Protein–RNA interactions for Protein: A0A140T8N6

Trbv13-2, T cell receptor beta, variable 13-2 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Trbv13-2A0A140T8N6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trbv13-2A0A140T8N6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trbv13-2A0A140T8N6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trbv13-2A0A140T8N6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Trbv13-2A0A140T8N6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Trbv13-2A0A140T8N6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trbv13-2A0A140T8N6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Trbv13-2A0A140T8N6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trbv13-2A0A140T8N6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Trbv13-2A0A140T8N6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Trbv13-2A0A140T8N6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Trbv13-2A0A140T8N6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Trbv13-2A0A140T8N6 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Trbv13-2A0A140T8N6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Trbv13-2A0A140T8N6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trbv13-2A0A140T8N6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trbv13-2A0A140T8N6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trbv13-2A0A140T8N6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trbv13-2A0A140T8N6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trbv13-2A0A140T8N6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trbv13-2A0A140T8N6 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trbv13-2A0A140T8N6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv13-2A0A140T8N6 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Trbv13-2A0A140T8N6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Trbv13-2A0A140T8N6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Trbv13-2A0A140T8N6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trbv13-2A0A140T8N6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Trbv13-2A0A140T8N6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Trbv13-2A0A140T8N6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trbv13-2A0A140T8N6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trbv13-2A0A140T8N6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trbv13-2A0A140T8N6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv13-2A0A140T8N6 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Trbv13-2A0A140T8N6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trbv13-2A0A140T8N6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trbv13-2A0A140T8N6 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trbv13-2A0A140T8N6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trbv13-2A0A140T8N6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trbv13-2A0A140T8N6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trbv13-2A0A140T8N6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Trbv13-2A0A140T8N6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trbv13-2A0A140T8N6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trbv13-2A0A140T8N6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trbv13-2A0A140T8N6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trbv13-2A0A140T8N6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trbv13-2A0A140T8N6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trbv13-2A0A140T8N6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trbv13-2A0A140T8N6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trbv13-2A0A140T8N6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trbv13-2A0A140T8N6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trbv13-2A0A140T8N6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trbv13-2A0A140T8N6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv13-2A0A140T8N6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Trbv13-2A0A140T8N6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Trbv13-2A0A140T8N6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trbv13-2A0A140T8N6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trbv13-2A0A140T8N6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trbv13-2A0A140T8N6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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