Protein–RNA interactions for Protein: P41920

YRB1, Ran-specific GTPase-activating protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRB1P41920 NSR1YGR159C 1245 nt20.06■□□□□ 0.8
YRB1P41920 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.99■□□□□ 0.79
YRB1P41920 NOP1YDL014W 984 nt19.41■□□□□ 0.7
YRB1P41920 MDJ1YFL016C 1536 nt17.9■□□□□ 0.46
YRB1P41920 YKL036CYKL036C 393 nt17.77■□□□□ 0.44
YRB1P41920 Q0297Q0297 156 nt16.98■□□□□ 0.31
YRB1P41920 SRX1YKL086W 384 nt16.98■□□□□ 0.31
YRB1P41920 YJL027CYJL027C 417 nt16.54■□□□□ 0.24
YRB1P41920 SCS3YGL126W 1143 nt16.1■□□□□ 0.17
YRB1P41920 YCR051WYCR051W 669 nt16.02■□□□□ 0.16
YRB1P41920 DBP2YNL112W 1641 nt15.83■□□□□ 0.13
YRB1P41920 SSA3YBL075C 1950 nt15.7■□□□□ 0.1
YRB1P41920 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.46■□□□□ 0.07
YRB1P41920 YOL085CYOL085C 342 nt15.4■□□□□ 0.06
YRB1P41920 YBR190WYBR190W 312 nt15.35■□□□□ 0.05
YRB1P41920 RPP1BYDL130W 321 nt15.21■□□□□ 0.03
YRB1P41920 CCC1YLR220W 969 nt15.18■□□□□ 0.02
YRB1P41920 PKP1YIL042C 1185 nt15.11■□□□□ 0.01
YRB1P41920 RTC3YHR087W 336 nt14.91□□□□□ -0.02
YRB1P41920 RVS167YDR388W 1449 nt14.82□□□□□ -0.04
YRB1P41920 SCJ1YMR214W 1134 nt14.74□□□□□ -0.05
YRB1P41920 PET122YER153C 765 nt14.54□□□□□ -0.08
YRB1P41920 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.54□□□□□ -0.08
YRB1P41920 ATS1YAL020C 1002 nt14.36□□□□□ -0.11
YRB1P41920 SCR1SCR1 522 nt14.33□□□□□ -0.12
YRB1P41920 SHR5YOL110W 714 nt14.29□□□□□ -0.12
YRB1P41920 YDJ1YNL064C 1230 nt14.11□□□□□ -0.15
YRB1P41920 RRN5YLR141W 1092 nt14.08□□□□□ -0.16
YRB1P41920 PUT4YOR348C 1884 nt14.07□□□□□ -0.16
YRB1P41920 URN1YPR152C 1398 nt13.95□□□□□ -0.18
YRB1P41920 DEP1YAL013W 1218 nt13.85□□□□□ -0.19
YRB1P41920 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.82□□□□□ -0.2
YRB1P41920 OPI9YLR338W 858 nt13.81□□□□□ -0.2
YRB1P41920 ARE1YCR048W 1833 nt13.76□□□□□ -0.21
YRB1P41920 GAR1YHR089C 618 nt13.74□□□□□ -0.21
YRB1P41920 RPN10YHR200W 807 nt13.73□□□□□ -0.21
YRB1P41920 RSB1YOR049C 1065 nt13.73□□□□□ -0.21
YRB1P41920 SAH1YER043C 1350 nt13.71□□□□□ -0.21
YRB1P41920 YNL208WYNL208W 600 nt13.69□□□□□ -0.22
YRB1P41920 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.54□□□□□ -0.24
YRB1P41920 POA1YBR022W 534 nt13.54□□□□□ -0.24
YRB1P41920 SSA4YER103W 1929 nt13.44□□□□□ -0.26
YRB1P41920 PUN1YLR414C 792 nt13.41□□□□□ -0.26
YRB1P41920 SPT5YML010W 3192 nt13.35□□□□□ -0.27
YRB1P41920 PST2YDR032C 597 nt13.34□□□□□ -0.27
