RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 ZBTB7CA1YPR0 619 aa22.73■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.73■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa22.72■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.7■■□□□ 1.23
SCARB2-201ENST00000264896 IGF1RP08069 1367 aa22.7■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 PLEKHG5O94827 1062 aa22.69■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.68■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 GGT6Q6P531 493 aa22.68■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.67■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 CASC1Q6TDU7 716 aa22.67■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 NCLP19338 710 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 JPH4Q96JJ6 628 aa22.66■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 NLRP13Q86W25 1043 aa22.66■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.65■■□□□ 1.22
SCARB2-201ENST00000264896 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP22.62■■□□□ 1.21
SCARB2-201ENST00000264896 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SCARB2-201ENST00000264896 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SCARB2-201ENST00000264896 PDE3BQ13370 1112 aa22.58■■□□□ 1.21
SCARB2-201ENST00000264896 KIF21BO75037 1637 aa22.57■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.56■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 KIF3BO15066 747 aa22.56■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.56■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 HDGFP51858 240 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 STK26Q9P289 416 aa22.54■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP22.53■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SCARB2-201ENST00000264896 GOLGA2Q08379 1002 aa22.51■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 KIF15Q9NS87 1388 aa22.51■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 MLECQ14165 292 aa22.49■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.49■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 DEKP35659 375 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.48■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 NCAPD3P42695 1498 aa22.48■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 HSCBQ8IWL3 235 aa22.47■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 A0A0G2JS52 829 aa22.47■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.46■■□□□ 1.19
SCARB2-201ENST00000264896 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.45■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 LMOD2Q6P5Q4 547 aa22.45■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.45■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.44■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 USP47Q96K76 1375 aa22.44■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.44■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.43■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 SOX12O15370 315 aa22.42■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 UACAQ9BZF9 1416 aa22.42■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 PTMAP06454 111 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 PANK3Q9H999 370 aa22.42■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SCARB2-201ENST00000264896 ARAP1Q96P48 1450 aa22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 CFAP44Q96MT7 982 aa22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 ERICH3Q5RHP9 1530 aa22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 PTPRGP23470 1445 aa22.38■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa22.37■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 TERF2IPQ9NYB0 399 aa22.36■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.36■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.34■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.34■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 SYNJ1O43426 1573 aa22.34■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 CUX1P39880 1505 aa22.33■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.33■■□□□ 1.17
SCARB2-201ENST00000264896 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.33■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.32■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 TRAK1Q9UPV9 953 aa22.31■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 CCDC7Q96M83 1385 aa22.31■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.3■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 KCNJ4P48050 445 aa22.3■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 PRXQ9BXM0 1461 aa22.29■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.28■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 MCCP23508 829 aa22.27■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 CFTRP13569 1480 aa22.27■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 NCOA2Q15596 1464 aa22.27■■□□□ 1.16
SCARB2-201ENST00000264896 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.25■■□□□ 1.15
SCARB2-201ENST00000264896 APBB1O00213 710 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms