Protein–RNA interactions for Protein: P36026

UBP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, yeastyeast

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Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBP11P36026 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.92■■□□□ 1.26
UBP11P36026 NSR1YGR159C 1245 nt22.57■■□□□ 1.2
UBP11P36026 NOP1YDL014W 984 nt22.26■■□□□ 1.15
UBP11P36026 YKL036CYKL036C 393 nt20.78■□□□□ 0.92
UBP11P36026 MDJ1YFL016C 1536 nt19.97■□□□□ 0.79
UBP11P36026 Q0297Q0297 156 nt19.61■□□□□ 0.73
UBP11P36026 SRX1YKL086W 384 nt19.52■□□□□ 0.72
UBP11P36026 YJL027CYJL027C 417 nt19.44■□□□□ 0.7
UBP11P36026 SCS3YGL126W 1143 nt19.05■□□□□ 0.64
UBP11P36026 YCR051WYCR051W 669 nt18.57■□□□□ 0.56
UBP11P36026 YOL085CYOL085C 342 nt18.04■□□□□ 0.48
UBP11P36026 PKP1YIL042C 1185 nt17.81■□□□□ 0.44
UBP11P36026 DBP2YNL112W 1641 nt17.76■□□□□ 0.43
UBP11P36026 RPP1BYDL130W 321 nt17.6■□□□□ 0.41
UBP11P36026 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.55■□□□□ 0.4
UBP11P36026 CCC1YLR220W 969 nt17.44■□□□□ 0.38
UBP11P36026 ATS1YAL020C 1002 nt17.08■□□□□ 0.32
UBP11P36026 SCJ1YMR214W 1134 nt17■□□□□ 0.31
UBP11P36026 YBR190WYBR190W 312 nt16.89■□□□□ 0.29
UBP11P36026 PET122YER153C 765 nt16.85■□□□□ 0.29
UBP11P36026 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.68■□□□□ 0.26
UBP11P36026 SCR1SCR1 522 nt16.61■□□□□ 0.25
UBP11P36026 RVS167YDR388W 1449 nt16.58■□□□□ 0.24
UBP11P36026 RTC3YHR087W 336 nt16.56■□□□□ 0.24
UBP11P36026 RRN5YLR141W 1092 nt16.39■□□□□ 0.21
UBP11P36026 SHR5YOL110W 714 nt16.1■□□□□ 0.17
UBP11P36026 YDJ1YNL064C 1230 nt16.09■□□□□ 0.17
UBP11P36026 RSB1YOR049C 1065 nt16.07■□□□□ 0.16
UBP11P36026 YER088W-BYER088W-B 147 nt16.06■□□□□ 0.16
UBP11P36026 PST2YDR032C 597 nt15.81■□□□□ 0.12
UBP11P36026 GAR1YHR089C 618 nt15.77■□□□□ 0.12
UBP11P36026 DEP1YAL013W 1218 nt15.69■□□□□ 0.1
UBP11P36026 URN1YPR152C 1398 nt15.59■□□□□ 0.09
UBP11P36026 YNL208WYNL208W 600 nt15.35■□□□□ 0.05
UBP11P36026 OPI9YLR338W 858 nt15.3■□□□□ 0.04
UBP11P36026 RPN10YHR200W 807 nt15.29■□□□□ 0.04
UBP11P36026 PUT4YOR348C 1884 nt15.25■□□□□ 0.03
UBP11P36026 YKL097CYKL097C 411 nt15.23■□□□□ 0.03
UBP11P36026 SAH1YER043C 1350 nt15.22■□□□□ 0.03
UBP11P36026 TIR1YER011W 765 nt15.21■□□□□ 0.03
UBP11P36026 SHU1YHL006C 453 nt15.15■□□□□ 0.02
UBP11P36026 ARE1YCR048W 1833 nt15.04■□□□□ -0
UBP11P36026 SSA1YAL005C 1929 nt15.04■□□□□ -0
UBP11P36026 SRB2YHR041C 633 nt14.92□□□□□ -0.02
UBP11P36026 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.92□□□□□ -0.02
UBP11P36026 YJR018WYJR018W 363 nt14.87□□□□□ -0.03
UBP11P36026 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt14.83□□□□□ -0.04
