RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 MUC3AQ02505 3323 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMA5O15230 3695 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP0.48□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.48□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 LOC400499M0QZD8 3231 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 NF1P21359 2839 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 APOBP04114 4563 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 COL7A1Q02388 2944 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAH9Q9NYC9 4486 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPART-AS1P0CW21 52 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 RPS29P62273 56 aaKnown RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 DMDP11532 3685 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATRQ13535 2644 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 UNC79Q9P2D8 2635 aa0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.47□□□□□ -2.33
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITPR1Q14643 2758 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP24Q9UPU5 2620 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRBAP50851 2863 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 XIRP2A4UGR9 3374 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 A0A096LPF7 62 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CACNA1AO00555 2505 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 LRRK2Q5S007 2527 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITPR3Q14573 2671 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAH17Q9UFH2 4485 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSMD1Q96PZ7 3565 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAM186AA6NE01 2351 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 UTRNP46939 3433 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 STAB1Q9NY15 2570 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 TACC2O95359 2948 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CENPFP49454 3210 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 FLNCQ14315 2725 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP34Q70CQ2 3546 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMA3Q16787 3333 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 KALRNO60229 2985 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMA1P25391 3075 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 PRM1P04553 51 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 DEFB133Q30KQ1 61 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CUBNO60494 3623 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 FAT1Q14517 4588 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHD8Q9HCK8 2581 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CD52P31358 61 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPG11Q96JI7 2443 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 TENM3Q9P273 2699 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 HIVEP1P15822 2718 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 EP400Q96L91 3159 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 MTORP42345 2549 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 MUC5ACP98088 5654 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 CSMD2Q7Z408 3487 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 LPAP08519 4548 aa0.41□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 TGP01266 2768 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 ASPMQ8IZT6 3477 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 PCNTO95613 3336 aa0.4□□□□□ -2.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACACBO00763 2458 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZANQ9Y493 2812 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 ACANP16112 2415 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 MUC17Q685J3 4493 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFAP46Q8IYW2 2715 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 SVEP1Q4LDE5 3571 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 UNC80Q8N2C7 3258 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 CENPEQ02224 2701 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 VPS13CQ709C8 3753 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 ITPR2Q14571 2701 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 TEX15Q9BXT5 2789 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 VCANP13611 3396 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 MT1AP04731 61 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPRR2DP22532 72 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 BRCA2P51587 3418 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 HERC1Q15751 4861 aa0.38□□□□□ -2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms