RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.55■■■□□ 2.32
MEGF6-201ENST00000294599 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.09■■■□□ 2.09
MEGF6-201ENST00000294599 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.64■■■□□ 2.02
MEGF6-201ENST00000294599 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.48■■□□□ 1.99
MEGF6-201ENST00000294599 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.16■■□□□ 1.78
MEGF6-201ENST00000294599 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.15■■□□□ 1.78
MEGF6-201ENST00000294599 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
MEGF6-201ENST00000294599 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.58■■□□□ 1.69
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM41Q8WV44 630 aa25.57■■□□□ 1.68
MEGF6-201ENST00000294599 HRCP23327 699 aa25.43■■□□□ 1.66
MEGF6-201ENST00000294599 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
MEGF6-201ENST00000294599 APLP2Q06481 763 aa25.34■■□□□ 1.65
MEGF6-201ENST00000294599 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.64
MEGF6-201ENST00000294599 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.31■■□□□ 1.64
MEGF6-201ENST00000294599 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
MEGF6-201ENST00000294599 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
MEGF6-201ENST00000294599 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
MEGF6-201ENST00000294599 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.89■■□□□ 1.57
MEGF6-201ENST00000294599 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
MEGF6-201ENST00000294599 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
MEGF6-201ENST00000294599 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
MEGF6-201ENST00000294599 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
MEGF6-201ENST00000294599 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
MEGF6-201ENST00000294599 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.33■■□□□ 1.49
MEGF6-201ENST00000294599 ABCC9O60706 1549 aa24.32■■□□□ 1.48
MEGF6-201ENST00000294599 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.26■■□□□ 1.47
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.25■■□□□ 1.47
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
MEGF6-201ENST00000294599 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.19■■□□□ 1.46
MEGF6-201ENST00000294599 NEFLP07196 543 aa24.16■■□□□ 1.46
MEGF6-201ENST00000294599 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
MEGF6-201ENST00000294599 SCRIBQ14160 1630 aa24■■□□□ 1.43
MEGF6-201ENST00000294599 ITGAEP38570 1179 aa24■■□□□ 1.43
MEGF6-201ENST00000294599 MYT1Q01538 1121 aa23.99■■□□□ 1.43
MEGF6-201ENST00000294599 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.432e-6■■■□□ 18.1
MEGF6-201ENST00000294599 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.79■■□□□ 1.4
MEGF6-201ENST00000294599 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
MEGF6-201ENST00000294599 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.74■■□□□ 1.39
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
MEGF6-201ENST00000294599 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
MEGF6-201ENST00000294599 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.52■■□□□ 1.36
MEGF6-201ENST00000294599 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
MEGF6-201ENST00000294599 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
MEGF6-201ENST00000294599 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
MEGF6-201ENST00000294599 NEUROD1Q13562 356 aa23.35■■□□□ 1.33
MEGF6-201ENST00000294599 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.28■■□□□ 1.32
MEGF6-201ENST00000294599 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
MEGF6-201ENST00000294599 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.26■■□□□ 1.31
MEGF6-201ENST00000294599 CEP162Q5TB80 1403 aa23.21■■□□□ 1.31
MEGF6-201ENST00000294599 NACADO15069 1562 aa23.18■■□□□ 1.3
MEGF6-201ENST00000294599 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.16■■□□□ 1.3
MEGF6-201ENST00000294599 P3H3Q8IVL6 736 aa23.15■■□□□ 1.3
MEGF6-201ENST00000294599 BCANQ96GW7 911 aa23.15■■□□□ 1.3
MEGF6-201ENST00000294599 CLIP1P30622 1438 aa23.11■■□□□ 1.29
MEGF6-201ENST00000294599 EEA1Q15075 1411 aa23.09■■□□□ 1.29
MEGF6-201ENST00000294599 TRIM52Q96A61 297 aa23.07■■□□□ 1.28
MEGF6-201ENST00000294599 MIER1Q8N108 512 aa23.06■■□□□ 1.28
MEGF6-201ENST00000294599 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.06■■□□□ 1.28
MEGF6-201ENST00000294599 ANP32CO43423 234 aa23.05■■□□□ 1.28
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA3Q08378 1498 aa23.04■■□□□ 1.28
MEGF6-201ENST00000294599 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.01■■□□□ 1.27
MEGF6-201ENST00000294599 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
MEGF6-201ENST00000294599 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
MEGF6-201ENST00000294599 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
MEGF6-201ENST00000294599 SOGA1O94964 1423 aa22.91■■□□□ 1.26
MEGF6-201ENST00000294599 CLSPNQ9HAW4 1339 aa22.86■■□□□ 1.25
MEGF6-201ENST00000294599 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
MEGF6-201ENST00000294599 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
MEGF6-201ENST00000294599 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.83■■□□□ 1.25
MEGF6-201ENST00000294599 ARID3CA6NKF2 412 aa22.78■■□□□ 1.24
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.78■■□□□ 1.24
MEGF6-201ENST00000294599 ABCC8Q09428 1581 aa22.78■■□□□ 1.24
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MEGF6-201ENST00000294599 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MEGF6-201ENST00000294599 FKBP8Q14318 412 aa22.74■■□□□ 1.23
MEGF6-201ENST00000294599 TONSLQ96HA7 1378 aa22.73■■□□□ 1.23
MEGF6-201ENST00000294599 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
MEGF6-201ENST00000294599 WIZO95785 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
MEGF6-201ENST00000294599 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
MEGF6-201ENST00000294599 KIF27Q86VH2 1401 aa22.58■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 FBLN2P98095 1184 aa22.56■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.55■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.55■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.52■■□□□ 1.2
MEGF6-201ENST00000294599 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
MEGF6-201ENST00000294599 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.43■■□□□ 1.18
MEGF6-201ENST00000294599 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.43■■□□□ 1.18
MEGF6-201ENST00000294599 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
MEGF6-201ENST00000294599 SIN3AQ96ST3 1273 aa22.42■■□□□ 1.18
MEGF6-201ENST00000294599 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa22.41■■□□□ 1.18
MEGF6-201ENST00000294599 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.36■■□□□ 1.17
MEGF6-201ENST00000294599 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
MEGF6-201ENST00000294599 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
MEGF6-201ENST00000294599 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
MEGF6-201ENST00000294599 MRS2Q9HD23 443 aa22.29■■□□□ 1.16
MEGF6-201ENST00000294599 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms