RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 SMARCA4P51532 1647 aa22.27■■□□□ 1.16
MEGF6-201ENST00000294599 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.163e-6■■■□□ 17.3
MEGF6-201ENST00000294599 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa22.25■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 CUX2O14529 1486 aa22.25■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa22.25■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 BCL11AQ9H165 835 aa22.21■■□□□ 1.15
MEGF6-201ENST00000294599 SMARCA2P51531 1590 aa22.19■■□□□ 1.14
MEGF6-201ENST00000294599 FHAD1B1AJZ9 1412 aa22.18■■□□□ 1.14
MEGF6-201ENST00000294599 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.15■■□□□ 1.14
MEGF6-201ENST00000294599 TMC1Q8TDI8 760 aa22.15■■□□□ 1.14
MEGF6-201ENST00000294599 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.14■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa22.11■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa22.11■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.1■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.09■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
MEGF6-201ENST00000294599 NEFMP07197 916 aa22.07■■□□□ 1.12
MEGF6-201ENST00000294599 TSPY4P0CV99 314 aa22.05■■□□□ 1.12
MEGF6-201ENST00000294599 TSPY10P0CW01 314 aa22.05■■□□□ 1.12
MEGF6-201ENST00000294599 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.01■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.113e-6■■□□□ 12.7
MEGF6-201ENST00000294599 SLC24A1O60721 1099 aa21.99■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 CCER2I3L3R5 266 aa21.98■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa21.98■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa21.97■■□□□ 1.11
MEGF6-201ENST00000294599 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MEGF6-201ENST00000294599 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
MEGF6-201ENST00000294599 NBR1Q14596 966 aa21.92■■□□□ 1.1
MEGF6-201ENST00000294599 KCNH8Q96L42 1107 aa21.9■■□□□ 1.1
MEGF6-201ENST00000294599 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.85■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.85■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.84■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 KIF21BO75037 1637 aa21.83■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa21.83■■□□□ 1.09
MEGF6-201ENST00000294599 CADPSQ9ULU8 1353 aa21.82■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 RGL3Q3MIN7 710 aa21.81■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.81■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 FMN1Q68DA7 1419 aa21.8■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 FOXD1Q16676 465 aa21.8■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.78■■□□□ 1.08
MEGF6-201ENST00000294599 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.76■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 SYNJ1O43426 1573 aa21.74■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.72■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 IGF1RP08069 1367 aa21.71■■□□□ 1.07
MEGF6-201ENST00000294599 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.66■■□□□ 1.06
MEGF6-201ENST00000294599 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.65■■□□□ 1.06
MEGF6-201ENST00000294599 ARAP1Q96P48 1450 aa21.65■■□□□ 1.06
MEGF6-201ENST00000294599 ARXQ96QS3 562 aa21.63■■□□□ 1.05
MEGF6-201ENST00000294599 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.6■■□□□ 1.05
MEGF6-201ENST00000294599 PKD2Q13563 968 aa21.6■■□□□ 1.05
MEGF6-201ENST00000294599 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.6■■□□□ 1.05
MEGF6-201ENST00000294599 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.55■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.55■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 PRXQ9BXM0 1461 aa21.55■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 PDS5BQ9NTI5 1447 aa21.54■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 ERICH6BQ5W0A0 696 aa21.54■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.53■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 FANCD2Q9BXW9 1451 aa21.53■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.53■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.53■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 NCAPD3P42695 1498 aa21.52■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
MEGF6-201ENST00000294599 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.03
MEGF6-201ENST00000294599 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.51■■□□□ 1.03
MEGF6-201ENST00000294599 CDCA8Q53HL2 280 aa21.45■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.44■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 TOP2BQ02880 1626 aa21.44■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.44■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 NUP155O75694 1391 aa21.43■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.42■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
MEGF6-201ENST00000294599 CFTRP13569 1480 aa21.39■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 PLPPR3Q6T4P5 718 aa21.39■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 ERCC6Q03468 1493 aa21.39■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 TMF1P82094 1093 aa21.39■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.38■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 NUDCQ9Y266 331 aa21.37■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 BECN1Q14457 450 aa21.37■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 UACAQ9BZF9 1416 aa21.36■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 CUX1P39880 1505 aa21.36■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.36■■□□□ 1.01
MEGF6-201ENST00000294599 RGS3P49796 1198 aa21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms