Protein–RNA interactions for Protein: P0CX35

RPS4A, 40S ribosomal protein S4-A, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS4AP0CX35 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.74■□□□□ 0.75
RPS4AP0CX35 NSR1YGR159C 1245 nt19.57■□□□□ 0.72
RPS4AP0CX35 NOP1YDL014W 984 nt19.17■□□□□ 0.66
RPS4AP0CX35 YKL036CYKL036C 393 nt17.76■□□□□ 0.43
RPS4AP0CX35 MDJ1YFL016C 1536 nt17.67■□□□□ 0.42
RPS4AP0CX35 Q0297Q0297 156 nt16.84■□□□□ 0.29
RPS4AP0CX35 SRX1YKL086W 384 nt16.79■□□□□ 0.28
RPS4AP0CX35 YJL027CYJL027C 417 nt16.58■□□□□ 0.24
RPS4AP0CX35 SCS3YGL126W 1143 nt16.22■□□□□ 0.19
RPS4AP0CX35 YCR051WYCR051W 669 nt15.92■□□□□ 0.14
RPS4AP0CX35 DBP2YNL112W 1641 nt15.46■□□□□ 0.07
RPS4AP0CX35 YOL085CYOL085C 342 nt15.41■□□□□ 0.06
RPS4AP0CX35 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 PKP1YIL042C 1185 nt15.17■□□□□ 0.02
RPS4AP0CX35 RPP1BYDL130W 321 nt15.11■□□□□ 0.01
RPS4AP0CX35 YBR190WYBR190W 312 nt15.07■□□□□ 0
RPS4AP0CX35 CCC1YLR220W 969 nt15□□□□□ -0.01
RPS4AP0CX35 RTC3YHR087W 336 nt14.78□□□□□ -0.04
RPS4AP0CX35 ATS1YAL020C 1002 nt14.51□□□□□ -0.09
RPS4AP0CX35 RVS167YDR388W 1449 nt14.49□□□□□ -0.09
RPS4AP0CX35 PET122YER153C 765 nt14.44□□□□□ -0.1
RPS4AP0CX35 SCJ1YMR214W 1134 nt14.44□□□□□ -0.1
RPS4AP0CX35 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.36□□□□□ -0.11
RPS4AP0CX35 SCR1SCR1 522 nt14.25□□□□□ -0.13
RPS4AP0CX35 RRN5YLR141W 1092 nt14.02□□□□□ -0.17
RPS4AP0CX35 SHR5YOL110W 714 nt13.96□□□□□ -0.17
RPS4AP0CX35 PUT4YOR348C 1884 nt13.9□□□□□ -0.18
RPS4AP0CX35 YDJ1YNL064C 1230 nt13.88□□□□□ -0.19
RPS4AP0CX35 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.76□□□□□ -0.21
RPS4AP0CX35 RSB1YOR049C 1065 nt13.73□□□□□ -0.21
RPS4AP0CX35 URN1YPR152C 1398 nt13.71□□□□□ -0.21
RPS4AP0CX35 DEP1YAL013W 1218 nt13.66□□□□□ -0.22
RPS4AP0CX35 SSA3YBL075C 1950 nt13.6□□□□□ -0.23
RPS4AP0CX35 ARE1YCR048W 1833 nt13.57□□□□□ -0.24
RPS4AP0CX35 SAH1YER043C 1350 nt13.57□□□□□ -0.24
RPS4AP0CX35 GAR1YHR089C 618 nt13.56□□□□□ -0.24
RPS4AP0CX35 OPI9YLR338W 858 nt13.55□□□□□ -0.24
RPS4AP0CX35 POA1YBR022W 534 nt13.47□□□□□ -0.25
RPS4AP0CX35 PST2YDR032C 597 nt13.45□□□□□ -0.26
RPS4AP0CX35 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.45□□□□□ -0.26
RPS4AP0CX35 RPN10YHR200W 807 nt13.44□□□□□ -0.26
RPS4AP0CX35 YNL208WYNL208W 600 nt13.36□□□□□ -0.27
RPS4AP0CX35 BSC6YOL137W 1494 nt13.23□□□□□ -0.29
RPS4AP0CX35 PUN1YLR414C 792 nt13.16□□□□□ -0.3
RPS4AP0CX35 BUD23YCR047C 828 nt13.13□□□□□ -0.31
RPS4AP0CX35 TIR1YER011W 765 nt13.11□□□□□ -0.31
RPS4AP0CX35 YJR018WYJR018W 363 nt13.06□□□□□ -0.32
RPS4AP0CX35 PTC2YER089C 1395 nt13.06□□□□□ -0.32
RPS4AP0CX35 SSA1YAL005C 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
RPS4AP0CX35 NAB2YGL122C 1578 nt12.9□□□□□ -0.34
RPS4AP0CX35 SHU1YHL006C 453 nt12.9□□□□□ -0.34
RPS4AP0CX35 YKL097CYKL097C 411 nt12.9□□□□□ -0.34
RPS4AP0CX35 SRB2YHR041C 633 nt12.82□□□□□ -0.36
RPS4AP0CX35 YJR120WYJR120W 351 nt12.81□□□□□ -0.36
RPS4AP0CX35 FIS1YIL065C 468 nt12.73□□□□□ -0.37
RPS4AP0CX35 RPP2BYDR382W 333 nt12.72□□□□□ -0.37
RPS4AP0CX35 SPT5YML010W 3192 nt12.71□□□□□ -0.37
RPS4AP0CX35 FPR4YLR449W 1179 nt12.71□□□□□ -0.37
RPS4AP0CX35 DAL1YIR027C 1383 nt12.69□□□□□ -0.38
RPS4AP0CX35 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.68□□□□□ -0.38
RPS4AP0CX35 PHO4YFR034C 939 nt12.6□□□□□ -0.39
RPS4AP0CX35 INM2YDR287W 879 nt12.59□□□□□ -0.39
RPS4AP0CX35 WWM1YFL010C 636 nt12.56□□□□□ -0.4
RPS4AP0CX35 Q0182Q0182 405 nt12.54□□□□□ -0.4
RPS4AP0CX35 YBL100CYBL100C 315 nt12.47□□□□□ -0.41
RPS4AP0CX35 YGR021WYGR021W 873 nt12.46□□□□□ -0.41
RPS4AP0CX35 HOM6YJR139C 1080 nt12.46□□□□□ -0.41
RPS4AP0CX35 SSA4YER103W 1929 nt12.45□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 BDH2YAL061W 1254 nt12.43□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 YOR139CYOR139C 393 nt12.43□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 MEP2YNL142W 1500 nt12.42□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 MNP1YGL068W 585 nt12.42□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 YPS1YLR120C 1710 nt12.42□□□□□ -0.42
RPS4AP0CX35 MOT3YMR070W 1473 nt12.36□□□□□ -0.43
RPS4AP0CX35 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.34□□□□□ -0.43
RPS4AP0CX35 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.33□□□□□ -0.44
RPS4AP0CX35 YDR095CYDR095C 411 nt12.31□□□□□ -0.44
RPS4AP0CX35 FUN26YAL022C 1554 nt12.3□□□□□ -0.44
RPS4AP0CX35 RKM5YLR137W 1104 nt12.27□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 LSM3YLR438C-A 270 nt12.27□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 NPL3YDR432W 1245 nt12.26□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 DCW1YKL046C 1350 nt12.26□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 TRM9YML014W 840 nt12.22□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 ALF1YNL148C 765 nt12.21□□□□□ -0.45
RPS4AP0CX35 YOL037CYOL037C 354 nt12.19□□□□□ -0.46
RPS4AP0CX35 CCT6YDR188W 1641 nt12.1□□□□□ -0.47
RPS4AP0CX35 EMI2YDR516C 1503 nt12.09□□□□□ -0.47
RPS4AP0CX35 RPP2AYOL039W 321 nt12.08□□□□□ -0.48
RPS4AP0CX35 PTP1YDL230W 1008 nt12.05□□□□□ -0.48
RPS4AP0CX35 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.03□□□□□ -0.48
RPS4AP0CX35 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.03□□□□□ -0.48
RPS4AP0CX35 CAC2YML102W 1407 nt12.02□□□□□ -0.49
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