RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cmc4Q61908 68 aa14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tm2d2Q8R0I4 213 aa14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ube2wQ8VDW4 151 aa14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Itpr2Q9Z329 2701 aa14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk9Q32M27 251 aa14.63□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MalO09198 153 aa14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brwd1Q921C3 2304 aa14.62□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav13d-4A0A0G2JFX3 110 aa14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10549Q3URY4 149 aa14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vmo1Q5SXG7 201 aa14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav7-6A0A075B640 112 aa14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp5g1Q9CR84 136 aa14.61□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2310009B15RikA0A0A6YWI4 143 aa14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930544G11RikQ9CR99 193 aa14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cryba4Q9JJV0 196 aa14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hivep3A2A884 2348 aa14.6□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Sprr1bQ62267 153 aa14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SpinklQ8CEK3 90 aa14.59□□□□□ -0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 SelenowP63300 88 aa14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PrcdQ00LT2 53 aa14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm904Q3V2L5 102 aa14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PemtQ61907 199 aa14.58□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01755 137 aa14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Leap2Q91V13 76 aa14.57□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dand5Q76LW6 185 aa14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa14.56□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10647E9Q8X0 124 aa14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10767Q3TQP0 103 aa14.55□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv2-9-1A0A075B697 116 aa14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Foxc1Q61572 553 aa14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 1700020N15RikL7MTX3 112 aa14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spata45Q9CVW4 97 aa14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Wdr38Q9D994 303 aa14.54□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tenm1Q9WTS4 2731 aa14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv1-99F6XWB2 120 aa14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl28P41105 137 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tex15F8VPN2 2785 aa14.52□□□□□ -0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trbv13-2A0A140T8N6 113 aa14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pfn2Q9JJV2 140 aa14.52□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv6-13A0A0G2JGY3 119 aa14.51□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dad1P61804 113 aa14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AtrQ9JKK8 2635 aa14.5□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Xlr5cQ9JJR2 179 aa14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 B230359F08RikA0A0B4J1K3 109 aa14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf740Q6NZQ6 180 aa14.49□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bles03Q8VD62 251 aa14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv1-117A0A140T8M0 119 aa14.48□□□□□ -0.09
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv3-9A0A140T8P4 119 aa14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mzt1Q8BUR9 78 aa14.46□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TeppQ6IMH0 216 aa14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lyrm7Q9DA03 104 aa14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa14.45□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem213Q08EA8 116 aa14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Anapc13Q8R034 74 aa14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Higd2aQ9CQJ1 106 aa14.44□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cks1bP61025 79 aa14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav9n-4A0A075B631 113 aa14.42□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prss58Q8BW11 241 aa14.41□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pglyrp4Q0VB07 374 aa14.4□□□□□ -0.1
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930524J08RikQ9CUJ5 163 aa14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcl1b3P56842 122 aa14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Znf414Q9DCK4 299 aa14.39□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Prh1P05142 261 aa14.38□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Acyp1P56376 99 aa14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem86bQ497J1 226 aa14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk11Q9QYN3 276 aa14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Notch2O35516 2470 aa14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv8-13A0A075B5Y0 101 aa14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb29Q8BGW9 78 aa14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav13-1A0A075B644 110 aa14.36□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Stab1Q8R4Y4 2571 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 C530025M09RikF6RGA8 229 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01896 185 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smim26Q3V460 107 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 5730596B20RikQ8BQ08 205 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spry2Q9QXV8 315 aa14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP14.35□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv1-56A0A0A6YXG2 117 aa14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm867A0A1W2P7T4 151 aa14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MrapQ9D159 127 aa14.34□□□□□ -0.11
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 E130114P18RikF6S0S7 154 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7138L7N2C3 230 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Dnal4Q9DCM4 105 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm3238W4VSP7 230 aa14.33□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hivep1Q03172 2688 aa14.32□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv8-11A0A075B5X4 119 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 PolqQ8CGS6 2544 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Atp5eP56382 52 aa14.31□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nsd1O88491 2588 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv8-18A0A0B4J1J3 123 aa14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap11-1E9Q2E9 183 aa14.3□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5153P01627 120 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcl1b5P56845 121 aa14.29□□□□□ -0.12
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm5142Q8C5X9 133 aa14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 65.6 ms