Protein–RNA interactions for Protein: Q12239

YOL107W, Transmembrane protein 115 homolog, yeastyeast

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOL107WQ12239 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.67■□□□□ 0.74
YOL107WQ12239 NSR1YGR159C 1245 nt19.4■□□□□ 0.7
YOL107WQ12239 NOP1YDL014W 984 nt19.18■□□□□ 0.66
YOL107WQ12239 YKL036CYKL036C 393 nt17.81■□□□□ 0.44
YOL107WQ12239 MDJ1YFL016C 1536 nt17.11■□□□□ 0.33
YOL107WQ12239 Q0297Q0297 156 nt16.81■□□□□ 0.28
YOL107WQ12239 SRX1YKL086W 384 nt16.74■□□□□ 0.27
YOL107WQ12239 YJL027CYJL027C 417 nt16.67■□□□□ 0.26
YOL107WQ12239 SCS3YGL126W 1143 nt16.27■□□□□ 0.2
YOL107WQ12239 YCR051WYCR051W 669 nt15.93■□□□□ 0.14
YOL107WQ12239 YOL085CYOL085C 342 nt15.42■□□□□ 0.06
YOL107WQ12239 PKP1YIL042C 1185 nt15.19■□□□□ 0.02
YOL107WQ12239 DBP2YNL112W 1641 nt15.16■□□□□ 0.02
YOL107WQ12239 RPP1BYDL130W 321 nt15.09■□□□□ 0.01
YOL107WQ12239 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.03■□□□□ -0
YOL107WQ12239 CCC1YLR220W 969 nt14.95□□□□□ -0.02
YOL107WQ12239 ATS1YAL020C 1002 nt14.6□□□□□ -0.07
YOL107WQ12239 SCJ1YMR214W 1134 nt14.56□□□□□ -0.08
YOL107WQ12239 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
YOL107WQ12239 PET122YER153C 765 nt14.4□□□□□ -0.1
YOL107WQ12239 RVS167YDR388W 1449 nt14.33□□□□□ -0.11
YOL107WQ12239 SCR1SCR1 522 nt14.31□□□□□ -0.12
YOL107WQ12239 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.29□□□□□ -0.12
YOL107WQ12239 RTC3YHR087W 336 nt14.28□□□□□ -0.12
YOL107WQ12239 SSA3YBL075C 1950 nt14.11□□□□□ -0.15
YOL107WQ12239 RRN5YLR141W 1092 nt14.01□□□□□ -0.17
YOL107WQ12239 SHR5YOL110W 714 nt13.84□□□□□ -0.19
YOL107WQ12239 YDJ1YNL064C 1230 nt13.81□□□□□ -0.2
YOL107WQ12239 RSB1YOR049C 1065 nt13.78□□□□□ -0.2
YOL107WQ12239 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.73□□□□□ -0.21
YOL107WQ12239 GAR1YHR089C 618 nt13.51□□□□□ -0.25
YOL107WQ12239 PST2YDR032C 597 nt13.48□□□□□ -0.25
YOL107WQ12239 DEP1YAL013W 1218 nt13.44□□□□□ -0.26
YOL107WQ12239 URN1YPR152C 1398 nt13.38□□□□□ -0.27
YOL107WQ12239 RPN10YHR200W 807 nt13.24□□□□□ -0.29
YOL107WQ12239 YNL208WYNL208W 600 nt13.22□□□□□ -0.29
YOL107WQ12239 OPI9YLR338W 858 nt13.15□□□□□ -0.3
YOL107WQ12239 PUT4YOR348C 1884 nt13.06□□□□□ -0.32
YOL107WQ12239 TIR1YER011W 765 nt13.04□□□□□ -0.32
YOL107WQ12239 YKL097CYKL097C 411 nt13.04□□□□□ -0.32
YOL107WQ12239 SAH1YER043C 1350 nt13.04□□□□□ -0.32
YOL107WQ12239 SHU1YHL006C 453 nt12.91□□□□□ -0.34
YOL107WQ12239 ARE1YCR048W 1833 nt12.88□□□□□ -0.35
YOL107WQ12239 SSA1YAL005C 1929 nt12.84□□□□□ -0.35
YOL107WQ12239 YJR018WYJR018W 363 nt12.78□□□□□ -0.36
YOL107WQ12239 PUN1YLR414C 792 nt12.78□□□□□ -0.36
YOL107WQ12239 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.74□□□□□ -0.37
YOL107WQ12239 POA1YBR022W 534 nt12.71□□□□□ -0.37
YOL107WQ12239 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.7□□□□□ -0.38
YOL107WQ12239 SRB2YHR041C 633 nt12.62□□□□□ -0.39
YOL107WQ12239 PTC2YER089C 1395 nt12.6□□□□□ -0.39
YOL107WQ12239 RPP2BYDR382W 333 nt12.58□□□□□ -0.4
YOL107WQ12239 YJR120WYJR120W 351 nt12.57□□□□□ -0.4
YOL107WQ12239 BUD23YCR047C 828 nt12.5□□□□□ -0.41
YOL107WQ12239 WWM1YFL010C 636 nt12.5□□□□□ -0.41
YOL107WQ12239 YOR139CYOR139C 393 nt12.47□□□□□ -0.41
YOL107WQ12239 YGR021WYGR021W 873 nt12.46□□□□□ -0.41
YOL107WQ12239 NAB2YGL122C 1578 nt12.41□□□□□ -0.42
YOL107WQ12239 HOM6YJR139C 1080 nt12.4□□□□□ -0.42
YOL107WQ12239 BSC6YOL137W 1494 nt12.4□□□□□ -0.43
YOL107WQ12239 NPL3YDR432W 1245 nt12.38□□□□□ -0.43
YOL107WQ12239 MNP1YGL068W 585 nt12.38□□□□□ -0.43
YOL107WQ12239 BDH2YAL061W 1254 nt12.32□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 INM2YDR287W 879 nt12.31□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 SSA4YER103W 1929 nt12.3□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 FPR4YLR449W 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.28□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 DAL1YIR027C 1383 nt12.28□□□□□ -0.44
YOL107WQ12239 RKM5YLR137W 1104 nt12.23□□□□□ -0.45
YOL107WQ12239 SPT5YML010W 3192 nt12.22□□□□□ -0.45
YOL107WQ12239 FIS1YIL065C 468 nt12.22□□□□□ -0.45
YOL107WQ12239 YBL100CYBL100C 315 nt12.22□□□□□ -0.45
YOL107WQ12239 YOL037CYOL037C 354 nt12.22□□□□□ -0.45
YOL107WQ12239 LSM3YLR438C-A 270 nt12.19□□□□□ -0.46
YOL107WQ12239 PHO4YFR034C 939 nt12.15□□□□□ -0.46
YOL107WQ12239 TRM9YML014W 840 nt12.1□□□□□ -0.47
YOL107WQ12239 FUN26YAL022C 1554 nt12.07□□□□□ -0.48
YOL107WQ12239 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YOL107WQ12239 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YOL107WQ12239 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YOL107WQ12239 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YOL107WQ12239 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.99□□□□□ -0.49
YOL107WQ12239 YLR281CYLR281C 468 nt11.93□□□□□ -0.5
YOL107WQ12239 CCT6YDR188W 1641 nt11.93□□□□□ -0.5
YOL107WQ12239 PUS2YGL063W 1113 nt11.89□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 ALF1YNL148C 765 nt11.89□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 BDF1YLR399C 2061 nt11.88□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 WHI5YOR083W 888 nt11.88□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 YPS1YLR120C 1710 nt11.85□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.84□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.84□□□□□ -0.51
YOL107WQ12239 PAC11YDR488C 1602 nt11.82□□□□□ -0.52
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