RNA–Protein interactions for RNA: YLL047W

YLL047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YLL047W, Length 384 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YLL047WYLL047W DCW1P36091 449 aa9.5□□□□□ -0.89
YLL047WYLL047W IOC2Q12072 812 aa9.5□□□□□ -0.89
YLL047WYLL047W TRP5P00931 707 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YLL047WYLL047W JIP4Q03361 876 aa9.48□□□□□ -0.89
YLL047WYLL047W YGR273CP53329 174 aa9.45□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W NST1P53935 1240 aa9.45□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W SOL3P38858 249 aa9.43□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W YEL023CP39992 682 aa9.43□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W AI4P03878 556 aa9.42□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W PTC4P38089 393 aa9.42□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W LDB19Q12502 818 aa9.41□□□□□ -0.9
YLL047WYLL047W MPH3P0CE00 602 aa9.39□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W SEC61P32915 480 aa9.39□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W DAN4P47179 1161 aa9.38□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W FKH1P40466 484 aa9.37□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W RTG1P32607 177 aa9.35□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W UBP14P38237 781 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
YLL047WYLL047W PBS2P08018 668 aa9.33□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W DSF2P38213 736 aa9.33□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W KEX1P09620 729 aa9.32□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W VHR2P40041 505 aa9.32□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W LEU3P08638 886 aa9.31□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W COX6P00427 148 aa9.3□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W YDR090CQ03193 310 aa9.29□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W ILV3P39522 585 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
YLL047WYLL047W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W RAD54P32863 898 aa9.27□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W NCR1Q12200 1170 aa9.27□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W KIC1P38692 1080 aa9.25□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data9.23□□□□□ -0.93not detected
YLL047WYLL047W YDL129WQ07555 291 aa9.23□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W MAM3Q12296 706 aa9.23□□□□□ -0.93
YLL047WYLL047W SLI15P38283 698 aa9.2□□□□□ -0.94
YLL047WYLL047W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
YLL047WYLL047W PML39Q03760 334 aa9.19□□□□□ -0.94
YLL047WYLL047W IES2P40154 320 aa9.14□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W BMT6Q12291 365 aa9.14□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W YJL171CP46992 396 aa9.13□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W ORC6P38826 435 aa9.12□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W NUP42P49686 430 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W MID1P41821 548 aa9.1□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W DPL1Q05567 589 aa9.1□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W SAP30P38429 201 aa9.09□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W PEX29Q03370 554 aa9.09□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W MPC54Q08550 464 aa9.09□□□□□ -0.95
YLL047WYLL047W CSC1Q06538 782 aa9.08□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W ARH1P48360 493 aa9.06□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W TFB4Q12004 338 aa9.05□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W CDC73Q06697 393 aa9.04□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W ISU2Q12056 156 aa9.03□□□□□ -0.96
YLL047WYLL047W DIT2P21595 489 aa9.01□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W LEO1P38439 464 aa9.01□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W HAP5Q02516 242 aa9.01□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W AIM7Q12156 149 aa9.01□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W CLB5P30283 435 aa9□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W PRE3P38624 215 aa8.99□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W NMA111P53920 997 aa8.99□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W RGR1P19263 1082 aa8.97□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W BNI4P53858 892 aa8.97□□□□□ -0.97
YLL047WYLL047W PEX21P50091 288 aa8.96□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W SPT23P35210 1082 aa8.95□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W GLC3P32775 704 aa8.92□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W ATF2P53296 535 aa8.91□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W YDR344CQ05510 147 aa8.91□□□□□ -0.98
YLL047WYLL047W TEA1P47988 759 aa8.88□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W YPR109WQ06104 294 aa8.88□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W YRR1Q12172 810 aa8.87□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W PTC2P39966 464 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
YLL047WYLL047W KIN1P13185 1064 aa8.83□□□□□ -1
YLL047WYLL047W RAM1P22007 431 aa8.82□□□□□ -1
YLL047WYLL047W NUD1P32336 851 aa8.8□□□□□ -1
YLL047WYLL047W PDR1P12383 1068 aa8.78□□□□□ -1
YLL047WYLL047W SIT4P20604 311 aa8.78□□□□□ -1
YLL047WYLL047W RTF1P53064 558 aa8.78□□□□□ -1
YLL047WYLL047W NPL4P33755 580 aa8.76□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W NIS1P53939 407 aa8.75□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W BCK2P33306 851 aa8.74□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W STR2P47164 639 aa8.73□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W HST2P53686 357 aa8.73□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W YPR015CQ12531 247 aa8.73□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W ISM1P48526 1002 aa8.72□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W YMR196WQ04336 1088 aa8.72□□□□□ -1.01
YLL047WYLL047W FPK1P53739 893 aa8.71□□□□□ -1.02
YLL047WYLL047W SAS4Q04003 481 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 56.9 ms