RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E130218I03RikA0A0U1RNU5 63 aa8.49□□□□□ -1.05
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv8-24A0A140T8P5 121 aa8.48□□□□□ -1.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17349F7BGH6 99 aa8.48□□□□□ -1.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Reg3dQ9QUS9 175 aa8.48□□□□□ -1.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv8-27A0A0G2JF28 120 aa8.47□□□□□ -1.05
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv8-30A0A140T8M3 121 aa8.47□□□□□ -1.05
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ube2d4D3YUH6 135 aa8.45□□□□□ -1.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ormdl1Q921I0 153 aa8.45□□□□□ -1.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01819 144 aa8.44□□□□□ -1.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv8-26A0A075B5N5 123 aa8.43□□□□□ -1.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa8.43□□□□□ -1.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930556J24RikQ9D4U7 146 aa8.41□□□□□ -1.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17689B3GLJ4 109 aa8.4□□□□□ -1.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msrb1Q9JLC3 116 aa8.4□□□□□ -1.06
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cox7bP56393 80 aa8.4□□□□□ -1.06
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam19a3Q7TPG6 132 aa8.39□□□□□ -1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnah1E9Q8T7 4250 aa8.38□□□□□ -1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv1-88A0A140T8N1 120 aa8.38□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9530003J23RikQ8BM26 151 aa8.37□□□□□ -1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl52Q9D0Y8 121 aa8.37□□□□□ -1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv10-1A0A0B4J1J6 119 aa8.37□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psors1c2Q80ZC9 134 aa8.37□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa8.36□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa8.35□□□□□ -1.07
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AY074887Q8R5F9 132 aa8.35□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa8.34□□□□□ -1.07
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd164Q9R0L9 197 aa8.31□□□□□ -1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam19a5Q91WE9 132 aa8.3□□□□□ -1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm17577J3QNF7 156 aa8.3□□□□□ -1.08
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smim29Q8R043 75 aa8.3□□□□□ -1.08
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa8.24□□□□□ -1.09
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Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9430015G10RikA2ASP7 199 aa8.23□□□□□ -1.09
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdk2ap2Q9CPY4 127 aa8.23□□□□□ -1.09
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Camk2n2Q78WH7 79 aa8.23□□□□□ -1.09
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv3-2A0A075B5P0 119 aa8.21□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sfta2E9PXB6 77 aa8.21□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pde6gP09174 87 aa8.2□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vpreb2P13373 142 aa8.2□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11011D3Z3L9 86 aa8.2□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC048502Q80Y74 154 aa8.19□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufc1Q9CQY9 76 aa8.19□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sprr4Q8CGN8 76 aa8.19□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HrnrQ8VHD8 2496 aa8.18□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ighv2-2A0A075B5P8 116 aa8.18□□□□□ -1.1
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 P01821 116 aa8.18□□□□□ -1.1
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