RNA–Protein interactions for RNA: YJR143C

PMT4, Transcript of Protein O-mannosyltransferase, yeast

Gene PMT4, Length 2,289 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PMT4	YJR143C	CAB2	P40506	365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	INN1	P53901	409 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ECM18	Q04623	453 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ASM4	Q05166	528 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RIM20	Q12033	661 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	GPR1	Q12361	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	NTG1	P31378	399 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SFA1	P32771	386 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	THI2	P38141	450 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YBL028C	P38202	106 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RRT14	P40470	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YJL171C	P46992	396 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	UBP15	P50101	1230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	LCL3	P53153	274 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ADY4	Q05955	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	PCL8	Q08966	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	VCX1	Q99385	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ARG82	P07250	355 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	AFT1	P22149	690 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	DMC1	P25453	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	LRG1	P35688	1017 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	UBP11	P36026	717 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ALY1	P36117	915 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	PEX32	P38292	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	JHD1	P40034	492 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	GSM1	P42950	618 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	AAD10	P47182	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	HED1	Q03937	162 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SOV1	Q04748	898 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YLL054C	Q12244	843 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ERS1	P17261	260 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SRB2	P34162	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YHR033W	P38690	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	DOT5	P40553	215 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YIR007W	P40566	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	EXG2	P52911	562 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	VPS4	P52917	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TAM41	P53230	385 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	THI22	Q06490	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	HOS1	Q12214	470 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CTF3	Q12748	733 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CCL1	P37366	393 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	VID24	P38263	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CCT6	P39079	546 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YDL183C	P48569	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	MSC3	Q05812	728 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	PEX19	Q07418	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	UPC2	Q12151	913 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	AVL9	Q12500	764 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SPC110	P32380	944 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YPT7	P32939	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	GEX2	P36173	615 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CLA4	P48562	842 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TAF4	P50105	388 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	NCS6	P53088	359 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	MUB1	Q03162	620 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	STP3	Q05937	343 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	TMA16	Q08687	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	UAF30	Q08747	228 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	VPS54	Q12071	889 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SWT1	Q12104	458 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SPS22	P25380	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CDS1	P38221	457 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	REG2	P38232	338 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	MMS4	P38257	691 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	GID8	P40208	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	LRO1	P40345	661 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CHS6	P40955	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	BUD7	Q08754	746 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	UBX3	Q12229	455 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YPT6	Q99260	215 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	BUD5	P25300	642 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	YSC84	P32793	468 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	MRP4	P32902	394 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PMT4	YJR143C	SEF1	P34228	1148 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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