Protein–RNA interactions for Protein: Q08747

UAF30, Upstream activation factor subunit UAF30, yeastyeast

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UAF30Q08747 NSR1YGR159C 1245 nt19.77■□□□□ 0.76
UAF30Q08747 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.67■□□□□ 0.74
UAF30Q08747 NOP1YDL014W 984 nt19.03■□□□□ 0.64
UAF30Q08747 MDJ1YFL016C 1536 nt17.78■□□□□ 0.44
UAF30Q08747 YKL036CYKL036C 393 nt17.29■□□□□ 0.36
UAF30Q08747 SRX1YKL086W 384 nt16.6■□□□□ 0.25
UAF30Q08747 Q0297Q0297 156 nt16.51■□□□□ 0.23
UAF30Q08747 YJL027CYJL027C 417 nt16.44■□□□□ 0.22
UAF30Q08747 YCR051WYCR051W 669 nt15.76■□□□□ 0.11
UAF30Q08747 DBP2YNL112W 1641 nt15.58■□□□□ 0.09
UAF30Q08747 SCS3YGL126W 1143 nt15.55■□□□□ 0.08
UAF30Q08747 YBR190WYBR190W 312 nt15.26■□□□□ 0.03
UAF30Q08747 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.15■□□□□ 0.02
UAF30Q08747 CCC1YLR220W 969 nt15.04■□□□□ -0
UAF30Q08747 RTC3YHR087W 336 nt14.95□□□□□ -0.02
UAF30Q08747 YOL085CYOL085C 342 nt14.95□□□□□ -0.02
UAF30Q08747 RPP1BYDL130W 321 nt14.83□□□□□ -0.04
UAF30Q08747 PKP1YIL042C 1185 nt14.77□□□□□ -0.05
UAF30Q08747 RVS167YDR388W 1449 nt14.7□□□□□ -0.06
UAF30Q08747 SCJ1YMR214W 1134 nt14.47□□□□□ -0.09
UAF30Q08747 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt14.26□□□□□ -0.13
UAF30Q08747 PET122YER153C 765 nt14.19□□□□□ -0.14
UAF30Q08747 SHR5YOL110W 714 nt14.08□□□□□ -0.16
UAF30Q08747 SCR1SCR1 522 nt14.03□□□□□ -0.16
UAF30Q08747 PUT4YOR348C 1884 nt14.01□□□□□ -0.17
UAF30Q08747 URN1YPR152C 1398 nt13.86□□□□□ -0.19
UAF30Q08747 ATS1YAL020C 1002 nt13.84□□□□□ -0.19
UAF30Q08747 YDJ1YNL064C 1230 nt13.79□□□□□ -0.2
UAF30Q08747 DEP1YAL013W 1218 nt13.78□□□□□ -0.2
UAF30Q08747 RRN5YLR141W 1092 nt13.77□□□□□ -0.21
UAF30Q08747 OPI9YLR338W 858 nt13.7□□□□□ -0.22
UAF30Q08747 SSA3YBL075C 1950 nt13.68□□□□□ -0.22
UAF30Q08747 ARE1YCR048W 1833 nt13.68□□□□□ -0.22
UAF30Q08747 SAH1YER043C 1350 nt13.68□□□□□ -0.22
UAF30Q08747 RPN10YHR200W 807 nt13.64□□□□□ -0.23
UAF30Q08747 POA1YBR022W 534 nt13.59□□□□□ -0.23
UAF30Q08747 GAR1YHR089C 618 nt13.55□□□□□ -0.24
UAF30Q08747 YNL208WYNL208W 600 nt13.55□□□□□ -0.24
UAF30Q08747 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.54□□□□□ -0.24
UAF30Q08747 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.48□□□□□ -0.25
UAF30Q08747 RSB1YOR049C 1065 nt13.43□□□□□ -0.26
UAF30Q08747 BSC6YOL137W 1494 nt13.34□□□□□ -0.27
UAF30Q08747 PUN1YLR414C 792 nt13.33□□□□□ -0.28
UAF30Q08747 BUD23YCR047C 828 nt13.25□□□□□ -0.29
UAF30Q08747 YJR018WYJR018W 363 nt13.21□□□□□ -0.29
UAF30Q08747 PTC2YER089C 1395 nt13.2□□□□□ -0.3
UAF30Q08747 TIR1YER011W 765 nt13.1□□□□□ -0.31
UAF30Q08747 NAB2YGL122C 1578 nt13.07□□□□□ -0.32
UAF30Q08747 SSA1YAL005C 1929 nt12.96□□□□□ -0.34
UAF30Q08747 RPP2BYDR382W 333 nt12.92□□□□□ -0.34
UAF30Q08747 YJR120WYJR120W 351 nt12.86□□□□□ -0.35
UAF30Q08747 FPR4YLR449W 1179 nt12.85□□□□□ -0.35
UAF30Q08747 PST2YDR032C 597 nt12.84□□□□□ -0.35
UAF30Q08747 DAL1YIR027C 1383 nt12.83□□□□□ -0.36
UAF30Q08747 FIS1YIL065C 468 nt12.81□□□□□ -0.36
UAF30Q08747 INM2YDR287W 879 nt12.79□□□□□ -0.36
UAF30Q08747 SPT5YML010W 3192 nt12.79□□□□□ -0.36
UAF30Q08747 PHO4YFR034C 939 nt12.7□□□□□ -0.38
UAF30Q08747 SRB2YHR041C 633 nt12.64□□□□□ -0.39
UAF30Q08747 YBL100CYBL100C 315 nt12.62□□□□□ -0.39
UAF30Q08747 BDH2YAL061W 1254 nt12.56□□□□□ -0.4
UAF30Q08747 YPS1YLR120C 1710 nt12.54□□□□□ -0.4
UAF30Q08747 MEP2YNL142W 1500 nt12.54□□□□□ -0.4
UAF30Q08747 SSA4YER103W 1929 nt12.52□□□□□ -0.4
UAF30Q08747 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.47□□□□□ -0.41
UAF30Q08747 WWM1YFL010C 636 nt12.45□□□□□ -0.42
UAF30Q08747 FUN26YAL022C 1554 nt12.44□□□□□ -0.42
UAF30Q08747 YDR095CYDR095C 411 nt12.42□□□□□ -0.42
UAF30Q08747 TRM9YML014W 840 nt12.41□□□□□ -0.42
UAF30Q08747 SHU1YHL006C 453 nt12.39□□□□□ -0.43
UAF30Q08747 ALF1YNL148C 765 nt12.38□□□□□ -0.43
UAF30Q08747 LSM3YLR438C-A 270 nt12.36□□□□□ -0.43
UAF30Q08747 YGR021WYGR021W 873 nt12.33□□□□□ -0.44
UAF30Q08747 DCW1YKL046C 1350 nt12.32□□□□□ -0.44
UAF30Q08747 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.3□□□□□ -0.44
UAF30Q08747 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.28□□□□□ -0.44
UAF30Q08747 CCT6YDR188W 1641 nt12.25□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 YKL097CYKL097C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 HOM6YJR139C 1080 nt12.23□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.22□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.22□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 RPP2AYOL039W 321 nt12.22□□□□□ -0.45
UAF30Q08747 YMR090WYMR090W 684 nt12.19□□□□□ -0.46
UAF30Q08747 EMI2YDR516C 1503 nt12.19□□□□□ -0.46
UAF30Q08747 MNP1YGL068W 585 nt12.14□□□□□ -0.47
UAF30Q08747 PTP1YDL230W 1008 nt12.13□□□□□ -0.47
UAF30Q08747 SIS1YNL007C 1059 nt12.13□□□□□ -0.47
UAF30Q08747 Q0182Q0182 405 nt12.11□□□□□ -0.47
UAF30Q08747 CAC2YML102W 1407 nt12.09□□□□□ -0.47
UAF30Q08747 RKM5YLR137W 1104 nt12.07□□□□□ -0.48
UAF30Q08747 YDL221WYDL221W 552 nt12.06□□□□□ -0.48
UAF30Q08747 BDF1YLR399C 2061 nt12.01□□□□□ -0.49
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