RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516876.1

RNU6-928P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 928, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-928P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHIC1Q5VXU3 224 aa10.06□□□□□ -0.8
RNU6-928P-201ENST00000516876 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
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RNU6-928P-201ENST00000516876 PLPPR3Q6T4P5 718 aa8.46□□□□□ -1.06
RNU6-928P-201ENST00000516876 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
RNU6-928P-201ENST00000516876 EHMT2Q96KQ7 1210 aa7.87□□□□□ -1.15
RNU6-928P-201ENST00000516876 KCNA4P22459 653 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-928P-201ENST00000516876 ADRA2BP18089 450 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP6R1Q9UPN7 881 aa7.59□□□□□ -1.19
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RNU6-928P-201ENST00000516876 CSRNP3Q8WYN3 585 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-928P-201ENST00000516876 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa7.46□□□□□ -1.22
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RNU6-928P-201ENST00000516876 SLC24A1O60721 1099 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-928P-201ENST00000516876 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
RNU6-928P-201ENST00000516876 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-928P-201ENST00000516876 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB22O15209 634 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-928P-201ENST00000516876 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJC5BQ9UF47 199 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-928P-201ENST00000516876 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
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RNU6-928P-201ENST00000516876 MSH5O43196 834 aa6.9□□□□□ -1.3
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATXN8OSP0DMR3 200 aa6.89□□□□□ -1.31
RNU6-928P-201ENST00000516876 FKBP8Q14318 412 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-928P-201ENST00000516876 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
RNU6-928P-201ENST00000516876 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
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RNU6-928P-201ENST00000516876 DMRT2Q9Y5R5 561 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 FBXO3Q9UK99 471 aa6.59□□□□□ -1.35
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLCB2Q00722 1185 aa6.55□□□□□ -1.36
RNU6-928P-201ENST00000516876 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RNU6-928P-201ENST00000516876 BCANQ96GW7 911 aa6.5□□□□□ -1.37
RNU6-928P-201ENST00000516876 APLP2Q06481 763 aa6.46□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 VSIG10Q8N0Z9 540 aa6.42□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCAF8L2P0C7V8 631 aa6.4□□□□□ -1.38
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPDYE4A6NLX3 237 aa6.39□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 VASPP50552 380 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 DCAF8L1A6NGE4 600 aa6.37□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 TAOK2Q9UL54 1235 aa6.35□□□□□ -1.39
RNU6-928P-201ENST00000516876 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
RNU6-928P-201ENST00000516876 FBLN2P98095 1184 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-928P-201ENST00000516876 PROM2Q8N271 834 aa6.32□□□□□ -1.4
RNU6-928P-201ENST00000516876 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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RNU6-928P-201ENST00000516876 PKD2Q13563 968 aa6.24□□□□□ -1.41
RNU6-928P-201ENST00000516876 TPRNQ4KMQ1 711 aa6.23□□□□□ -1.41
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPOCK2Q92563 424 aa6.21□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 KLHL34Q8N239 644 aa6.2□□□□□ -1.42
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RNU6-928P-201ENST00000516876 ERICH6Q7L0X2 663 aa6.19□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 CFAP44Q96MT7 982 aa6.18□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 STAG3Q9UJ98 1225 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.16□□□□□ -1.42
RNU6-928P-201ENST00000516876 NBR1Q14596 966 aa6.13□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 POLA2Q14181 598 aa6.1□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLEKHG5O94827 1062 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 PLCD3Q8N3E9 789 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 TRIM41Q8WV44 630 aa6.09□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RNU6-928P-201ENST00000516876 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP6.08□□□□□ -1.44
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RNU6-928P-201ENST00000516876 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa6.05□□□□□ -1.44
RNU6-928P-201ENST00000516876 RGL2O15211 777 aa6.04□□□□□ -1.44
RNU6-928P-201ENST00000516876 CHGAP10645 457 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RNU6-928P-201ENST00000516876 MIER1Q8N108 512 aa6.03□□□□□ -1.44
RNU6-928P-201ENST00000516876 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa6.02□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 CAPN15O75808 1086 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 ARXQ96QS3 562 aa6.01□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.99□□□□□ -1.45
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RNU6-928P-201ENST00000516876 SPDYE2Q495Y8 402 aa5.98□□□□□ -1.45
RNU6-928P-201ENST00000516876 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.98□□□□□ -1.45
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RNU6-928P-201ENST00000516876 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 GSE1Q14687 1217 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 TMEM132AQ24JP5 1023 aa5.95□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa5.93□□□□□ -1.46
RNU6-928P-201ENST00000516876 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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