Protein–RNA interactions for Protein: Q12234

RUD3, GRIP domain-containing protein RUD3, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RUD3Q12234 NSR1YGR159C 1245 nt20.85■□□□□ 0.93
RUD3Q12234 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.37■□□□□ 0.85
RUD3Q12234 NOP1YDL014W 984 nt19.61■□□□□ 0.73
RUD3Q12234 MDJ1YFL016C 1536 nt19.05■□□□□ 0.64
RUD3Q12234 YKL036CYKL036C 393 nt17.73■□□□□ 0.43
RUD3Q12234 YJL027CYJL027C 417 nt17.55■□□□□ 0.4
RUD3Q12234 SRX1YKL086W 384 nt17.11■□□□□ 0.33
RUD3Q12234 Q0297Q0297 156 nt16.95■□□□□ 0.3
RUD3Q12234 DBP2YNL112W 1641 nt16.62■□□□□ 0.25
RUD3Q12234 YBR190WYBR190W 312 nt16.47■□□□□ 0.23
RUD3Q12234 YCR051WYCR051W 669 nt16.15■□□□□ 0.18
RUD3Q12234 SCS3YGL126W 1143 nt16.04■□□□□ 0.16
RUD3Q12234 RTC3YHR087W 336 nt16.02■□□□□ 0.16
RUD3Q12234 SSA3YBL075C 1950 nt15.95■□□□□ 0.14
RUD3Q12234 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
RUD3Q12234 CCC1YLR220W 969 nt15.63■□□□□ 0.09
RUD3Q12234 RVS167YDR388W 1449 nt15.51■□□□□ 0.07
RUD3Q12234 PUT4YOR348C 1884 nt15.42■□□□□ 0.06
RUD3Q12234 YOL085CYOL085C 342 nt15.33■□□□□ 0.04
RUD3Q12234 SCJ1YMR214W 1134 nt15.25■□□□□ 0.03
RUD3Q12234 RPP1BYDL130W 321 nt15.2■□□□□ 0.02
RUD3Q12234 PKP1YIL042C 1185 nt15.12■□□□□ 0.01
RUD3Q12234 ARE1YCR048W 1833 nt14.94□□□□□ -0.02
RUD3Q12234 POA1YBR022W 534 nt14.85□□□□□ -0.03
RUD3Q12234 SHR5YOL110W 714 nt14.82□□□□□ -0.04
RUD3Q12234 URN1YPR152C 1398 nt14.77□□□□□ -0.04
RUD3Q12234 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.77□□□□□ -0.05
RUD3Q12234 SAH1YER043C 1350 nt14.74□□□□□ -0.05
RUD3Q12234 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.73□□□□□ -0.05
RUD3Q12234 OPI9YLR338W 858 nt14.72□□□□□ -0.05
RUD3Q12234 BSC6YOL137W 1494 nt14.67□□□□□ -0.06
RUD3Q12234 PET122YER153C 765 nt14.57□□□□□ -0.08
RUD3Q12234 DEP1YAL013W 1218 nt14.55□□□□□ -0.08
RUD3Q12234 SPT5YML010W 3192 nt14.49□□□□□ -0.09
RUD3Q12234 RPN10YHR200W 807 nt14.45□□□□□ -0.1
RUD3Q12234 SCR1SCR1 522 nt14.34□□□□□ -0.11
RUD3Q12234 BUD23YCR047C 828 nt14.33□□□□□ -0.12
RUD3Q12234 YDJ1YNL064C 1230 nt14.32□□□□□ -0.12
RUD3Q12234 ATS1YAL020C 1002 nt14.31□□□□□ -0.12
RUD3Q12234 YNL208WYNL208W 600 nt14.31□□□□□ -0.12
RUD3Q12234 PUN1YLR414C 792 nt14.29□□□□□ -0.12
RUD3Q12234 SSA4YER103W 1929 nt14.27□□□□□ -0.13
RUD3Q12234 PTC2YER089C 1395 nt14.19□□□□□ -0.14
RUD3Q12234 NAB2YGL122C 1578 nt14.13□□□□□ -0.15
RUD3Q12234 RRN5YLR141W 1092 nt14.08□□□□□ -0.16
RUD3Q12234 YJR018WYJR018W 363 nt14.06□□□□□ -0.16
RUD3Q12234 GAR1YHR089C 618 nt14.05□□□□□ -0.16
RUD3Q12234 MEP2YNL142W 1500 nt13.85□□□□□ -0.19
RUD3Q12234 FIS1YIL065C 468 nt13.84□□□□□ -0.19
RUD3Q12234 DAL1YIR027C 1383 nt13.81□□□□□ -0.2
RUD3Q12234 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.8□□□□□ -0.2
RUD3Q12234 BDF1YLR399C 2061 nt13.79□□□□□ -0.2
RUD3Q12234 RSB1YOR049C 1065 nt13.74□□□□□ -0.21
RUD3Q12234 FPR4YLR449W 1179 nt13.71□□□□□ -0.21
RUD3Q12234 YJR120WYJR120W 351 nt13.69□□□□□ -0.22
RUD3Q12234 INM2YDR287W 879 nt13.67□□□□□ -0.22
RUD3Q12234 PHO4YFR034C 939 nt13.67□□□□□ -0.22
RUD3Q12234 YPS1YLR120C 1710 nt13.64□□□□□ -0.23
RUD3Q12234 RPP2BYDR382W 333 nt13.63□□□□□ -0.23
RUD3Q12234 TIR1YER011W 765 nt13.63□□□□□ -0.23
RUD3Q12234 TAT1YBR069C 1860 nt13.61□□□□□ -0.23
RUD3Q12234 SSA1YAL005C 1929 nt13.58□□□□□ -0.23
RUD3Q12234 DCW1YKL046C 1350 nt13.58□□□□□ -0.24
RUD3Q12234 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.51□□□□□ -0.25
RUD3Q12234 YDR095CYDR095C 411 nt13.46□□□□□ -0.25
RUD3Q12234 EMI2YDR516C 1503 nt13.41□□□□□ -0.26
RUD3Q12234 YMR090WYMR090W 684 nt13.41□□□□□ -0.26
RUD3Q12234 YBL100CYBL100C 315 nt13.41□□□□□ -0.26
RUD3Q12234 YBR220CYBR220C 1683 nt13.39□□□□□ -0.27
RUD3Q12234 YDL221WYDL221W 552 nt13.28□□□□□ -0.28
RUD3Q12234 PST2YDR032C 597 nt13.26□□□□□ -0.29
RUD3Q12234 BDH2YAL061W 1254 nt13.25□□□□□ -0.29
RUD3Q12234 SDH1YKL148C 1923 nt13.23□□□□□ -0.29
RUD3Q12234 FUN26YAL022C 1554 nt13.23□□□□□ -0.29
RUD3Q12234 PTP1YDL230W 1008 nt13.2□□□□□ -0.3
RUD3Q12234 SRB2YHR041C 633 nt13.2□□□□□ -0.3
RUD3Q12234 RPP2AYOL039W 321 nt13.2□□□□□ -0.3
RUD3Q12234 CAC2YML102W 1407 nt13.19□□□□□ -0.3
RUD3Q12234 ALF1YNL148C 765 nt13.17□□□□□ -0.3
RUD3Q12234 PAC11YDR488C 1602 nt13.13□□□□□ -0.31
RUD3Q12234 TRM9YML014W 840 nt13.1□□□□□ -0.31
RUD3Q12234 SCC4YER147C 1875 nt13.06□□□□□ -0.32
RUD3Q12234 SEC11YIR022W 504 nt13.04□□□□□ -0.32
RUD3Q12234 PCH2YBR186W 1695 nt13.04□□□□□ -0.32
RUD3Q12234 CCT6YDR188W 1641 nt13.02□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 SIS1YNL007C 1059 nt13.01□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 IRC15YPL017C 1500 nt13□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 GUT2YIL155C 1950 nt12.99□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 LSM3YLR438C-A 270 nt12.97□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.96□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.96□□□□□ -0.33
RUD3Q12234 GIS3YLR094C 1509 nt12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 6.9 ms