Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Igkv1-99F6XWB2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Igkv1-99F6XWB2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igkv1-99F6XWB2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igkv1-99F6XWB2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Igkv1-99F6XWB2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Igkv1-99F6XWB2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Igkv1-99F6XWB2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igkv1-99F6XWB2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Igkv1-99F6XWB2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Igkv1-99F6XWB2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Igkv1-99F6XWB2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Igkv1-99F6XWB2 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Igkv1-99F6XWB2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Igkv1-99F6XWB2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Igkv1-99F6XWB2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Igkv1-99F6XWB2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Igkv1-99F6XWB2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Igkv1-99F6XWB2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Igkv1-99F6XWB2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Igkv1-99F6XWB2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Igkv1-99F6XWB2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Igkv1-99F6XWB2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Igkv1-99F6XWB2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Igkv1-99F6XWB2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Igkv1-99F6XWB2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Igkv1-99F6XWB2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Igkv1-99F6XWB2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Igkv1-99F6XWB2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Igkv1-99F6XWB2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Igkv1-99F6XWB2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Igkv1-99F6XWB2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Igkv1-99F6XWB2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igkv1-99F6XWB2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Igkv1-99F6XWB2 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Igkv1-99F6XWB2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Igkv1-99F6XWB2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Igkv1-99F6XWB2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Igkv1-99F6XWB2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Igkv1-99F6XWB2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Igkv1-99F6XWB2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Igkv1-99F6XWB2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Igkv1-99F6XWB2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Igkv1-99F6XWB2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Igkv1-99F6XWB2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Igkv1-99F6XWB2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Igkv1-99F6XWB2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Igkv1-99F6XWB2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Igkv1-99F6XWB2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Igkv1-99F6XWB2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Igkv1-99F6XWB2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Igkv1-99F6XWB2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Igkv1-99F6XWB2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Igkv1-99F6XWB2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Igkv1-99F6XWB2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Igkv1-99F6XWB2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Igkv1-99F6XWB2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Igkv1-99F6XWB2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Igkv1-99F6XWB2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Igkv1-99F6XWB2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Igkv1-99F6XWB2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Igkv1-99F6XWB2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Igkv1-99F6XWB2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Igkv1-99F6XWB2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Igkv1-99F6XWB2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Igkv1-99F6XWB2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Igkv1-99F6XWB2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Igkv1-99F6XWB2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Igkv1-99F6XWB2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igkv1-99F6XWB2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Igkv1-99F6XWB2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Igkv1-99F6XWB2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Igkv1-99F6XWB2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Igkv1-99F6XWB2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Igkv1-99F6XWB2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igkv1-99F6XWB2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Igkv1-99F6XWB2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Igkv1-99F6XWB2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Igkv1-99F6XWB2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igkv1-99F6XWB2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Igkv1-99F6XWB2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Igkv1-99F6XWB2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Igkv1-99F6XWB2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Igkv1-99F6XWB2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Igkv1-99F6XWB2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Igkv1-99F6XWB2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms