RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR070WYKR070W YPR148CQ06523 435 aa8.54□□□□□ -1.04
YKR070WYKR070W SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
YKR070WYKR070W LDB19Q12502 818 aa8.51□□□□□ -1.05
YKR070WYKR070W YEL023CP39992 682 aa8.5□□□□□ -1.05
YKR070WYKR070W CKB1P43639 278 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR070WYKR070W IOC2Q12072 812 aa8.49□□□□□ -1.05
YKR070WYKR070W JIP4Q03361 876 aa8.46□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W PTC4P38089 393 aa8.45□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W YGR273CP53329 174 aa8.45□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W RTG1P32607 177 aa8.44□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W REF2P42073 533 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W SOL3P38858 249 aa8.42□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W VHR2P40041 505 aa8.42□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
YKR070WYKR070W SEC61P32915 480 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W NCR1Q12200 1170 aa8.38□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W AI4P03878 556 aa8.37□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W PBS2P08018 668 aa8.37□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W MPH3P0CE00 602 aa8.36□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W KIC1P38692 1080 aa8.36□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W DAN4P47179 1161 aa8.36□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W FKH1P40466 484 aa8.35□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W NST1P53935 1240 aa8.35□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W KEX1P09620 729 aa8.34□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
YKR070WYKR070W RAD54P32863 898 aa8.33□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W YJL171CP46992 396 aa8.33□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W PML39Q03760 334 aa8.31□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W COX6P00427 148 aa8.29□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W ILV3P39522 585 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W MAM3Q12296 706 aa8.28□□□□□ -1.08
YKR070WYKR070W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
YKR070WYKR070W YDR090CQ03193 310 aa8.27□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W YDL129WQ07555 291 aa8.27□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W DSF2P38213 736 aa8.26□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W PEX29Q03370 554 aa8.26□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W SAP30P38429 201 aa8.25□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W MID1P41821 548 aa8.25□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W BMT6Q12291 365 aa8.25□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W SLI15P38283 698 aa8.24□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YKR070WYKR070W IES2P40154 320 aa8.2□□□□□ -1.1
YKR070WYKR070W LEU3P08638 886 aa8.17□□□□□ -1.1
YKR070WYKR070W DPL1Q05567 589 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR070WYKR070W CDC73Q06697 393 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR070WYKR070W MPC54Q08550 464 aa8.15□□□□□ -1.1
YKR070WYKR070W PEX21P50091 288 aa8.13□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W DIT2P21595 489 aa8.1□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W NUP42P49686 430 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W NMA111P53920 997 aa8.1□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W ORC6P38826 435 aa8.09□□□□□ -1.11
YKR070WYKR070W ARH1P48360 493 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W HAP5Q02516 242 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W CSC1Q06538 782 aa8.08□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W ISU2Q12056 156 aa8.07□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W PRE3P38624 215 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W ATF2P53296 535 aa8.05□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W RPN1P38764 993 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W GLC3P32775 704 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W MVP1P40959 511 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W YDR344CQ05510 147 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W TFB4Q12004 338 aa8.03□□□□□ -1.12
YKR070WYKR070W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W RGR1P19263 1082 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W SPT23P35210 1082 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W YRR1Q12172 810 aa8.01□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W YPR109WQ06104 294 aa7.99□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W TEA1P47988 759 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W BNI4P53858 892 aa7.98□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W PTC2P39966 464 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YKR070WYKR070W CLB5P30283 435 aa7.96□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W LEO1P38439 464 aa7.96□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W AIM7Q12156 149 aa7.94□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W PDR1P12383 1068 aa7.93□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W NPL4P33755 580 aa7.92□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W KIN1P13185 1064 aa7.9□□□□□ -1.14
YKR070WYKR070W NUD1P32336 851 aa7.89□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W VRP1P37370 817 aa7.87□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W YMR196WQ04336 1088 aa7.87□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W BCK2P33306 851 aa7.84□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W NIS1P53939 407 aa7.84□□□□□ -1.15
YKR070WYKR070W RAM1P22007 431 aa7.82□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W GYP1Q08484 637 aa7.82□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W STR2P47164 639 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W ISM1P48526 1002 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W YPR015CQ12531 247 aa7.81□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W FPK1P53739 893 aa7.8□□□□□ -1.16
YKR070WYKR070W KEX2P13134 814 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 36.8 ms