGF6-201ENST00000294599 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.53□□□□□ -2
MEGF6-201ENST00000294599 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.37□□□□□ -2.03
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.2□□□□□ -2.06
MEGF6-201ENST00000294599 PHGR1C9JFL3 82 aa2.18□□□□□ -2.06
MEGF6-201ENST00000294599 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms