Protein–RNA interactions for Protein: P25300

BUD5, Bud site selection protein 5, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD5P25300 NSR1YGR159C 1245 nt18.72■□□□□ 0.59
BUD5P25300 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.5■□□□□ 0.55
BUD5P25300 NOP1YDL014W 984 nt17.9■□□□□ 0.46
BUD5P25300 MDJ1YFL016C 1536 nt16.89■□□□□ 0.29
BUD5P25300 YKL036CYKL036C 393 nt16.16■□□□□ 0.18
BUD5P25300 SRX1YKL086W 384 nt15.61■□□□□ 0.09
BUD5P25300 YJL027CYJL027C 417 nt15.6■□□□□ 0.09
BUD5P25300 Q0297Q0297 156 nt15.54■□□□□ 0.08
BUD5P25300 DBP2YNL112W 1641 nt14.81□□□□□ -0.04
BUD5P25300 YCR051WYCR051W 669 nt14.75□□□□□ -0.05
BUD5P25300 YBR190WYBR190W 312 nt14.55□□□□□ -0.08
BUD5P25300 SCS3YGL126W 1143 nt14.5□□□□□ -0.09
BUD5P25300 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.32□□□□□ -0.12
BUD5P25300 RTC3YHR087W 336 nt14.17□□□□□ -0.14
BUD5P25300 CCC1YLR220W 969 nt14.11□□□□□ -0.15
BUD5P25300 YOL085CYOL085C 342 nt13.98□□□□□ -0.17
BUD5P25300 RPP1BYDL130W 321 nt13.94□□□□□ -0.18
BUD5P25300 RVS167YDR388W 1449 nt13.91□□□□□ -0.18
BUD5P25300 PKP1YIL042C 1185 nt13.77□□□□□ -0.21
BUD5P25300 SCJ1YMR214W 1134 nt13.71□□□□□ -0.21
BUD5P25300 PUT4YOR348C 1884 nt13.44□□□□□ -0.26
BUD5P25300 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.41□□□□□ -0.26
BUD5P25300 SSA3YBL075C 1950 nt13.36□□□□□ -0.27
BUD5P25300 SHR5YOL110W 714 nt13.33□□□□□ -0.28
BUD5P25300 PET122YER153C 765 nt13.32□□□□□ -0.28
BUD5P25300 URN1YPR152C 1398 nt13.14□□□□□ -0.31
BUD5P25300 SCR1SCR1 522 nt13.13□□□□□ -0.31
BUD5P25300 ARE1YCR048W 1833 nt13.09□□□□□ -0.31
BUD5P25300 OPI9YLR338W 858 nt13.05□□□□□ -0.32
BUD5P25300 YDJ1YNL064C 1230 nt13.02□□□□□ -0.33
BUD5P25300 SAH1YER043C 1350 nt13.01□□□□□ -0.33
BUD5P25300 DEP1YAL013W 1218 nt13□□□□□ -0.33
BUD5P25300 POA1YBR022W 534 nt12.96□□□□□ -0.33
BUD5P25300 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.93□□□□□ -0.34
BUD5P25300 RPN10YHR200W 807 nt12.93□□□□□ -0.34
BUD5P25300 RRN5YLR141W 1092 nt12.89□□□□□ -0.35
BUD5P25300 ATS1YAL020C 1002 nt12.88□□□□□ -0.35
BUD5P25300 YNL208WYNL208W 600 nt12.82□□□□□ -0.36
BUD5P25300 BSC6YOL137W 1494 nt12.78□□□□□ -0.36
BUD5P25300 GAR1YHR089C 618 nt12.72□□□□□ -0.37
BUD5P25300 PUN1YLR414C 792 nt12.69□□□□□ -0.38
BUD5P25300 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.65□□□□□ -0.38
BUD5P25300 BUD23YCR047C 828 nt12.59□□□□□ -0.39
BUD5P25300 RSB1YOR049C 1065 nt12.54□□□□□ -0.4
BUD5P25300 PTC2YER089C 1395 nt12.54□□□□□ -0.4
BUD5P25300 YJR018WYJR018W 363 nt12.53□□□□□ -0.4
BUD5P25300 NAB2YGL122C 1578 nt12.46□□□□□ -0.42
BUD5P25300 SPT5YML010W 3192 nt12.43□□□□□ -0.42
BUD5P25300 TIR1YER011W 765 nt12.34□□□□□ -0.43
BUD5P25300 FIS1YIL065C 468 nt12.24□□□□□ -0.45
BUD5P25300 SSA1YAL005C 1929 nt12.23□□□□□ -0.45
BUD5P25300 DAL1YIR027C 1383 nt12.23□□□□□ -0.45
BUD5P25300 YJR120WYJR120W 351 nt12.23□□□□□ -0.45
BUD5P25300 RPP2BYDR382W 333 nt12.21□□□□□ -0.45
BUD5P25300 INM2YDR287W 879 nt12.15□□□□□ -0.46
BUD5P25300 SSA4YER103W 1929 nt12.15□□□□□ -0.46
BUD5P25300 FPR4YLR449W 1179 nt12.14□□□□□ -0.47
BUD5P25300 PHO4YFR034C 939 nt12.1□□□□□ -0.47
BUD5P25300 Q0182Q0182 405 nt12.07□□□□□ -0.48
BUD5P25300 MEP2YNL142W 1500 nt12.05□□□□□ -0.48
BUD5P25300 PST2YDR032C 597 nt11.99□□□□□ -0.49
BUD5P25300 YPS1YLR120C 1710 nt11.99□□□□□ -0.49
BUD5P25300 YBL100CYBL100C 315 nt11.96□□□□□ -0.49
BUD5P25300 SRB2YHR041C 633 nt11.92□□□□□ -0.5
BUD5P25300 BDH2YAL061W 1254 nt11.89□□□□□ -0.51
BUD5P25300 YDR095CYDR095C 411 nt11.87□□□□□ -0.51
BUD5P25300 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.87□□□□□ -0.51
BUD5P25300 DCW1YKL046C 1350 nt11.8□□□□□ -0.52
BUD5P25300 FUN26YAL022C 1554 nt11.79□□□□□ -0.52
BUD5P25300 TRM9YML014W 840 nt11.72□□□□□ -0.53
BUD5P25300 WWM1YFL010C 636 nt11.71□□□□□ -0.53
BUD5P25300 ALF1YNL148C 765 nt11.71□□□□□ -0.53
BUD5P25300 BDF1YLR399C 2061 nt11.71□□□□□ -0.54
BUD5P25300 LSM3YLR438C-A 270 nt11.7□□□□□ -0.54
BUD5P25300 YMR090WYMR090W 684 nt11.68□□□□□ -0.54
BUD5P25300 EMI2YDR516C 1503 nt11.68□□□□□ -0.54
BUD5P25300 RPP2AYOL039W 321 nt11.64□□□□□ -0.55
BUD5P25300 CCT6YDR188W 1641 nt11.64□□□□□ -0.55
BUD5P25300 YGR021WYGR021W 873 nt11.62□□□□□ -0.55
BUD5P25300 PTP1YDL230W 1008 nt11.6□□□□□ -0.55
BUD5P25300 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.59□□□□□ -0.55
BUD5P25300 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.59□□□□□ -0.55
BUD5P25300 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.59□□□□□ -0.55
BUD5P25300 YDL221WYDL221W 552 nt11.58□□□□□ -0.56
BUD5P25300 YBR220CYBR220C 1683 nt11.57□□□□□ -0.56
BUD5P25300 TAT1YBR069C 1860 nt11.57□□□□□ -0.56
BUD5P25300 SHU1YHL006C 453 nt11.56□□□□□ -0.56
BUD5P25300 CAC2YML102W 1407 nt11.55□□□□□ -0.56
BUD5P25300 SIS1YNL007C 1059 nt11.54□□□□□ -0.56
BUD5P25300 HOM6YJR139C 1080 nt11.51□□□□□ -0.57
BUD5P25300 SDH1YKL148C 1923 nt11.5□□□□□ -0.57
BUD5P25300 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.5 ms