RNA–Protein interactions for RNA: YML009C

MRPL39, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the large subunit, yeast

Gene MRPL39, Length 213 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPL39	YML009C	DHH1	P39517	506 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YJL206C	P39529	758 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	NDE1	P40215	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YJR030C	P47101	745 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PMT3	P47190	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MDM34	P53083	459 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ERG26	P53199	349 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YNL260C	P53846	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	ADE12	P80210	433 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	AAT1	Q01802	451 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RSM10	Q03201	203 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	VHS1	Q03785	461 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	CSN9	Q03981	162 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	RSF1	Q05043	376 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	VID22	Q05934	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	VHS3	Q08438	674 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	GUP2	Q08929	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	BMT6	Q12291	365 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PST1	Q12355	444 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MRPL39	YML009C	COX6	P00427	148 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	HEM2	P05373	342 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YCR006C	P25350	157 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	MCM5	P29496	775 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PRO1	P32264	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PHA2	P32452	334 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PET112	P33893	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ASK1	P35734	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	DMA1	P38823	416 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	EMP65	P40085	556 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SMX2	P40204	77 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SPG5	P42933	373 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	MIC19	P43594	170 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YFR020W	P43600	232 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ASK10	P48361	1146 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SHY1	P53266	389 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	VAM6	Q07468	1049 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RGT2	Q12300	763 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	STE3	P06783	470 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	GAL7	P08431	366 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SRB5	P32585	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SFA1	P32771	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SDH3	P33421	198 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	MRPL15	P36523	253 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	SOL2	P37262	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RGA1	P39083	1007 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PEP8	P40335	379 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	CEP3	P40969	608 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ELP2	P42935	788 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	URB2	P47108	1174 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	TIS11	P47977	285 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	TRM9	P49957	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	KXD1	P53158	218 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YGR266W	P53326	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	BIO4	P53630	237 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YNL058C	P53947	316 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	IRC13	Q08630	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	IOC2	Q12072	812 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YPR011C	Q12251	326 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	GLE1	Q12315	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	FRE7	Q12333	620 aa		4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	GCN1	P33892	2672 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	VAC17	P25591	423 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	ADE1	P27616	306 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	PTH2	P34222	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	NUP120	P35729	1037 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	YRO2	P38079	344 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	RRN10	P38204	145 aa		4.56	□□□□□ -1.68
MRPL39	YML009C	MNT3	P40549	630 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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