Protein–RNA interactions for Protein: Q12114

CHS5, Chitin biosynthesis protein CHS5, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CHS5Q12114 NSR1YGR159C 1245 nt20.32■□□□□ 0.84
CHS5Q12114 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.2■□□□□ 0.82
CHS5Q12114 NOP1YDL014W 984 nt19.55■□□□□ 0.72
CHS5Q12114 MDJ1YFL016C 1536 nt18.25■□□□□ 0.51
CHS5Q12114 YKL036CYKL036C 393 nt17.84■□□□□ 0.45
CHS5Q12114 SRX1YKL086W 384 nt17.12■□□□□ 0.33
CHS5Q12114 Q0297Q0297 156 nt17.09■□□□□ 0.33
CHS5Q12114 YJL027CYJL027C 417 nt16.8■□□□□ 0.28
CHS5Q12114 YCR051WYCR051W 669 nt16.17■□□□□ 0.18
CHS5Q12114 SCS3YGL126W 1143 nt16.13■□□□□ 0.17
CHS5Q12114 DBP2YNL112W 1641 nt16.11■□□□□ 0.17
CHS5Q12114 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 YBR190WYBR190W 312 nt15.63■□□□□ 0.09
CHS5Q12114 SSA3YBL075C 1950 nt15.56■□□□□ 0.08
CHS5Q12114 YOL085CYOL085C 342 nt15.48■□□□□ 0.07
CHS5Q12114 CCC1YLR220W 969 nt15.4■□□□□ 0.06
CHS5Q12114 RPP1BYDL130W 321 nt15.32■□□□□ 0.04
CHS5Q12114 PKP1YIL042C 1185 nt15.24■□□□□ 0.03
CHS5Q12114 RTC3YHR087W 336 nt15.21■□□□□ 0.03
CHS5Q12114 RVS167YDR388W 1449 nt15□□□□□ -0.01
CHS5Q12114 SCJ1YMR214W 1134 nt14.95□□□□□ -0.02
CHS5Q12114 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.69□□□□□ -0.06
CHS5Q12114 PET122YER153C 765 nt14.66□□□□□ -0.06
CHS5Q12114 SHR5YOL110W 714 nt14.47□□□□□ -0.09
CHS5Q12114 PUT4YOR348C 1884 nt14.4□□□□□ -0.1
CHS5Q12114 SCR1SCR1 522 nt14.4□□□□□ -0.1
CHS5Q12114 ATS1YAL020C 1002 nt14.37□□□□□ -0.11
CHS5Q12114 YDJ1YNL064C 1230 nt14.23□□□□□ -0.13
CHS5Q12114 RRN5YLR141W 1092 nt14.21□□□□□ -0.13
CHS5Q12114 URN1YPR152C 1398 nt14.2□□□□□ -0.14
CHS5Q12114 DEP1YAL013W 1218 nt14.1□□□□□ -0.15
CHS5Q12114 ARE1YCR048W 1833 nt14.07□□□□□ -0.16
CHS5Q12114 OPI9YLR338W 858 nt14.06□□□□□ -0.16
CHS5Q12114 SAH1YER043C 1350 nt14.02□□□□□ -0.17
CHS5Q12114 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.94□□□□□ -0.18
CHS5Q12114 GAR1YHR089C 618 nt13.91□□□□□ -0.18
CHS5Q12114 RPN10YHR200W 807 nt13.9□□□□□ -0.18
CHS5Q12114 POA1YBR022W 534 nt13.89□□□□□ -0.19
CHS5Q12114 YNL208WYNL208W 600 nt13.87□□□□□ -0.19
CHS5Q12114 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.84□□□□□ -0.19
CHS5Q12114 RSB1YOR049C 1065 nt13.81□□□□□ -0.2
CHS5Q12114 BSC6YOL137W 1494 nt13.64□□□□□ -0.23
CHS5Q12114 PUN1YLR414C 792 nt13.63□□□□□ -0.23
CHS5Q12114 YJR018WYJR018W 363 nt13.53□□□□□ -0.24
CHS5Q12114 PTC2YER089C 1395 nt13.49□□□□□ -0.25
CHS5Q12114 BUD23YCR047C 828 nt13.47□□□□□ -0.25
CHS5Q12114 TIR1YER011W 765 nt13.47□□□□□ -0.25
