Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.88■□□□□ 0.77
VHS1Q03785 NSR1YGR159C 1245 nt19.78■□□□□ 0.76
VHS1Q03785 NOP1YDL014W 984 nt19.3■□□□□ 0.68
VHS1Q03785 YKL036CYKL036C 393 nt17.75■□□□□ 0.43
VHS1Q03785 MDJ1YFL016C 1536 nt17.63■□□□□ 0.41
VHS1Q03785 SRX1YKL086W 384 nt16.81■□□□□ 0.28
VHS1Q03785 Q0297Q0297 156 nt16.8■□□□□ 0.28
VHS1Q03785 YJL027CYJL027C 417 nt16.61■□□□□ 0.25
VHS1Q03785 SCS3YGL126W 1143 nt16.33■□□□□ 0.2
VHS1Q03785 YCR051WYCR051W 669 nt16.02■□□□□ 0.16
VHS1Q03785 DBP2YNL112W 1641 nt15.51■□□□□ 0.07
VHS1Q03785 YOL085CYOL085C 342 nt15.37■□□□□ 0.05
VHS1Q03785 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.21■□□□□ 0.03
VHS1Q03785 CCC1YLR220W 969 nt15.18■□□□□ 0.02
VHS1Q03785 PKP1YIL042C 1185 nt15.16■□□□□ 0.02
VHS1Q03785 RPP1BYDL130W 321 nt15.1■□□□□ 0.01
VHS1Q03785 YBR190WYBR190W 312 nt15.05■□□□□ -0
VHS1Q03785 SCJ1YMR214W 1134 nt15□□□□□ -0.01
VHS1Q03785 RTC3YHR087W 336 nt14.8□□□□□ -0.04
VHS1Q03785 ATS1YAL020C 1002 nt14.73□□□□□ -0.05
VHS1Q03785 RVS167YDR388W 1449 nt14.67□□□□□ -0.06
VHS1Q03785 PET122YER153C 765 nt14.43□□□□□ -0.1
VHS1Q03785 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.41□□□□□ -0.1
VHS1Q03785 SCR1SCR1 522 nt14.32□□□□□ -0.12
VHS1Q03785 SHR5YOL110W 714 nt14.1□□□□□ -0.15
VHS1Q03785 RRN5YLR141W 1092 nt14.03□□□□□ -0.16
VHS1Q03785 SSA3YBL075C 1950 nt14□□□□□ -0.17
VHS1Q03785 YDJ1YNL064C 1230 nt13.92□□□□□ -0.18
VHS1Q03785 DEP1YAL013W 1218 nt13.78□□□□□ -0.2
VHS1Q03785 URN1YPR152C 1398 nt13.77□□□□□ -0.21
VHS1Q03785 RSB1YOR049C 1065 nt13.76□□□□□ -0.21
VHS1Q03785 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.74□□□□□ -0.21
VHS1Q03785 GAR1YHR089C 618 nt13.68□□□□□ -0.22
VHS1Q03785 PUT4YOR348C 1884 nt13.67□□□□□ -0.22
VHS1Q03785 PST2YDR032C 597 nt13.59□□□□□ -0.23
VHS1Q03785 RPN10YHR200W 807 nt13.57□□□□□ -0.24
VHS1Q03785 OPI9YLR338W 858 nt13.55□□□□□ -0.24
VHS1Q03785 YNL208WYNL208W 600 nt13.53□□□□□ -0.24
VHS1Q03785 SAH1YER043C 1350 nt13.51□□□□□ -0.25
VHS1Q03785 ARE1YCR048W 1833 nt13.41□□□□□ -0.26
VHS1Q03785 POA1YBR022W 534 nt13.32□□□□□ -0.28
VHS1Q03785 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.28□□□□□ -0.28
VHS1Q03785 YKL097CYKL097C 411 nt13.23□□□□□ -0.29
VHS1Q03785 TIR1YER011W 765 nt13.2□□□□□ -0.3
VHS1Q03785 PUN1YLR414C 792 nt13.18□□□□□ -0.3
VHS1Q03785 YJR018WYJR018W 363 nt13.13□□□□□ -0.31
VHS1Q03785 PTC2YER089C 1395 nt13.05□□□□□ -0.32
VHS1Q03785 BUD23YCR047C 828 nt13.04□□□□□ -0.32
VHS1Q03785 SSA1YAL005C 1929 nt13.03□□□□□ -0.32
VHS1Q03785 BSC6YOL137W 1494 nt13□□□□□ -0.33
VHS1Q03785 SHU1YHL006C 453 nt12.93□□□□□ -0.34
VHS1Q03785 RPP2BYDR382W 333 nt12.89□□□□□ -0.35
VHS1Q03785 NAB2YGL122C 1578 nt12.87□□□□□ -0.35
VHS1Q03785 YJR120WYJR120W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
VHS1Q03785 SRB2YHR041C 633 nt12.75□□□□□ -0.37
VHS1Q03785 FPR4YLR449W 1179 nt12.74□□□□□ -0.37
VHS1Q03785 DAL1YIR027C 1383 nt12.69□□□□□ -0.38
VHS1Q03785 INM2YDR287W 879 nt12.68□□□□□ -0.38
VHS1Q03785 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.66□□□□□ -0.38
VHS1Q03785 YOR139CYOR139C 393 nt12.65□□□□□ -0.38
VHS1Q03785 WWM1YFL010C 636 nt12.61□□□□□ -0.39
VHS1Q03785 FIS1YIL065C 468 nt12.61□□□□□ -0.39
VHS1Q03785 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
VHS1Q03785 PHO4YFR034C 939 nt12.55□□□□□ -0.4
VHS1Q03785 YBL100CYBL100C 315 nt12.54□□□□□ -0.4
VHS1Q03785 YGR021WYGR021W 873 nt12.51□□□□□ -0.41
VHS1Q03785 NPL3YDR432W 1245 nt12.43□□□□□ -0.42
VHS1Q03785 HOM6YJR139C 1080 nt12.42□□□□□ -0.42
VHS1Q03785 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.39□□□□□ -0.43
VHS1Q03785 LSM3YLR438C-A 270 nt12.39□□□□□ -0.43
VHS1Q03785 TRM9YML014W 840 nt12.39□□□□□ -0.43
VHS1Q03785 FUN26YAL022C 1554 nt12.39□□□□□ -0.43
VHS1Q03785 MNP1YGL068W 585 nt12.37□□□□□ -0.43
VHS1Q03785 YPS1YLR120C 1710 nt12.31□□□□□ -0.44
VHS1Q03785 SPT5YML010W 3192 nt12.29□□□□□ -0.44
VHS1Q03785 ALF1YNL148C 765 nt12.28□□□□□ -0.44
VHS1Q03785 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.26□□□□□ -0.45
VHS1Q03785 RKM5YLR137W 1104 nt12.26□□□□□ -0.45
VHS1Q03785 SSA4YER103W 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
VHS1Q03785 YDR095CYDR095C 411 nt12.21□□□□□ -0.45
VHS1Q03785 YOL037CYOL037C 354 nt12.2□□□□□ -0.46
VHS1Q03785 MEP2YNL142W 1500 nt12.2□□□□□ -0.46
VHS1Q03785 CCT6YDR188W 1641 nt12.19□□□□□ -0.46
VHS1Q03785 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.16□□□□□ -0.46
VHS1Q03785 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.16□□□□□ -0.46
VHS1Q03785 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.13□□□□□ -0.47
VHS1Q03785 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.13□□□□□ -0.47
VHS1Q03785 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.13□□□□□ -0.47
VHS1Q03785 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.13□□□□□ -0.47
VHS1Q03785 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.13□□□□□ -0.47
VHS1Q03785 RPP2AYOL039W 321 nt12.03□□□□□ -0.48
VHS1Q03785 SIS1YNL007C 1059 nt12.01□□□□□ -0.49
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