Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Krtap11-1E9Q2E9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Krtap11-1E9Q2E9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Krtap11-1E9Q2E9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Krtap11-1E9Q2E9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Krtap11-1E9Q2E9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krtap11-1E9Q2E9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krtap11-1E9Q2E9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krtap11-1E9Q2E9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Krtap11-1E9Q2E9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Krtap11-1E9Q2E9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Krtap11-1E9Q2E9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Krtap11-1E9Q2E9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Krtap11-1E9Q2E9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Krtap11-1E9Q2E9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Krtap11-1E9Q2E9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krtap11-1E9Q2E9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Krtap11-1E9Q2E9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Krtap11-1E9Q2E9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Krtap11-1E9Q2E9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Krtap11-1E9Q2E9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Krtap11-1E9Q2E9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Krtap11-1E9Q2E9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krtap11-1E9Q2E9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Krtap11-1E9Q2E9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Krtap11-1E9Q2E9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Krtap11-1E9Q2E9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Krtap11-1E9Q2E9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Krtap11-1E9Q2E9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Krtap11-1E9Q2E9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Krtap11-1E9Q2E9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Krtap11-1E9Q2E9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krtap11-1E9Q2E9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Krtap11-1E9Q2E9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Krtap11-1E9Q2E9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Krtap11-1E9Q2E9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Krtap11-1E9Q2E9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Krtap11-1E9Q2E9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Krtap11-1E9Q2E9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Krtap11-1E9Q2E9 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krtap11-1E9Q2E9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krtap11-1E9Q2E9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krtap11-1E9Q2E9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Krtap11-1E9Q2E9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Krtap11-1E9Q2E9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Krtap11-1E9Q2E9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Krtap11-1E9Q2E9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Krtap11-1E9Q2E9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Krtap11-1E9Q2E9 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms