Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW11

Prss58, Putative inactive serine protease 58, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss58Q8BW11 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prss58Q8BW11 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prss58Q8BW11 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prss58Q8BW11 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss58Q8BW11 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss58Q8BW11 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Prss58Q8BW11 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Prss58Q8BW11 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Prss58Q8BW11 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Prss58Q8BW11 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prss58Q8BW11 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Prss58Q8BW11 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prss58Q8BW11 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss58Q8BW11 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prss58Q8BW11 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prss58Q8BW11 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss58Q8BW11 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss58Q8BW11 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Prss58Q8BW11 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prss58Q8BW11 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prss58Q8BW11 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Prss58Q8BW11 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prss58Q8BW11 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prss58Q8BW11 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prss58Q8BW11 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prss58Q8BW11 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prss58Q8BW11 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prss58Q8BW11 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Prss58Q8BW11 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Prss58Q8BW11 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Prss58Q8BW11 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Prss58Q8BW11 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prss58Q8BW11 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prss58Q8BW11 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss58Q8BW11 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss58Q8BW11 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prss58Q8BW11 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Prss58Q8BW11 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Prss58Q8BW11 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Prss58Q8BW11 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Prss58Q8BW11 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Prss58Q8BW11 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prss58Q8BW11 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prss58Q8BW11 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prss58Q8BW11 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prss58Q8BW11 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prss58Q8BW11 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Prss58Q8BW11 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prss58Q8BW11 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Prss58Q8BW11 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prss58Q8BW11 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prss58Q8BW11 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prss58Q8BW11 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prss58Q8BW11 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prss58Q8BW11 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prss58Q8BW11 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prss58Q8BW11 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prss58Q8BW11 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Prss58Q8BW11 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Prss58Q8BW11 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Prss58Q8BW11 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Prss58Q8BW11 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Prss58Q8BW11 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Prss58Q8BW11 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss58Q8BW11 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Prss58Q8BW11 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Prss58Q8BW11 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Prss58Q8BW11 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Prss58Q8BW11 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prss58Q8BW11 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prss58Q8BW11 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Prss58Q8BW11 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Prss58Q8BW11 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Prss58Q8BW11 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Prss58Q8BW11 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Prss58Q8BW11 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms