Protein–RNA interactions for Protein: Q08687

TMA16, Translation machinery-associated protein 16, yeastyeast

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Length 178 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMA16Q08687 NSR1YGR159C 1245 nt22.33■■□□□ 1.17
TMA16Q08687 YML009W-BYML009W-B 477 nt22.25■■□□□ 1.15
TMA16Q08687 NOP1YDL014W 984 nt21.4■■□□□ 1.02
TMA16Q08687 MDJ1YFL016C 1536 nt20.26■□□□□ 0.83
TMA16Q08687 YKL036CYKL036C 393 nt19.51■□□□□ 0.71
TMA16Q08687 SRX1YKL086W 384 nt18.76■□□□□ 0.59
TMA16Q08687 Q0297Q0297 156 nt18.7■□□□□ 0.58
TMA16Q08687 YJL027CYJL027C 417 nt18.56■□□□□ 0.56
TMA16Q08687 DBP2YNL112W 1641 nt17.83■□□□□ 0.44
TMA16Q08687 YCR051WYCR051W 669 nt17.79■□□□□ 0.44
TMA16Q08687 SCS3YGL126W 1143 nt17.67■□□□□ 0.42
TMA16Q08687 YBR190WYBR190W 312 nt17.25■□□□□ 0.35
TMA16Q08687 TRN1tP(UGG)A 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 SUF9tP(UGG)F 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 SUF8tP(UGG)H 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 SUF7tP(UGG)M 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 SUF11tP(UGG)O2 72 nt17.2■□□□□ 0.34
TMA16Q08687 CCC1YLR220W 969 nt17.02■□□□□ 0.32
TMA16Q08687 YOL085CYOL085C 342 nt16.98■□□□□ 0.31
TMA16Q08687 RTC3YHR087W 336 nt16.85■□□□□ 0.29
TMA16Q08687 PKP1YIL042C 1185 nt16.8■□□□□ 0.28
TMA16Q08687 RPP1BYDL130W 321 nt16.78■□□□□ 0.28
TMA16Q08687 SCJ1YMR214W 1134 nt16.54■□□□□ 0.24
TMA16Q08687 RVS167YDR388W 1449 nt16.5■□□□□ 0.23
TMA16Q08687 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt16.16■□□□□ 0.18
TMA16Q08687 PET122YER153C 765 nt16.14■□□□□ 0.17
TMA16Q08687 PUT4YOR348C 1884 nt16.01■□□□□ 0.15
TMA16Q08687 SHR5YOL110W 714 nt15.91■□□□□ 0.14
TMA16Q08687 SCR1SCR1 522 nt15.74■□□□□ 0.11
TMA16Q08687 ATS1YAL020C 1002 nt15.7■□□□□ 0.1
TMA16Q08687 URN1YPR152C 1398 nt15.69■□□□□ 0.1
TMA16Q08687 SSA3YBL075C 1950 nt15.69■□□□□ 0.1
TMA16Q08687 DEP1YAL013W 1218 nt15.64■□□□□ 0.09
TMA16Q08687 RRN5YLR141W 1092 nt15.63■□□□□ 0.09
TMA16Q08687 ARE1YCR048W 1833 nt15.62■□□□□ 0.09
TMA16Q08687 YDJ1YNL064C 1230 nt15.59■□□□□ 0.09
TMA16Q08687 SAH1YER043C 1350 nt15.55■□□□□ 0.08
TMA16Q08687 OPI9YLR338W 858 nt15.51■□□□□ 0.07
TMA16Q08687 POA1YBR022W 534 nt15.45■□□□□ 0.06
TMA16Q08687 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt15.38■□□□□ 0.05
TMA16Q08687 GAR1YHR089C 618 nt15.35■□□□□ 0.05
TMA16Q08687 YER088W-BYER088W-B 147 nt15.33■□□□□ 0.04
TMA16Q08687 RPN10YHR200W 807 nt15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q08687 YNL208WYNL208W 600 nt15.28■□□□□ 0.04
TMA16Q08687 BSC6YOL137W 1494 nt15.19■□□□□ 0.02
TMA16Q08687 RSB1YOR049C 1065 nt15.17■□□□□ 0.02
TMA16Q08687 PUN1YLR414C 792 nt15.01□□□□□ -0.01
TMA16Q08687 BUD23YCR047C 828 nt14.98□□□□□ -0.01