CHS5Q12114 SSA4YER103W 1929 nt13.42□□□□□ -0.26
CHS5Q12114 SSA1YAL005C 1929 nt13.39□□□□□ -0.27
CHS5Q12114 PST2YDR032C 597 nt13.37□□□□□ -0.27
CHS5Q12114 NAB2YGL122C 1578 nt13.37□□□□□ -0.27
CHS5Q12114 YJR120WYJR120W 351 nt13.34□□□□□ -0.27
CHS5Q12114 SPT5YML010W 3192 nt13.32□□□□□ -0.28
CHS5Q12114 FIS1YIL065C 468 nt13.19□□□□□ -0.3
CHS5Q12114 RPP2BYDR382W 333 nt13.15□□□□□ -0.3
CHS5Q12114 SRB2YHR041C 633 nt13.15□□□□□ -0.3
CHS5Q12114 DAL1YIR027C 1383 nt13.15□□□□□ -0.3
CHS5Q12114 PAC11YDR488C 1602 nt13.1□□□□□ -0.31
CHS5Q12114 INM2YDR287W 879 nt13.08□□□□□ -0.32
CHS5Q12114 FPR4YLR449W 1179 nt13.05□□□□□ -0.32
CHS5Q12114 BDF1YLR399C 2061 nt13.04□□□□□ -0.32
CHS5Q12114 PHO4YFR034C 939 nt13.02□□□□□ -0.33
CHS5Q12114 BDH2YAL061W 1254 nt12.9□□□□□ -0.34
CHS5Q12114 YBL100CYBL100C 315 nt12.9□□□□□ -0.34
CHS5Q12114 YPS1YLR120C 1710 nt12.88□□□□□ -0.35
CHS5Q12114 SHU1YHL006C 453 nt12.87□□□□□ -0.35
CHS5Q12114 NVJ2YPR091C 2313 nt12.86□□□□□ -0.35
CHS5Q12114 MEP2YNL142W 1500 nt12.84□□□□□ -0.35
CHS5Q12114 WWM1YFL010C 636 nt12.84□□□□□ -0.35
CHS5Q12114 TAT1YBR069C 1860 nt12.83□□□□□ -0.36
CHS5Q12114 YDR095CYDR095C 411 nt12.76□□□□□ -0.37
CHS5Q12114 FUN26YAL022C 1554 nt12.76□□□□□ -0.37
CHS5Q12114 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.72□□□□□ -0.37
CHS5Q12114 LSM3YLR438C-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.69□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 YGR021WYGR021W 873 nt12.68□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 YKL097CYKL097C 411 nt12.67□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 HOM6YJR139C 1080 nt12.66□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 TRM9YML014W 840 nt12.66□□□□□ -0.38
CHS5Q12114 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.64□□□□□ -0.39
CHS5Q12114 DCW1YKL046C 1350 nt12.64□□□□□ -0.39
CHS5Q12114 CCT6YDR188W 1641 nt12.6□□□□□ -0.39
CHS5Q12114 ALF1YNL148C 765 nt12.58□□□□□ -0.4
CHS5Q12114 MNP1YGL068W 585 nt12.55□□□□□ -0.4
CHS5Q12114 PTP1YDL230W 1008 nt12.52□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 RPP2AYOL039W 321 nt12.5□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 RKM5YLR137W 1104 nt12.47□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 SIS1YNL007C 1059 nt12.47□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.46□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.46□□□□□ -0.41
CHS5Q12114 EMI2YDR516C 1503 nt12.46□□□□□ -0.42
CHS5Q12114 CAC2YML102W 1407 nt12.44□□□□□ -0.42
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