RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449182.1

PTPRZ1-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 4,627 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-202ENST00000449182 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 TGP01266 2768 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 RYR2Q92736 4967 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 ATRQ13535 2644 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRZ1-202ENST00000449182 PKD1P98161 4303 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-3P60369 221 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH10Q8IVF4 4471 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 STAB2Q8WWQ8 2551 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 TENM3Q9P273 2699 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 PKHD1P08F94 4074 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 TENM2Q9NT68 2774 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 MGAM2Q2M2H8 2515 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 NOTCH1P46531 2555 aa2.9□□□□□ -1.94
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRZ1-202ENST00000449182 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa2.89□□□□□ -1.95
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-2P60368 255 aa2.88□□□□□ -1.95
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
PTPRZ1-202ENST00000449182 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.84□□□□□ -1.95
PTPRZ1-202ENST00000449182 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.82□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-11P60412 298 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 HSPG2P98160 4391 aa2.81□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.8□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.79□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 HERC2O95714 4834 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRZ1-202ENST00000449182 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE4AQ5TA78 99 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 RYR1P21817 5038 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.73□□□□□ -1.97
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-1P60331 282 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 FAT1Q14517 4588 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 MYCBP2O75592 4640 aa2.68□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 A0A1B0GVY2 172 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 TNXBP22105 4242 aa2.65□□□□□ -1.98
PTPRZ1-202ENST00000449182 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 HERC1Q15751 4861 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE3BQ5TA77 95 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP12-3P60328 96 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-5P60370 271 aa2.56□□□□□ -2
PTPRZ1-202ENST00000449182 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.55□□□□□ -2
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-10P60014 251 aa2.55□□□□□ -2
PTPRZ1-202ENST00000449182 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 LPAP08519 4548 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRZ1-202ENST00000449182 MUC2Q02817 5179 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP12-4P60329 112 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE3AQ5TA76 89 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 RNF213Q63HN8 5207 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP10-12P60413 245 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 LRP2P98164 4655 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRZ1-202ENST00000449182 MUC17Q685J3 4493 aa2.36□□□□□ -2.03
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE1DQ5T752 114 aa2.33□□□□□ -2.04
PTPRZ1-202ENST00000449182 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1-202ENST00000449182 MT1HL1P0DM35 61 aa2.31□□□□□ -2.04
PTPRZ1-202ENST00000449182 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.26□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE1FQ5T754 118 aa2.25□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.24□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.23□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.22□□□□□ -2.05
PTPRZ1-202ENST00000449182 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.21□□□□□ -2.06
PTPRZ1-202ENST00000449182 PRM1P04553 51 aa2.19□□□□□ -2.06
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE1EQ5T753 118 aa2.18□□□□□ -2.06
PTPRZ1-202ENST00000449182 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.8 ms