Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXG7

Vmo1, Vitelline membrane outer layer protein 1 homolog, mousemouse

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmo1Q5SXG7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Vmo1Q5SXG7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmo1Q5SXG7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmo1Q5SXG7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmo1Q5SXG7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vmo1Q5SXG7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vmo1Q5SXG7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vmo1Q5SXG7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vmo1Q5SXG7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vmo1Q5SXG7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Vmo1Q5SXG7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vmo1Q5SXG7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Vmo1Q5SXG7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmo1Q5SXG7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmo1Q5SXG7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmo1Q5SXG7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmo1Q5SXG7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vmo1Q5SXG7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmo1Q5SXG7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmo1Q5SXG7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vmo1Q5SXG7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vmo1Q5SXG7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Vmo1Q5SXG7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Vmo1Q5SXG7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Vmo1Q5SXG7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Vmo1Q5SXG7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Vmo1Q5SXG7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Vmo1Q5SXG7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Vmo1Q5SXG7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Vmo1Q5SXG7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Vmo1Q5SXG7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Vmo1Q5SXG7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Vmo1Q5SXG7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmo1Q5SXG7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Vmo1Q5SXG7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Vmo1Q5SXG7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Vmo1Q5SXG7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Vmo1Q5SXG7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Vmo1Q5SXG7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Vmo1Q5SXG7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmo1Q5SXG7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmo1Q5SXG7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmo1Q5SXG7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Vmo1Q5SXG7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Vmo1Q5SXG7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Vmo1Q5SXG7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmo1Q5SXG7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Vmo1Q5SXG7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmo1Q5SXG7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Vmo1Q5SXG7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Vmo1Q5SXG7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Vmo1Q5SXG7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmo1Q5SXG7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Vmo1Q5SXG7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmo1Q5SXG7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Vmo1Q5SXG7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Vmo1Q5SXG7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Vmo1Q5SXG7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Vmo1Q5SXG7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Vmo1Q5SXG7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Vmo1Q5SXG7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Vmo1Q5SXG7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Vmo1Q5SXG7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmo1Q5SXG7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Vmo1Q5SXG7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Vmo1Q5SXG7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Vmo1Q5SXG7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Vmo1Q5SXG7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmo1Q5SXG7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Vmo1Q5SXG7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Vmo1Q5SXG7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmo1Q5SXG7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Vmo1Q5SXG7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmo1Q5SXG7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Vmo1Q5SXG7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Vmo1Q5SXG7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Vmo1Q5SXG7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Vmo1Q5SXG7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Vmo1Q5SXG7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Vmo1Q5SXG7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmo1Q5SXG7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Vmo1Q5SXG7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Vmo1Q5SXG7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Vmo1Q5SXG7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Vmo1Q5SXG7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Vmo1Q5SXG7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Vmo1Q5SXG7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vmo1Q5SXG7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
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