Protein–RNA interactions for Protein: Q03648

YMR209C, Uncharacterized protein YMR209C, yeastyeast

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR209CQ03648 NSR1YGR159C 1245 nt20.37■□□□□ 0.85
YMR209CQ03648 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.28■□□□□ 0.84
YMR209CQ03648 NOP1YDL014W 984 nt19.56■□□□□ 0.72
YMR209CQ03648 MDJ1YFL016C 1536 nt18.39■□□□□ 0.54
YMR209CQ03648 YKL036CYKL036C 393 nt17.83■□□□□ 0.44
YMR209CQ03648 SRX1YKL086W 384 nt17.13■□□□□ 0.33
YMR209CQ03648 Q0297Q0297 156 nt17.08■□□□□ 0.32
YMR209CQ03648 YJL027CYJL027C 417 nt16.9■□□□□ 0.3
YMR209CQ03648 YCR051WYCR051W 669 nt16.21■□□□□ 0.19
YMR209CQ03648 DBP2YNL112W 1641 nt16.2■□□□□ 0.18
YMR209CQ03648 SCS3YGL126W 1143 nt16.12■□□□□ 0.17
YMR209CQ03648 YBR190WYBR190W 312 nt15.71■□□□□ 0.11
YMR209CQ03648 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.68■□□□□ 0.1
YMR209CQ03648 YOL085CYOL085C 342 nt15.49■□□□□ 0.07
YMR209CQ03648 CCC1YLR220W 969 nt15.48■□□□□ 0.07
YMR209CQ03648 RPP1BYDL130W 321 nt15.32■□□□□ 0.04
YMR209CQ03648 RTC3YHR087W 336 nt15.32■□□□□ 0.04
YMR209CQ03648 PKP1YIL042C 1185 nt15.29■□□□□ 0.04
YMR209CQ03648 RVS167YDR388W 1449 nt15.06■□□□□ 0
YMR209CQ03648 SCJ1YMR214W 1134 nt15.04■□□□□ -0
YMR209CQ03648 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.73□□□□□ -0.05
YMR209CQ03648 PET122YER153C 765 nt14.7□□□□□ -0.06
YMR209CQ03648 PUT4YOR348C 1884 nt14.53□□□□□ -0.08
YMR209CQ03648 SHR5YOL110W 714 nt14.51□□□□□ -0.09
YMR209CQ03648 SCR1SCR1 522 nt14.39□□□□□ -0.11
YMR209CQ03648 ATS1YAL020C 1002 nt14.34□□□□□ -0.11
YMR209CQ03648 URN1YPR152C 1398 nt14.28□□□□□ -0.12
YMR209CQ03648 RRN5YLR141W 1092 nt14.24□□□□□ -0.13
YMR209CQ03648 YDJ1YNL064C 1230 nt14.24□□□□□ -0.13
YMR209CQ03648 DEP1YAL013W 1218 nt14.21□□□□□ -0.13
YMR209CQ03648 SSA3YBL075C 1950 nt14.2□□□□□ -0.14
YMR209CQ03648 ARE1YCR048W 1833 nt14.19□□□□□ -0.14
YMR209CQ03648 OPI9YLR338W 858 nt14.13□□□□□ -0.15
YMR209CQ03648 SAH1YER043C 1350 nt14.12□□□□□ -0.15
YMR209CQ03648 POA1YBR022W 534 nt14.02□□□□□ -0.17
YMR209CQ03648 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.98□□□□□ -0.17
YMR209CQ03648 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.97□□□□□ -0.17
YMR209CQ03648 GAR1YHR089C 618 nt13.97□□□□□ -0.17
YMR209CQ03648 RPN10YHR200W 807 nt13.95□□□□□ -0.18
YMR209CQ03648 YNL208WYNL208W 600 nt13.93□□□□□ -0.18
YMR209CQ03648 RSB1YOR049C 1065 nt13.84□□□□□ -0.19
YMR209CQ03648 BSC6YOL137W 1494 nt13.79□□□□□ -0.2
YMR209CQ03648 PUN1YLR414C 792 nt13.69□□□□□ -0.22
YMR209CQ03648 PTC2YER089C 1395 nt13.6□□□□□ -0.23
YMR209CQ03648 BUD23YCR047C 828 nt13.6□□□□□ -0.23
YMR209CQ03648 YJR018WYJR018W 363 nt13.59□□□□□ -0.23
YMR209CQ03648 TIR1YER011W 765 nt13.51□□□□□ -0.25
YMR209CQ03648 SSA1YAL005C 1929 nt13.45□□□□□ -0.26
YMR209CQ03648 NAB2YGL122C 1578 nt13.44□□□□□ -0.26
YMR209CQ03648 YJR120WYJR120W 351 nt13.42□□□□□ -0.26
YMR209CQ03648 SPT5YML010W 3192 nt13.42□□□□□ -0.26
YMR209CQ03648 PST2YDR032C 597 nt13.34□□□□□ -0.27
YMR209CQ03648 FIS1YIL065C 468 nt13.28□□□□□ -0.28
YMR209CQ03648 SRB2YHR041C 633 nt13.24□□□□□ -0.29
YMR209CQ03648 DAL1YIR027C 1383 nt13.22□□□□□ -0.29
YMR209CQ03648 RPP2BYDR382W 333 nt13.2□□□□□ -0.3
YMR209CQ03648 FPR4YLR449W 1179 nt13.17□□□□□ -0.3
YMR209CQ03648 INM2YDR287W 879 nt13.12□□□□□ -0.31
YMR209CQ03648 PHO4YFR034C 939 nt13.11□□□□□ -0.31
YMR209CQ03648 SSA4YER103W 1929 nt12.99□□□□□ -0.33
YMR209CQ03648 YBL100CYBL100C 315 nt12.97□□□□□ -0.33
YMR209CQ03648 MEP2YNL142W 1500 nt12.96□□□□□ -0.33
YMR209CQ03648 YPS1YLR120C 1710 nt12.96□□□□□ -0.34
YMR209CQ03648 BDH2YAL061W 1254 nt12.94□□□□□ -0.34
YMR209CQ03648 WWM1YFL010C 636 nt12.89□□□□□ -0.35
YMR209CQ03648 SHU1YHL006C 453 nt12.87□□□□□ -0.35
YMR209CQ03648 YDR095CYDR095C 411 nt12.84□□□□□ -0.35
YMR209CQ03648 FUN26YAL022C 1554 nt12.83□□□□□ -0.36
YMR209CQ03648 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.8□□□□□ -0.36
YMR209CQ03648 DCW1YKL046C 1350 nt12.79□□□□□ -0.36
YMR209CQ03648 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.75□□□□□ -0.37
YMR209CQ03648 TRM9YML014W 840 nt12.71□□□□□ -0.37
YMR209CQ03648 LSM3YLR438C-A 270 nt12.7□□□□□ -0.38
YMR209CQ03648 YGR021WYGR021W 873 nt12.69□□□□□ -0.38
YMR209CQ03648 HOM6YJR139C 1080 nt12.68□□□□□ -0.38
YMR209CQ03648 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.66□□□□□ -0.38
YMR209CQ03648 ALF1YNL148C 765 nt12.65□□□□□ -0.38
YMR209CQ03648 CCT6YDR188W 1641 nt12.64□□□□□ -0.39
YMR209CQ03648 YKL097CYKL097C 411 nt12.63□□□□□ -0.39
YMR209CQ03648 PTP1YDL230W 1008 nt12.61□□□□□ -0.39
YMR209CQ03648 MNP1YGL068W 585 nt12.6□□□□□ -0.39
YMR209CQ03648 EMI2YDR516C 1503 nt12.58□□□□□ -0.4
YMR209CQ03648 RPP2AYOL039W 321 nt12.58□□□□□ -0.4
YMR209CQ03648 CAC2YML102W 1407 nt12.56□□□□□ -0.4
YMR209CQ03648 BDF1YLR399C 2061 nt12.55□□□□□ -0.4
YMR209CQ03648 SIS1YNL007C 1059 nt12.52□□□□□ -0.41
YMR209CQ03648 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YMR209CQ03648 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.5□□□□□ -0.41
YMR209CQ03648 RKM5YLR137W 1104 nt12.49□□□□□ -0.41
YMR209CQ03648 YDL221WYDL221W 552 nt12.47□□□□□ -0.41
YMR209CQ03648 YBR220CYBR220C 1683 nt12.45□□□□□ -0.42
YMR209CQ03648 YMR090WYMR090W 684 nt12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.1 ms