UBP11P36026 POA1YBR022W 534 nt14.82□□□□□ -0.04
UBP11P36026 PUN1YLR414C 792 nt14.8□□□□□ -0.04
UBP11P36026 YJR120WYJR120W 351 nt14.77□□□□□ -0.05
UBP11P36026 YOR139CYOR139C 393 nt14.68□□□□□ -0.06
UBP11P36026 PTC2YER089C 1395 nt14.67□□□□□ -0.06
UBP11P36026 WWM1YFL010C 636 nt14.63□□□□□ -0.07
UBP11P36026 RPP2BYDR382W 333 nt14.54□□□□□ -0.08
UBP11P36026 BUD23YCR047C 828 nt14.52□□□□□ -0.09
UBP11P36026 MNP1YGL068W 585 nt14.52□□□□□ -0.09
UBP11P36026 HOM6YJR139C 1080 nt14.51□□□□□ -0.09
UBP11P36026 YGR021WYGR021W 873 nt14.46□□□□□ -0.09
UBP11P36026 BSC6YOL137W 1494 nt14.44□□□□□ -0.1
UBP11P36026 SSA3YBL075C 1950 nt14.42□□□□□ -0.1
UBP11P36026 NPL3YDR432W 1245 nt14.41□□□□□ -0.1
UBP11P36026 NAB2YGL122C 1578 nt14.39□□□□□ -0.11
UBP11P36026 BDH2YAL061W 1254 nt14.33□□□□□ -0.12
UBP11P36026 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt14.29□□□□□ -0.12
UBP11P36026 RKM5YLR137W 1104 nt14.28□□□□□ -0.12
UBP11P36026 INM2YDR287W 879 nt14.27□□□□□ -0.13
UBP11P36026 FPR4YLR449W 1179 nt14.27□□□□□ -0.13
UBP11P36026 FIS1YIL065C 468 nt14.26□□□□□ -0.13
UBP11P36026 DAL1YIR027C 1383 nt14.25□□□□□ -0.13
UBP11P36026 YOL037CYOL037C 354 nt14.22□□□□□ -0.13
UBP11P36026 YBL100CYBL100C 315 nt14.19□□□□□ -0.14
UBP11P36026 LSM3YLR438C-A 270 nt14.15□□□□□ -0.14
UBP11P36026 PHO4YFR034C 939 nt14.14□□□□□ -0.15
UBP11P36026 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.08□□□□□ -0.16
UBP11P36026 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.08□□□□□ -0.16
UBP11P36026 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.08□□□□□ -0.16
UBP11P36026 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.08□□□□□ -0.16
UBP11P36026 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.08□□□□□ -0.16
UBP11P36026 FUN26YAL022C 1554 nt14.05□□□□□ -0.16
UBP11P36026 TRM9YML014W 840 nt14.03□□□□□ -0.16
UBP11P36026 YLR281CYLR281C 468 nt13.95□□□□□ -0.18
UBP11P36026 PUS2YGL063W 1113 nt13.9□□□□□ -0.18
UBP11P36026 WHI5YOR083W 888 nt13.9□□□□□ -0.18
UBP11P36026 CCT6YDR188W 1641 nt13.87□□□□□ -0.19
UBP11P36026 YPS1YLR120C 1710 nt13.79□□□□□ -0.2
UBP11P36026 ALF1YNL148C 765 nt13.76□□□□□ -0.21
UBP11P36026 YDR095CYDR095C 411 nt13.74□□□□□ -0.21
UBP11P36026 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt13.72□□□□□ -0.21
UBP11P36026 YPR011CYPR011C 981 nt13.72□□□□□ -0.21
UBP11P36026 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.68□□□□□ -0.22
UBP11P36026 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.68□□□□□ -0.22
UBP11P36026 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.62□□□□□ -0.23
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