Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.19■□□□□ 0.5
SOK2P53438 NSR1YGR159C 1245 nt17.94■□□□□ 0.46
SOK2P53438 NOP1YDL014W 984 nt17.74■□□□□ 0.43
SOK2P53438 YKL036CYKL036C 393 nt16.44■□□□□ 0.22
SOK2P53438 MDJ1YFL016C 1536 nt15.84■□□□□ 0.13
SOK2P53438 Q0297Q0297 156 nt15.5■□□□□ 0.07
SOK2P53438 SRX1YKL086W 384 nt15.45■□□□□ 0.06
SOK2P53438 YJL027CYJL027C 417 nt15.4■□□□□ 0.06
SOK2P53438 SCS3YGL126W 1143 nt15□□□□□ -0.01
SOK2P53438 YCR051WYCR051W 669 nt14.73□□□□□ -0.05
SOK2P53438 YOL085CYOL085C 342 nt14.21□□□□□ -0.13
SOK2P53438 PKP1YIL042C 1185 nt14.02□□□□□ -0.17
SOK2P53438 DBP2YNL112W 1641 nt14.01□□□□□ -0.17
SOK2P53438 SSA3YBL075C 1950 nt13.95□□□□□ -0.18
SOK2P53438 RPP1BYDL130W 321 nt13.93□□□□□ -0.18
SOK2P53438 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.89□□□□□ -0.19
SOK2P53438 CCC1YLR220W 969 nt13.83□□□□□ -0.2
SOK2P53438 YBR190WYBR190W 312 nt13.46□□□□□ -0.25
SOK2P53438 ATS1YAL020C 1002 nt13.45□□□□□ -0.26
SOK2P53438 SCJ1YMR214W 1134 nt13.4□□□□□ -0.26
SOK2P53438 RVS167YDR388W 1449 nt13.3□□□□□ -0.28
SOK2P53438 PET122YER153C 765 nt13.29□□□□□ -0.28
SOK2P53438 RTC3YHR087W 336 nt13.25□□□□□ -0.29
SOK2P53438 SCR1SCR1 522 nt13.24□□□□□ -0.29
SOK2P53438 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.2□□□□□ -0.3
SOK2P53438 Q0182Q0182 405 nt12.98□□□□□ -0.33
SOK2P53438 RRN5YLR141W 1092 nt12.93□□□□□ -0.34
SOK2P53438 MOT3YMR070W 1473 nt12.85□□□□□ -0.35
SOK2P53438 SHR5YOL110W 714 nt12.81□□□□□ -0.36
SOK2P53438 YDJ1YNL064C 1230 nt12.74□□□□□ -0.37
SOK2P53438 RSB1YOR049C 1065 nt12.73□□□□□ -0.37
SOK2P53438 PUT4YOR348C 1884 nt12.69□□□□□ -0.38
SOK2P53438 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.67□□□□□ -0.38
SOK2P53438 GAR1YHR089C 618 nt12.5□□□□□ -0.41
SOK2P53438 DEP1YAL013W 1218 nt12.45□□□□□ -0.42
SOK2P53438 PST2YDR032C 597 nt12.41□□□□□ -0.42
SOK2P53438 URN1YPR152C 1398 nt12.41□□□□□ -0.42
SOK2P53438 RPN10YHR200W 807 nt12.27□□□□□ -0.45
SOK2P53438 POA1YBR022W 534 nt12.26□□□□□ -0.45
SOK2P53438 YNL208WYNL208W 600 nt12.25□□□□□ -0.45
SOK2P53438 SSA4YER103W 1929 nt12.2□□□□□ -0.46
SOK2P53438 ARE1YCR048W 1833 nt12.2□□□□□ -0.46
SOK2P53438 OPI9YLR338W 858 nt12.16□□□□□ -0.46
SOK2P53438 BSC6YOL137W 1494 nt12.14□□□□□ -0.47
SOK2P53438 SPT5YML010W 3192 nt12.13□□□□□ -0.47
SOK2P53438 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.09□□□□□ -0.47
SOK2P53438 SAH1YER043C 1350 nt12.08□□□□□ -0.48
SOK2P53438 TIR1YER011W 765 nt12.05□□□□□ -0.48
SOK2P53438 YKL097CYKL097C 411 nt12.03□□□□□ -0.48
SOK2P53438 YGR139WYGR139W 339 nt11.96□□□□□ -0.49
SOK2P53438 SHU1YHL006C 453 nt11.89□□□□□ -0.51
SOK2P53438 SSA1YAL005C 1929 nt11.86□□□□□ -0.51
SOK2P53438 YJR018WYJR018W 363 nt11.83□□□□□ -0.52
SOK2P53438 PUN1YLR414C 792 nt11.83□□□□□ -0.52
SOK2P53438 BDF1YLR399C 2061 nt11.79□□□□□ -0.52
SOK2P53438 BUD23YCR047C 828 nt11.77□□□□□ -0.53
SOK2P53438 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.72□□□□□ -0.53
SOK2P53438 NME1NME1 340 nt11.71□□□□□ -0.53
SOK2P53438 PTC2YER089C 1395 nt11.68□□□□□ -0.54
SOK2P53438 PAC11YDR488C 1602 nt11.68□□□□□ -0.54
SOK2P53438 RPP2BYDR382W 333 nt11.67□□□□□ -0.54
SOK2P53438 SRB2YHR041C 633 nt11.65□□□□□ -0.54
SOK2P53438 TAT1YBR069C 1860 nt11.61□□□□□ -0.55
SOK2P53438 YJR120WYJR120W 351 nt11.58□□□□□ -0.56
SOK2P53438 WWM1YFL010C 636 nt11.54□□□□□ -0.56
SOK2P53438 YGR021WYGR021W 873 nt11.52□□□□□ -0.57
SOK2P53438 NAB2YGL122C 1578 nt11.5□□□□□ -0.57
SOK2P53438 MEP2YNL142W 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
SOK2P53438 YOR139CYOR139C 393 nt11.47□□□□□ -0.57
SOK2P53438 HOM6YJR139C 1080 nt11.45□□□□□ -0.58
SOK2P53438 NPL3YDR432W 1245 nt11.43□□□□□ -0.58
SOK2P53438 MNP1YGL068W 585 nt11.43□□□□□ -0.58
SOK2P53438 FPR4YLR449W 1179 nt11.42□□□□□ -0.58
SOK2P53438 INM2YDR287W 879 nt11.4□□□□□ -0.58
SOK2P53438 BDH2YAL061W 1254 nt11.4□□□□□ -0.58
SOK2P53438 DAL1YIR027C 1383 nt11.38□□□□□ -0.59
SOK2P53438 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.34□□□□□ -0.59
SOK2P53438 NVJ2YPR091C 2313 nt11.32□□□□□ -0.6
SOK2P53438 FIS1YIL065C 468 nt11.32□□□□□ -0.6
SOK2P53438 YBL100CYBL100C 315 nt11.32□□□□□ -0.6
SOK2P53438 RKM5YLR137W 1104 nt11.3□□□□□ -0.6
SOK2P53438 YOL037CYOL037C 354 nt11.29□□□□□ -0.6
SOK2P53438 DCW1YKL046C 1350 nt11.28□□□□□ -0.6
SOK2P53438 LSM3YLR438C-A 270 nt11.27□□□□□ -0.61
SOK2P53438 PHO4YFR034C 939 nt11.26□□□□□ -0.61
SOK2P53438 TRM9YML014W 840 nt11.2□□□□□ -0.62
SOK2P53438 YBR220CYBR220C 1683 nt11.19□□□□□ -0.62
SOK2P53438 YMR090WYMR090W 684 nt11.18□□□□□ -0.62
SOK2P53438 FUN26YAL022C 1554 nt11.17□□□□□ -0.62
SOK2P53438 EMI2YDR516C 1503 nt11.12□□□□□ -0.63
SOK2P53438 YPS1YLR120C 1710 nt11.11□□□□□ -0.63
SOK2P53438 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms