Protein–RNA interactions for Protein: Q12528

YLR111W, Uncharacterized protein YLR111W, yeastyeast

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLR111WQ12528 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.72■□□□□ 0.75
YLR111WQ12528 NSR1YGR159C 1245 nt19.53■□□□□ 0.72
YLR111WQ12528 NOP1YDL014W 984 nt19.19■□□□□ 0.66
YLR111WQ12528 YKL036CYKL036C 393 nt17.82■□□□□ 0.44
YLR111WQ12528 MDJ1YFL016C 1536 nt17.26■□□□□ 0.35
YLR111WQ12528 Q0297Q0297 156 nt16.87■□□□□ 0.29
YLR111WQ12528 SRX1YKL086W 384 nt16.8■□□□□ 0.28
YLR111WQ12528 YJL027CYJL027C 417 nt16.65■□□□□ 0.26
YLR111WQ12528 SCS3YGL126W 1143 nt16.28■□□□□ 0.2
YLR111WQ12528 YCR051WYCR051W 669 nt15.93■□□□□ 0.14
YLR111WQ12528 YOL085CYOL085C 342 nt15.46■□□□□ 0.07
YLR111WQ12528 DBP2YNL112W 1641 nt15.34■□□□□ 0.05
YLR111WQ12528 PKP1YIL042C 1185 nt15.21■□□□□ 0.03
YLR111WQ12528 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.14■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 RPP1BYDL130W 321 nt15.12■□□□□ 0.01
YLR111WQ12528 CCC1YLR220W 969 nt14.98□□□□□ -0.01
YLR111WQ12528 YBR190WYBR190W 312 nt14.67□□□□□ -0.06
YLR111WQ12528 ATS1YAL020C 1002 nt14.59□□□□□ -0.07
YLR111WQ12528 SCJ1YMR214W 1134 nt14.52□□□□□ -0.09
YLR111WQ12528 PET122YER153C 765 nt14.46□□□□□ -0.09
YLR111WQ12528 RVS167YDR388W 1449 nt14.37□□□□□ -0.11
YLR111WQ12528 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.36□□□□□ -0.11
YLR111WQ12528 RTC3YHR087W 336 nt14.34□□□□□ -0.11
YLR111WQ12528 SCR1SCR1 522 nt14.28□□□□□ -0.12
YLR111WQ12528 RRN5YLR141W 1092 nt14.06□□□□□ -0.16
YLR111WQ12528 SHR5YOL110W 714 nt13.92□□□□□ -0.18
YLR111WQ12528 YDJ1YNL064C 1230 nt13.89□□□□□ -0.19
YLR111WQ12528 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.78□□□□□ -0.2
YLR111WQ12528 RSB1YOR049C 1065 nt13.77□□□□□ -0.21
YLR111WQ12528 GAR1YHR089C 618 nt13.56□□□□□ -0.24
YLR111WQ12528 PST2YDR032C 597 nt13.51□□□□□ -0.25
YLR111WQ12528 DEP1YAL013W 1218 nt13.51□□□□□ -0.25
YLR111WQ12528 URN1YPR152C 1398 nt13.48□□□□□ -0.25
YLR111WQ12528 YNL208WYNL208W 600 nt13.29□□□□□ -0.28
YLR111WQ12528 PUT4YOR348C 1884 nt13.27□□□□□ -0.28
YLR111WQ12528 RPN10YHR200W 807 nt13.27□□□□□ -0.29
YLR111WQ12528 OPI9YLR338W 858 nt13.27□□□□□ -0.29
YLR111WQ12528 SAH1YER043C 1350 nt13.17□□□□□ -0.3
YLR111WQ12528 TIR1YER011W 765 nt13.1□□□□□ -0.31
YLR111WQ12528 ARE1YCR048W 1833 nt13.07□□□□□ -0.32
YLR111WQ12528 YKL097CYKL097C 411 nt13□□□□□ -0.33
YLR111WQ12528 SSA1YAL005C 1929 nt12.94□□□□□ -0.34
YLR111WQ12528 SHU1YHL006C 453 nt12.94□□□□□ -0.34
YLR111WQ12528 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.88□□□□□ -0.35
YLR111WQ12528 PUN1YLR414C 792 nt12.87□□□□□ -0.35
YLR111WQ12528 POA1YBR022W 534 nt12.87□□□□□ -0.35
YLR111WQ12528 YJR018WYJR018W 363 nt12.86□□□□□ -0.35
YLR111WQ12528 SRB2YHR041C 633 nt12.79□□□□□ -0.36
YLR111WQ12528 YJR120WYJR120W 351 nt12.74□□□□□ -0.37
YLR111WQ12528 PTC2YER089C 1395 nt12.71□□□□□ -0.37
YLR111WQ12528 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.71□□□□□ -0.37
YLR111WQ12528 RPP2BYDR382W 333 nt12.6□□□□□ -0.39
YLR111WQ12528 BUD23YCR047C 828 nt12.58□□□□□ -0.4
YLR111WQ12528 BSC6YOL137W 1494 nt12.57□□□□□ -0.4
YLR111WQ12528 WWM1YFL010C 636 nt12.55□□□□□ -0.4
YLR111WQ12528 NAB2YGL122C 1578 nt12.51□□□□□ -0.41
YLR111WQ12528 YOR139CYOR139C 393 nt12.5□□□□□ -0.41
YLR111WQ12528 YGR021WYGR021W 873 nt12.47□□□□□ -0.41
YLR111WQ12528 HOM6YJR139C 1080 nt12.47□□□□□ -0.41
YLR111WQ12528 MNP1YGL068W 585 nt12.43□□□□□ -0.42
YLR111WQ12528 SSA3YBL075C 1950 nt12.41□□□□□ -0.42
YLR111WQ12528 BDH2YAL061W 1254 nt12.4□□□□□ -0.42
YLR111WQ12528 INM2YDR287W 879 nt12.39□□□□□ -0.43
YLR111WQ12528 FIS1YIL065C 468 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR111WQ12528 DAL1YIR027C 1383 nt12.38□□□□□ -0.43
YLR111WQ12528 FPR4YLR449W 1179 nt12.34□□□□□ -0.43
YLR111WQ12528 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.33□□□□□ -0.44
YLR111WQ12528 NPL3YDR432W 1245 nt12.32□□□□□ -0.44
YLR111WQ12528 RKM5YLR137W 1104 nt12.28□□□□□ -0.44
YLR111WQ12528 YBL100CYBL100C 315 nt12.28□□□□□ -0.44
YLR111WQ12528 PHO4YFR034C 939 nt12.27□□□□□ -0.45
YLR111WQ12528 LSM3YLR438C-A 270 nt12.25□□□□□ -0.45
YLR111WQ12528 YOL037CYOL037C 354 nt12.23□□□□□ -0.45
YLR111WQ12528 FUN26YAL022C 1554 nt12.16□□□□□ -0.46
YLR111WQ12528 TRM9YML014W 840 nt12.13□□□□□ -0.47
YLR111WQ12528 CCT6YDR188W 1641 nt12.01□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 IMT4tM(CAU)E 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 IMT2tM(CAU)P 72 nt12□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 YPS1YLR120C 1710 nt11.99□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 YLR281CYLR281C 468 nt11.96□□□□□ -0.49
YLR111WQ12528 YDR095CYDR095C 411 nt11.95□□□□□ -0.5
YLR111WQ12528 ALF1YNL148C 765 nt11.93□□□□□ -0.5
YLR111WQ12528 SPT5YML010W 3192 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR111WQ12528 WHI5YOR083W 888 nt11.91□□□□□ -0.5
YLR111WQ12528 PUS2YGL063W 1113 nt11.87□□□□□ -0.51
YLR111WQ12528 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YLR111WQ12528 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.87□□□□□ -0.51
YLR111WQ12528 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.84□□□□□ -0.51
YLR111WQ12528 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.81□□□□□ -0.52
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