Protein–RNA interactions for Protein: P36117

ALY1, Arrestin-related trafficking adapter 6, yeastyeast

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ALY1P36117 YML009W-BYML009W-B 477 nt20.68■□□□□ 0.9
ALY1P36117 NSR1YGR159C 1245 nt20.4■□□□□ 0.86
ALY1P36117 NOP1YDL014W 984 nt20.04■□□□□ 0.8
ALY1P36117 YKL036CYKL036C 393 nt18.63■□□□□ 0.57
ALY1P36117 MDJ1YFL016C 1536 nt18.13■□□□□ 0.49
ALY1P36117 Q0297Q0297 156 nt17.61■□□□□ 0.41
ALY1P36117 SRX1YKL086W 384 nt17.55■□□□□ 0.4
ALY1P36117 YJL027CYJL027C 417 nt17.42■□□□□ 0.38
ALY1P36117 SCS3YGL126W 1143 nt17.04■□□□□ 0.32
ALY1P36117 YCR051WYCR051W 669 nt16.7■□□□□ 0.26
ALY1P36117 YOL085CYOL085C 342 nt16.17■□□□□ 0.18
ALY1P36117 DBP2YNL112W 1641 nt16.09■□□□□ 0.17
ALY1P36117 PKP1YIL042C 1185 nt15.98■□□□□ 0.15
ALY1P36117 TRN1tP(UGG)A 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 SUF9tP(UGG)F 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 SUF8tP(UGG)H 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 SUF7tP(UGG)M 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 SUF11tP(UGG)O2 72 nt15.84■□□□□ 0.13
ALY1P36117 RPP1BYDL130W 321 nt15.81■□□□□ 0.12
ALY1P36117 CCC1YLR220W 969 nt15.74■□□□□ 0.11
ALY1P36117 YBR190WYBR190W 312 nt15.35■□□□□ 0.05
ALY1P36117 ATS1YAL020C 1002 nt15.26■□□□□ 0.03
ALY1P36117 PET122YER153C 765 nt15.15■□□□□ 0.02
ALY1P36117 SCJ1YMR214W 1134 nt15.1■□□□□ 0.01
ALY1P36117 RTC3YHR087W 336 nt15.05■□□□□ -0
ALY1P36117 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt15.03■□□□□ -0
ALY1P36117 RVS167YDR388W 1449 nt15.02■□□□□ -0
ALY1P36117 SCR1SCR1 522 nt14.92□□□□□ -0.02
ALY1P36117 RRN5YLR141W 1092 nt14.73□□□□□ -0.05
ALY1P36117 SHR5YOL110W 714 nt14.55□□□□□ -0.08
ALY1P36117 YDJ1YNL064C 1230 nt14.48□□□□□ -0.09
ALY1P36117 YER088W-BYER088W-B 147 nt14.43□□□□□ -0.1
ALY1P36117 RSB1YOR049C 1065 nt14.43□□□□□ -0.1
ALY1P36117 GAR1YHR089C 618 nt14.22□□□□□ -0.13
ALY1P36117 DEP1YAL013W 1218 nt14.22□□□□□ -0.13
ALY1P36117 URN1YPR152C 1398 nt14.13□□□□□ -0.15
ALY1P36117 PST2YDR032C 597 nt14.12□□□□□ -0.15
ALY1P36117 PUT4YOR348C 1884 nt13.93□□□□□ -0.18
ALY1P36117 YNL208WYNL208W 600 nt13.9□□□□□ -0.18
ALY1P36117 OPI9YLR338W 858 nt13.88□□□□□ -0.19
ALY1P36117 RPN10YHR200W 807 nt13.85□□□□□ -0.19
ALY1P36117 SAH1YER043C 1350 nt13.83□□□□□ -0.2
ALY1P36117 ARE1YCR048W 1833 nt13.72□□□□□ -0.21
ALY1P36117 TIR1YER011W 765 nt13.72□□□□□ -0.21
ALY1P36117 YKL097CYKL097C 411 nt13.58□□□□□ -0.24
ALY1P36117 SSA1YAL005C 1929 nt13.58□□□□□ -0.24
ALY1P36117 SHU1YHL006C 453 nt13.56□□□□□ -0.24
ALY1P36117 SSA3YBL075C 1950 nt13.54□□□□□ -0.24
ALY1P36117 POA1YBR022W 534 nt13.53□□□□□ -0.24
ALY1P36117 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.52□□□□□ -0.25
ALY1P36117 YJR018WYJR018W 363 nt13.47□□□□□ -0.25
ALY1P36117 SRB2YHR041C 633 nt13.45□□□□□ -0.26
ALY1P36117 PUN1YLR414C 792 nt13.44□□□□□ -0.26
ALY1P36117 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt13.38□□□□□ -0.27
ALY1P36117 YJR120WYJR120W 351 nt13.36□□□□□ -0.27
ALY1P36117 PTC2YER089C 1395 nt13.32□□□□□ -0.28
ALY1P36117 BUD23YCR047C 828 nt13.23□□□□□ -0.29
ALY1P36117 BSC6YOL137W 1494 nt13.19□□□□□ -0.3
ALY1P36117 WWM1YFL010C 636 nt13.18□□□□□ -0.3
ALY1P36117 RPP2BYDR382W 333 nt13.17□□□□□ -0.3
ALY1P36117 NAB2YGL122C 1578 nt13.11□□□□□ -0.31
ALY1P36117 YOR139CYOR139C 393 nt13.08□□□□□ -0.32
ALY1P36117 MNP1YGL068W 585 nt13.05□□□□□ -0.32
ALY1P36117 HOM6YJR139C 1080 nt13.04□□□□□ -0.32
ALY1P36117 YGR021WYGR021W 873 nt13.01□□□□□ -0.33
ALY1P36117 FPR4YLR449W 1179 nt12.98□□□□□ -0.33
ALY1P36117 FIS1YIL065C 468 nt12.97□□□□□ -0.33
ALY1P36117 BDH2YAL061W 1254 nt12.96□□□□□ -0.33
ALY1P36117 DAL1YIR027C 1383 nt12.95□□□□□ -0.34
ALY1P36117 INM2YDR287W 879 nt12.93□□□□□ -0.34
ALY1P36117 NPL3YDR432W 1245 nt12.89□□□□□ -0.35
ALY1P36117 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt12.87□□□□□ -0.35
ALY1P36117 YBL100CYBL100C 315 nt12.87□□□□□ -0.35
ALY1P36117 PHO4YFR034C 939 nt12.86□□□□□ -0.35
ALY1P36117 RKM5YLR137W 1104 nt12.84□□□□□ -0.35
ALY1P36117 LSM3YLR438C-A 270 nt12.78□□□□□ -0.36
ALY1P36117 YOL037CYOL037C 354 nt12.75□□□□□ -0.37
ALY1P36117 FUN26YAL022C 1554 nt12.73□□□□□ -0.37
ALY1P36117 TRM9YML014W 840 nt12.7□□□□□ -0.38
ALY1P36117 YPS1YLR120C 1710 nt12.57□□□□□ -0.4
ALY1P36117 CCT6YDR188W 1641 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 IMT4tM(CAU)E 72 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 IMT3tM(CAU)J3 72 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 IMT1tM(CAU)O1 72 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 IMT2tM(CAU)P 72 nt12.56□□□□□ -0.4
ALY1P36117 SPT5YML010W 3192 nt12.51□□□□□ -0.41
ALY1P36117 YLR281CYLR281C 468 nt12.51□□□□□ -0.41
ALY1P36117 YDR095CYDR095C 411 nt12.49□□□□□ -0.41
ALY1P36117 ALF1YNL148C 765 nt12.49□□□□□ -0.41
ALY1P36117 Q0182Q0182 405 nt12.48□□□□□ -0.41
ALY1P36117 WHI5YOR083W 888 nt12.48□□□□□ -0.41
ALY1P36117 PUS2YGL063W 1113 nt12.44□□□□□ -0.42
ALY1P36117 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.42□□□□□ -0.42
ALY1P36117 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.4□□□□□ -0.42
ALY1P36117 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms