Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.94■□□□□ 0.78
RRP42Q12277 NSR1YGR159C 1245 nt19.83■□□□□ 0.77
RRP42Q12277 NOP1YDL014W 984 nt19.37■□□□□ 0.69
RRP42Q12277 YKL036CYKL036C 393 nt17.79■□□□□ 0.44
RRP42Q12277 MDJ1YFL016C 1536 nt17.67■□□□□ 0.42
RRP42Q12277 Q0297Q0297 156 nt16.89■□□□□ 0.29
RRP42Q12277 SRX1YKL086W 384 nt16.88■□□□□ 0.29
RRP42Q12277 YJL027CYJL027C 417 nt16.61■□□□□ 0.25
RRP42Q12277 SCS3YGL126W 1143 nt16.14■□□□□ 0.17
RRP42Q12277 YCR051WYCR051W 669 nt16.05■□□□□ 0.16
RRP42Q12277 DBP2YNL112W 1641 nt15.55■□□□□ 0.08
RRP42Q12277 YOL085CYOL085C 342 nt15.38■□□□□ 0.05
RRP42Q12277 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.29■□□□□ 0.04
RRP42Q12277 PKP1YIL042C 1185 nt15.17■□□□□ 0.02
RRP42Q12277 CCC1YLR220W 969 nt15.17■□□□□ 0.02
RRP42Q12277 RPP1BYDL130W 321 nt15.16■□□□□ 0.02
RRP42Q12277 YBR190WYBR190W 312 nt15.08■□□□□ 0
RRP42Q12277 RTC3YHR087W 336 nt14.78□□□□□ -0.04
RRP42Q12277 RVS167YDR388W 1449 nt14.72□□□□□ -0.05
RRP42Q12277 SCJ1YMR214W 1134 nt14.56□□□□□ -0.08
RRP42Q12277 PET122YER153C 765 nt14.49□□□□□ -0.09
RRP42Q12277 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.45□□□□□ -0.1
RRP42Q12277 ATS1YAL020C 1002 nt14.4□□□□□ -0.1
RRP42Q12277 SCR1SCR1 522 nt14.37□□□□□ -0.11
RRP42Q12277 SHR5YOL110W 714 nt14.15□□□□□ -0.14
RRP42Q12277 RRN5YLR141W 1092 nt14.05□□□□□ -0.16
RRP42Q12277 YDJ1YNL064C 1230 nt13.98□□□□□ -0.17
RRP42Q12277 URN1YPR152C 1398 nt13.8□□□□□ -0.2
RRP42Q12277 RSB1YOR049C 1065 nt13.79□□□□□ -0.2
RRP42Q12277 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.77□□□□□ -0.21
RRP42Q12277 DEP1YAL013W 1218 nt13.77□□□□□ -0.21
RRP42Q12277 GAR1YHR089C 618 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP42Q12277 PUT4YOR348C 1884 nt13.69□□□□□ -0.22
RRP42Q12277 RPN10YHR200W 807 nt13.62□□□□□ -0.23
RRP42Q12277 OPI9YLR338W 858 nt13.59□□□□□ -0.23
RRP42Q12277 YNL208WYNL208W 600 nt13.56□□□□□ -0.24
RRP42Q12277 SAH1YER043C 1350 nt13.52□□□□□ -0.25
RRP42Q12277 ARE1YCR048W 1833 nt13.43□□□□□ -0.26
RRP42Q12277 PST2YDR032C 597 nt13.33□□□□□ -0.28
RRP42Q12277 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.31□□□□□ -0.28
RRP42Q12277 POA1YBR022W 534 nt13.29□□□□□ -0.28
RRP42Q12277 SSA3YBL075C 1950 nt13.27□□□□□ -0.29
RRP42Q12277 TIR1YER011W 765 nt13.23□□□□□ -0.29
RRP42Q12277 PUN1YLR414C 792 nt13.22□□□□□ -0.29
RRP42Q12277 YJR018WYJR018W 363 nt13.16□□□□□ -0.3
RRP42Q12277 SSA1YAL005C 1929 nt13.05□□□□□ -0.32
RRP42Q12277 PTC2YER089C 1395 nt13.05□□□□□ -0.32
RRP42Q12277 BUD23YCR047C 828 nt13.02□□□□□ -0.33
RRP42Q12277 BSC6YOL137W 1494 nt13.02□□□□□ -0.33
RRP42Q12277 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
RRP42Q12277 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.35
RRP42Q12277 YJR120WYJR120W 351 nt12.88□□□□□ -0.35
RRP42Q12277 YKL097CYKL097C 411 nt12.83□□□□□ -0.36
RRP42Q12277 SHU1YHL006C 453 nt12.82□□□□□ -0.36
RRP42Q12277 SRB2YHR041C 633 nt12.78□□□□□ -0.36
RRP42Q12277 FPR4YLR449W 1179 nt12.72□□□□□ -0.37
RRP42Q12277 DAL1YIR027C 1383 nt12.71□□□□□ -0.37
RRP42Q12277 INM2YDR287W 879 nt12.7□□□□□ -0.38
RRP42Q12277 FIS1YIL065C 468 nt12.69□□□□□ -0.38
RRP42Q12277 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.64□□□□□ -0.39
RRP42Q12277 WWM1YFL010C 636 nt12.63□□□□□ -0.39
RRP42Q12277 BDH2YAL061W 1254 nt12.61□□□□□ -0.39
RRP42Q12277 PHO4YFR034C 939 nt12.6□□□□□ -0.39
RRP42Q12277 YGR021WYGR021W 873 nt12.58□□□□□ -0.4
RRP42Q12277 YBL100CYBL100C 315 nt12.58□□□□□ -0.4
RRP42Q12277 HOM6YJR139C 1080 nt12.49□□□□□ -0.41
RRP42Q12277 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.45□□□□□ -0.42
RRP42Q12277 MNP1YGL068W 585 nt12.43□□□□□ -0.42
RRP42Q12277 LSM3YLR438C-A 270 nt12.43□□□□□ -0.42
RRP42Q12277 FUN26YAL022C 1554 nt12.4□□□□□ -0.42
RRP42Q12277 TRM9YML014W 840 nt12.39□□□□□ -0.43
RRP42Q12277 YPS1YLR120C 1710 nt12.34□□□□□ -0.43
RRP42Q12277 RKM5YLR137W 1104 nt12.31□□□□□ -0.44
RRP42Q12277 SPT5YML010W 3192 nt12.3□□□□□ -0.44
RRP42Q12277 ALF1YNL148C 765 nt12.29□□□□□ -0.44
RRP42Q12277 YDR095CYDR095C 411 nt12.27□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.27□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 YOR139CYOR139C 393 nt12.27□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 NPL3YDR432W 1245 nt12.25□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 CCT6YDR188W 1641 nt12.24□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 YOL037CYOL037C 354 nt12.23□□□□□ -0.45
RRP42Q12277 MEP2YNL142W 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
RRP42Q12277 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.19□□□□□ -0.46
RRP42Q12277 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.19□□□□□ -0.46
RRP42Q12277 RPP2AYOL039W 321 nt12.05□□□□□ -0.48
RRP42Q12277 SIS1YNL007C 1059 nt12.04□□□□□ -0.48
RRP42Q12277 DCW1YKL046C 1350 nt12.01□□□□□ -0.49
RRP42Q12277 SSA4YER103W 1929 nt11.96□□□□□ -0.49
RRP42Q12277 PTP1YDL230W 1008 nt11.95□□□□□ -0.5
RRP42Q12277 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.92□□□□□ -0.5
RRP42Q12277 YLR281CYLR281C 468 nt11.91□□□□□ -0.5
RRP42Q12277 WHI5YOR083W 888 nt11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.6 ms