YRB1P41920 TIR1YER011W 765 nt13.32□□□□□ -0.28
YRB1P41920 BSC6YOL137W 1494 nt13.31□□□□□ -0.28
YRB1P41920 YJR018WYJR018W 363 nt13.3□□□□□ -0.28
YRB1P41920 PAC11YDR488C 1602 nt13.24□□□□□ -0.29
YRB1P41920 PTC2YER089C 1395 nt13.23□□□□□ -0.29
YRB1P41920 SSA1YAL005C 1929 nt13.19□□□□□ -0.3
YRB1P41920 BUD23YCR047C 828 nt13.17□□□□□ -0.3
YRB1P41920 YJR120WYJR120W 351 nt13.12□□□□□ -0.31
YRB1P41920 NAB2YGL122C 1578 nt13.11□□□□□ -0.31
YRB1P41920 BDF1YLR399C 2061 nt13.11□□□□□ -0.31
YRB1P41920 NVJ2YPR091C 2313 nt13.08□□□□□ -0.31
YRB1P41920 RPP2BYDR382W 333 nt12.99□□□□□ -0.33
YRB1P41920 SRB2YHR041C 633 nt12.95□□□□□ -0.34
YRB1P41920 FIS1YIL065C 468 nt12.95□□□□□ -0.34
YRB1P41920 DAL1YIR027C 1383 nt12.92□□□□□ -0.34
YRB1P41920 TAT1YBR069C 1860 nt12.89□□□□□ -0.35
YRB1P41920 INM2YDR287W 879 nt12.86□□□□□ -0.35
YRB1P41920 SHU1YHL006C 453 nt12.81□□□□□ -0.36
YRB1P41920 PHO4YFR034C 939 nt12.79□□□□□ -0.36
YRB1P41920 FPR4YLR449W 1179 nt12.78□□□□□ -0.36
YRB1P41920 BDH2YAL061W 1254 nt12.74□□□□□ -0.37
YRB1P41920 YKL097CYKL097C 411 nt12.7□□□□□ -0.38
YRB1P41920 YBL100CYBL100C 315 nt12.7□□□□□ -0.38
YRB1P41920 FPS1YLL043W 2010 nt12.69□□□□□ -0.38
YRB1P41920 WWM1YFL010C 636 nt12.68□□□□□ -0.38
YRB1P41920 YGR021WYGR021W 873 nt12.62□□□□□ -0.39
YRB1P41920 YPS1YLR120C 1710 nt12.61□□□□□ -0.39
YRB1P41920 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.59□□□□□ -0.39
YRB1P41920 HOM6YJR139C 1080 nt12.57□□□□□ -0.4
YRB1P41920 LSM3YLR438C-A 270 nt12.56□□□□□ -0.4
YRB1P41920 FUN26YAL022C 1554 nt12.56□□□□□ -0.4
YRB1P41920 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.54□□□□□ -0.4
YRB1P41920 MEP2YNL142W 1500 nt12.53□□□□□ -0.4
YRB1P41920 YDR095CYDR095C 411 nt12.52□□□□□ -0.41
YRB1P41920 TRM9YML014W 840 nt12.48□□□□□ -0.41
YRB1P41920 MNP1YGL068W 585 nt12.44□□□□□ -0.42
YRB1P41920 CCT6YDR188W 1641 nt12.43□□□□□ -0.42
YRB1P41920 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
YRB1P41920 RKM5YLR137W 1104 nt12.37□□□□□ -0.43
YRB1P41920 ALF1YNL148C 765 nt12.37□□□□□ -0.43
YRB1P41920 DCW1YKL046C 1350 nt12.3□□□□□ -0.44
YRB1P41920 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.3□□□□□ -0.44
YRB1P41920 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.3□□□□□ -0.44
YRB1P41920 RPP2AYOL039W 321 nt12.26□□□□□ -0.45
YRB1P41920 PTP1YDL230W 1008 nt12.25□□□□□ -0.45
YRB1P41920 SIS1YNL007C 1059 nt12.25□□□□□ -0.45
YRB1P41920 YOR139CYOR139C 393 nt12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.2 ms