TMA16Q08687 PTC2YER089C 1395 nt14.96□□□□□ -0.02
TMA16Q08687 YJR018WYJR018W 363 nt14.93□□□□□ -0.02
TMA16Q08687 TIR1YER011W 765 nt14.83□□□□□ -0.04
TMA16Q08687 SPT5YML010W 3192 nt14.8□□□□□ -0.04
TMA16Q08687 SSA1YAL005C 1929 nt14.78□□□□□ -0.04
TMA16Q08687 YJR120WYJR120W 351 nt14.78□□□□□ -0.04
TMA16Q08687 NAB2YGL122C 1578 nt14.75□□□□□ -0.05
TMA16Q08687 PST2YDR032C 597 nt14.61□□□□□ -0.07
TMA16Q08687 SRB2YHR041C 633 nt14.61□□□□□ -0.07
TMA16Q08687 FIS1YIL065C 468 nt14.61□□□□□ -0.07
TMA16Q08687 DAL1YIR027C 1383 nt14.52□□□□□ -0.08
TMA16Q08687 FPR4YLR449W 1179 nt14.49□□□□□ -0.09
TMA16Q08687 RPP2BYDR382W 333 nt14.46□□□□□ -0.09
TMA16Q08687 PHO4YFR034C 939 nt14.41□□□□□ -0.1
TMA16Q08687 INM2YDR287W 879 nt14.38□□□□□ -0.11
TMA16Q08687 SSA4YER103W 1929 nt14.33□□□□□ -0.12
TMA16Q08687 MEP2YNL142W 1500 nt14.26□□□□□ -0.13
TMA16Q08687 YPS1YLR120C 1710 nt14.24□□□□□ -0.13
TMA16Q08687 YBL100CYBL100C 315 nt14.24□□□□□ -0.13
TMA16Q08687 BDH2YAL061W 1254 nt14.18□□□□□ -0.14
TMA16Q08687 WWM1YFL010C 636 nt14.17□□□□□ -0.14
TMA16Q08687 SHU1YHL006C 453 nt14.12□□□□□ -0.15
TMA16Q08687 DCW1YKL046C 1350 nt14.11□□□□□ -0.15
TMA16Q08687 YDR095CYDR095C 411 nt14.1□□□□□ -0.15
TMA16Q08687 FUN26YAL022C 1554 nt14.09□□□□□ -0.15
TMA16Q08687 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.07□□□□□ -0.16
TMA16Q08687 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt14.02□□□□□ -0.17
TMA16Q08687 TRM9YML014W 840 nt13.94□□□□□ -0.18
TMA16Q08687 HOM6YJR139C 1080 nt13.91□□□□□ -0.18
TMA16Q08687 PTP1YDL230W 1008 nt13.9□□□□□ -0.18
TMA16Q08687 LSM3YLR438C-A 270 nt13.9□□□□□ -0.18
TMA16Q08687 ALF1YNL148C 765 nt13.89□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 YGR021WYGR021W 873 nt13.87□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 CCT6YDR188W 1641 nt13.86□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt13.86□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 EMI2YDR516C 1503 nt13.85□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 CAC2YML102W 1407 nt13.85□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 MNP1YGL068W 585 nt13.85□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 BDF1YLR399C 2061 nt13.84□□□□□ -0.19
TMA16Q08687 YKL097CYKL097C 411 nt13.81□□□□□ -0.2
TMA16Q08687 RPP2AYOL039W 321 nt13.81□□□□□ -0.2
TMA16Q08687 SIS1YNL007C 1059 nt13.75□□□□□ -0.21
TMA16Q08687 YDL221WYDL221W 552 nt13.73□□□□□ -0.21
TMA16Q08687 YBR220CYBR220C 1683 nt13.72□□□□□ -0.21
TMA16Q08687 RKM5YLR137W 1104 nt13.7□□□□□ -0.22
TMA16Q08687 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.68□□□□□ -0.22
TMA16Q08687 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.68□□□□□ -0.22
TMA16Q08687 YMR090WYMR090W 684 nt13.65□□□□□ -0.22
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