Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.74■□□□□ 0.59
SEF1P34228 NSR1YGR159C 1245 nt18.43■□□□□ 0.54
SEF1P34228 NOP1YDL014W 984 nt18.33■□□□□ 0.52
SEF1P34228 YKL036CYKL036C 393 nt17.33■□□□□ 0.36
SEF1P34228 MDJ1YFL016C 1536 nt16.29■□□□□ 0.2
SEF1P34228 YJL027CYJL027C 417 nt16.25■□□□□ 0.19
SEF1P34228 Q0297Q0297 156 nt16.21■□□□□ 0.19
SEF1P34228 SRX1YKL086W 384 nt16.04■□□□□ 0.16
SEF1P34228 SCS3YGL126W 1143 nt16■□□□□ 0.15
SEF1P34228 YCR051WYCR051W 669 nt15.25■□□□□ 0.03
SEF1P34228 YOL085CYOL085C 342 nt15.01□□□□□ -0.01
SEF1P34228 PKP1YIL042C 1185 nt14.74□□□□□ -0.05
SEF1P34228 SCJ1YMR214W 1134 nt14.68□□□□□ -0.06
SEF1P34228 RPP1BYDL130W 321 nt14.54□□□□□ -0.08
SEF1P34228 DBP2YNL112W 1641 nt14.44□□□□□ -0.1
SEF1P34228 ATS1YAL020C 1002 nt14.42□□□□□ -0.1
SEF1P34228 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.35□□□□□ -0.11
SEF1P34228 CCC1YLR220W 969 nt14.18□□□□□ -0.14
SEF1P34228 YBR190WYBR190W 312 nt13.92□□□□□ -0.18
SEF1P34228 PET122YER153C 765 nt13.86□□□□□ -0.19
SEF1P34228 SCR1SCR1 522 nt13.79□□□□□ -0.2
SEF1P34228 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.66□□□□□ -0.22
SEF1P34228 RVS167YDR388W 1449 nt13.6□□□□□ -0.23
SEF1P34228 RTC3YHR087W 336 nt13.56□□□□□ -0.24
SEF1P34228 RRN5YLR141W 1092 nt13.5□□□□□ -0.25
SEF1P34228 SSA3YBL075C 1950 nt13.46□□□□□ -0.25
SEF1P34228 RSB1YOR049C 1065 nt13.33□□□□□ -0.28
SEF1P34228 PST2YDR032C 597 nt13.29□□□□□ -0.28
SEF1P34228 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.24□□□□□ -0.29
SEF1P34228 YDJ1YNL064C 1230 nt13.19□□□□□ -0.3
SEF1P34228 SHR5YOL110W 714 nt13.14□□□□□ -0.31
SEF1P34228 YKL097CYKL097C 411 nt12.97□□□□□ -0.33
SEF1P34228 GAR1YHR089C 618 nt12.87□□□□□ -0.35
SEF1P34228 URN1YPR152C 1398 nt12.73□□□□□ -0.37
SEF1P34228 DEP1YAL013W 1218 nt12.7□□□□□ -0.38
SEF1P34228 SHU1YHL006C 453 nt12.66□□□□□ -0.38
SEF1P34228 PUT4YOR348C 1884 nt12.59□□□□□ -0.39
SEF1P34228 RPN10YHR200W 807 nt12.58□□□□□ -0.4
SEF1P34228 OPI9YLR338W 858 nt12.56□□□□□ -0.4
SEF1P34228 YNL208WYNL208W 600 nt12.56□□□□□ -0.4
SEF1P34228 SAH1YER043C 1350 nt12.43□□□□□ -0.42
SEF1P34228 TIR1YER011W 765 nt12.42□□□□□ -0.42
SEF1P34228 YOR139CYOR139C 393 nt12.41□□□□□ -0.42
SEF1P34228 ARE1YCR048W 1833 nt12.37□□□□□ -0.43
SEF1P34228 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.33□□□□□ -0.44
SEF1P34228 Q0182Q0182 405 nt12.26□□□□□ -0.45
SEF1P34228 SSA1YAL005C 1929 nt12.25□□□□□ -0.45
SEF1P34228 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.21□□□□□ -0.45
SEF1P34228 PUN1YLR414C 792 nt12.2□□□□□ -0.46
SEF1P34228 NPL3YDR432W 1245 nt12.17□□□□□ -0.46
SEF1P34228 POA1YBR022W 534 nt12.17□□□□□ -0.46
SEF1P34228 SRB2YHR041C 633 nt12.15□□□□□ -0.46
SEF1P34228 YJR018WYJR018W 363 nt12.15□□□□□ -0.46
SEF1P34228 PTC2YER089C 1395 nt12.01□□□□□ -0.49
SEF1P34228 YJR120WYJR120W 351 nt11.98□□□□□ -0.49
SEF1P34228 MNP1YGL068W 585 nt11.97□□□□□ -0.49
SEF1P34228 HOM6YJR139C 1080 nt11.95□□□□□ -0.5
SEF1P34228 WWM1YFL010C 636 nt11.94□□□□□ -0.5
SEF1P34228 YGR021WYGR021W 873 nt11.94□□□□□ -0.5
SEF1P34228 BSC6YOL137W 1494 nt11.92□□□□□ -0.5
SEF1P34228 RPP2BYDR382W 333 nt11.92□□□□□ -0.5
SEF1P34228 YOL037CYOL037C 354 nt11.91□□□□□ -0.5
SEF1P34228 BUD23YCR047C 828 nt11.9□□□□□ -0.5
SEF1P34228 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.89□□□□□ -0.51
SEF1P34228 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.89□□□□□ -0.51
SEF1P34228 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.89□□□□□ -0.51
SEF1P34228 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.89□□□□□ -0.51
SEF1P34228 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.89□□□□□ -0.51
SEF1P34228 NAB2YGL122C 1578 nt11.88□□□□□ -0.51
SEF1P34228 RKM5YLR137W 1104 nt11.77□□□□□ -0.53
SEF1P34228 INM2YDR287W 879 nt11.73□□□□□ -0.53
SEF1P34228 DAL1YIR027C 1383 nt11.72□□□□□ -0.53
SEF1P34228 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.72□□□□□ -0.53
SEF1P34228 FIS1YIL065C 468 nt11.72□□□□□ -0.53
SEF1P34228 BDH2YAL061W 1254 nt11.71□□□□□ -0.53
SEF1P34228 FPR4YLR449W 1179 nt11.65□□□□□ -0.54
SEF1P34228 PUS2YGL063W 1113 nt11.63□□□□□ -0.55
SEF1P34228 YBL100CYBL100C 315 nt11.62□□□□□ -0.55
SEF1P34228 PHO4YFR034C 939 nt11.61□□□□□ -0.55
SEF1P34228 YLR281CYLR281C 468 nt11.61□□□□□ -0.55
SEF1P34228 MOT3YMR070W 1473 nt11.59□□□□□ -0.55
SEF1P34228 LSM3YLR438C-A 270 nt11.57□□□□□ -0.56
SEF1P34228 WHI5YOR083W 888 nt11.5□□□□□ -0.57
SEF1P34228 FUN26YAL022C 1554 nt11.47□□□□□ -0.57
SEF1P34228 SPT5YML010W 3192 nt11.47□□□□□ -0.57
SEF1P34228 PAC11YDR488C 1602 nt11.46□□□□□ -0.57
SEF1P34228 TRM9YML014W 840 nt11.45□□□□□ -0.58
SEF1P34228 SSA4YER103W 1929 nt11.44□□□□□ -0.58
SEF1P34228 YPS1YLR120C 1710 nt11.38□□□□□ -0.59
SEF1P34228 CCT6YDR188W 1641 nt11.37□□□□□ -0.59
SEF1P34228 FMP45YDL222C 930 nt11.35□□□□□ -0.59
SEF1P34228 YPR011CYPR011C 981 nt11.35□□□□□ -0.59
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