Protein–RNA interactions for Protein: P53153

LCL3, Probable endonuclease LCL3, yeastyeast

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Length 274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCL3P53153 YML009W-BYML009W-B 477 nt19.03■□□□□ 0.64
LCL3P53153 NSR1YGR159C 1245 nt18.68■□□□□ 0.58
LCL3P53153 NOP1YDL014W 984 nt18.56■□□□□ 0.56
LCL3P53153 YKL036CYKL036C 393 nt17.3■□□□□ 0.36
LCL3P53153 MDJ1YFL016C 1536 nt16.45■□□□□ 0.22
LCL3P53153 Q0297Q0297 156 nt16.27■□□□□ 0.2
LCL3P53153 YJL027CYJL027C 417 nt16.22■□□□□ 0.19
LCL3P53153 SRX1YKL086W 384 nt16.19■□□□□ 0.18
LCL3P53153 SCS3YGL126W 1143 nt15.85■□□□□ 0.13
LCL3P53153 YCR051WYCR051W 669 nt15.44■□□□□ 0.06
LCL3P53153 YOL085CYOL085C 342 nt14.98□□□□□ -0.01
LCL3P53153 PKP1YIL042C 1185 nt14.77□□□□□ -0.05
LCL3P53153 RPP1BYDL130W 321 nt14.62□□□□□ -0.07
LCL3P53153 DBP2YNL112W 1641 nt14.57□□□□□ -0.08
LCL3P53153 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.51□□□□□ -0.09
LCL3P53153 CCC1YLR220W 969 nt14.45□□□□□ -0.1
LCL3P53153 SCJ1YMR214W 1134 nt14.24□□□□□ -0.13
LCL3P53153 ATS1YAL020C 1002 nt14.23□□□□□ -0.13
LCL3P53153 PET122YER153C 765 nt13.96□□□□□ -0.17
LCL3P53153 YBR190WYBR190W 312 nt13.93□□□□□ -0.18
LCL3P53153 SCR1SCR1 522 nt13.88□□□□□ -0.19
LCL3P53153 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.82□□□□□ -0.2
LCL3P53153 RVS167YDR388W 1449 nt13.81□□□□□ -0.2
LCL3P53153 RTC3YHR087W 336 nt13.71□□□□□ -0.21
LCL3P53153 RRN5YLR141W 1092 nt13.59□□□□□ -0.23
LCL3P53153 RSB1YOR049C 1065 nt13.4□□□□□ -0.26
LCL3P53153 YDJ1YNL064C 1230 nt13.34□□□□□ -0.27
LCL3P53153 SHR5YOL110W 714 nt13.34□□□□□ -0.27
LCL3P53153 YER088W-BYER088W-B 147 nt13.31□□□□□ -0.28
LCL3P53153 PST2YDR032C 597 nt13.13□□□□□ -0.31
LCL3P53153 GAR1YHR089C 618 nt13.08□□□□□ -0.32
LCL3P53153 DEP1YAL013W 1218 nt12.96□□□□□ -0.33
LCL3P53153 URN1YPR152C 1398 nt12.87□□□□□ -0.35
LCL3P53153 YKL097CYKL097C 411 nt12.75□□□□□ -0.37
LCL3P53153 RPN10YHR200W 807 nt12.73□□□□□ -0.37
LCL3P53153 YNL208WYNL208W 600 nt12.73□□□□□ -0.37
LCL3P53153 OPI9YLR338W 858 nt12.61□□□□□ -0.39
LCL3P53153 TIR1YER011W 765 nt12.6□□□□□ -0.39
LCL3P53153 SHU1YHL006C 453 nt12.57□□□□□ -0.4
LCL3P53153 PUT4YOR348C 1884 nt12.51□□□□□ -0.41
LCL3P53153 SAH1YER043C 1350 nt12.51□□□□□ -0.41
LCL3P53153 SSA1YAL005C 1929 nt12.39□□□□□ -0.43
LCL3P53153 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt12.35□□□□□ -0.43
LCL3P53153 ARE1YCR048W 1833 nt12.32□□□□□ -0.44
LCL3P53153 Q0182Q0182 405 nt12.3□□□□□ -0.44
LCL3P53153 YJR018WYJR018W 363 nt12.29□□□□□ -0.44
LCL3P53153 PUN1YLR414C 792 nt12.26□□□□□ -0.45
LCL3P53153 SSA3YBL075C 1950 nt12.23□□□□□ -0.45
LCL3P53153 SRB2YHR041C 633 nt12.22□□□□□ -0.45
LCL3P53153 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.21□□□□□ -0.45
LCL3P53153 POA1YBR022W 534 nt12.19□□□□□ -0.46
LCL3P53153 YOR139CYOR139C 393 nt12.17□□□□□ -0.46
LCL3P53153 RPP2BYDR382W 333 nt12.11□□□□□ -0.47
LCL3P53153 YJR120WYJR120W 351 nt12.1□□□□□ -0.47
LCL3P53153 PTC2YER089C 1395 nt12.09□□□□□ -0.47
LCL3P53153 WWM1YFL010C 636 nt12.09□□□□□ -0.47
LCL3P53153 NPL3YDR432W 1245 nt12.07□□□□□ -0.48
LCL3P53153 YGR021WYGR021W 873 nt12.06□□□□□ -0.48
LCL3P53153 MNP1YGL068W 585 nt12.03□□□□□ -0.48
LCL3P53153 HOM6YJR139C 1080 nt12.02□□□□□ -0.49
LCL3P53153 BUD23YCR047C 828 nt11.99□□□□□ -0.49
LCL3P53153 NAB2YGL122C 1578 nt11.9□□□□□ -0.5
LCL3P53153 BSC6YOL137W 1494 nt11.89□□□□□ -0.51
LCL3P53153 BDH2YAL061W 1254 nt11.87□□□□□ -0.51
LCL3P53153 YOL037CYOL037C 354 nt11.87□□□□□ -0.51
LCL3P53153 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.86□□□□□ -0.51
LCL3P53153 RKM5YLR137W 1104 nt11.85□□□□□ -0.51
LCL3P53153 FPR4YLR449W 1179 nt11.83□□□□□ -0.52
LCL3P53153 MOT3YMR070W 1473 nt11.83□□□□□ -0.52
LCL3P53153 INM2YDR287W 879 nt11.81□□□□□ -0.52
LCL3P53153 DAL1YIR027C 1383 nt11.78□□□□□ -0.52
LCL3P53153 LSM3YLR438C-A 270 nt11.74□□□□□ -0.53
LCL3P53153 YBL100CYBL100C 315 nt11.74□□□□□ -0.53
LCL3P53153 FIS1YIL065C 468 nt11.72□□□□□ -0.53
LCL3P53153 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LCL3P53153 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LCL3P53153 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LCL3P53153 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LCL3P53153 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.69□□□□□ -0.54
LCL3P53153 PHO4YFR034C 939 nt11.66□□□□□ -0.54
LCL3P53153 TRM9YML014W 840 nt11.64□□□□□ -0.55
LCL3P53153 FUN26YAL022C 1554 nt11.61□□□□□ -0.55
LCL3P53153 YLR281CYLR281C 468 nt11.58□□□□□ -0.56
LCL3P53153 PUS2YGL063W 1113 nt11.57□□□□□ -0.56
LCL3P53153 WHI5YOR083W 888 nt11.54□□□□□ -0.56
LCL3P53153 CCT6YDR188W 1641 nt11.46□□□□□ -0.57
LCL3P53153 ALF1YNL148C 765 nt11.44□□□□□ -0.58
LCL3P53153 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.38□□□□□ -0.59
LCL3P53153 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.38□□□□□ -0.59
LCL3P53153 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.37□□□□□ -0.59
LCL3P53153 YPS1YLR120C 1710 nt11.34□□□□□ -0.59
LCL3P53153 FPS1YLL043W 2010 nt11.33□□□□□ -0.6
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