RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.79■■■■□ 3.64
SYT6-210ENST00000641643 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.78■■■■□ 3.64
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa37.77■■■■□ 3.64
SYT6-210ENST00000641643 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.69■■■■□ 3.62
SYT6-210ENST00000641643 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
SYT6-210ENST00000641643 IQGAP2Q13576 1575 aa37.5■■■■□ 3.59
SYT6-210ENST00000641643 PRXQ9BXM0 1461 aa37.47■■■■□ 3.59
SYT6-210ENST00000641643 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.46■■■■□ 3.59
SYT6-210ENST00000641643 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.44■■■■□ 3.58
SYT6-210ENST00000641643 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.44■■■■□ 3.58
SYT6-210ENST00000641643 EEA1Q15075 1411 aa37.42■■■■□ 3.58
SYT6-210ENST00000641643 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SYT6-210ENST00000641643 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
SYT6-210ENST00000641643 PTPRGP23470 1445 aa37.32■■■■□ 3.56
SYT6-210ENST00000641643 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.31■■■■□ 3.56
SYT6-210ENST00000641643 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.28■■■■□ 3.56
SYT6-210ENST00000641643 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.28■■■■□ 3.56
SYT6-210ENST00000641643 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.26■■■■□ 3.55
SYT6-210ENST00000641643 DISP1Q96F81 1524 aa37.24■■■■□ 3.55
SYT6-210ENST00000641643 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.15■■■■□ 3.54
SYT6-210ENST00000641643 KIAA0556O60303 1618 aa37.13■■■■□ 3.53
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA3Q08378 1498 aa37.12■■■■□ 3.53
SYT6-210ENST00000641643 UACAQ9BZF9 1416 aa37.04■■■■□ 3.52
SYT6-210ENST00000641643 MAPKBP1O60336 1514 aa36.99■■■■□ 3.51
SYT6-210ENST00000641643 KIF21BO75037 1637 aa36.97■■■■□ 3.51
SYT6-210ENST00000641643 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.97■■■■□ 3.51
SYT6-210ENST00000641643 ABCC2Q92887 1545 aa36.97■■■■□ 3.51
SYT6-210ENST00000641643 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.91■■■■□ 3.5
SYT6-210ENST00000641643 P3H3Q8IVL6 736 aa36.91■■■■□ 3.5
SYT6-210ENST00000641643 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.89■■■■□ 3.5
SYT6-210ENST00000641643 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
SYT6-210ENST00000641643 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.88■■■■□ 3.49
SYT6-210ENST00000641643 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
SYT6-210ENST00000641643 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.82■■■■□ 3.49
SYT6-210ENST00000641643 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.82■■■■□ 3.48
SYT6-210ENST00000641643 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.79■■■■□ 3.48
SYT6-210ENST00000641643 SAMD9Q5K651 1589 aa36.78■■■■□ 3.48
SYT6-210ENST00000641643 ASXL2Q76L83 1435 aa36.77■■■■□ 3.48
SYT6-210ENST00000641643 DIP2BQ9P265 1576 aa36.77■■■■□ 3.48
SYT6-210ENST00000641643 ABCA8O94911 1581 aa36.73■■■■□ 3.47
SYT6-210ENST00000641643 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
SYT6-210ENST00000641643 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.63■■■■□ 3.45
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.62■■■■□ 3.45
SYT6-210ENST00000641643 ARID3CA6NKF2 412 aa36.57■■■■□ 3.44
SYT6-210ENST00000641643 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.55■■■■□ 3.44
SYT6-210ENST00000641643 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
SYT6-210ENST00000641643 GLI2P10070 1586 aa36.53■■■■□ 3.44
SYT6-210ENST00000641643 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.5■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 TSPOAP1O95153 1857 aa36.5■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 ATP10BO94823 1461 aa36.47■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 KCNH8Q96L42 1107 aa36.46■■■■□ 3.43
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.4■■■■□ 3.42
SYT6-210ENST00000641643 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
SYT6-210ENST00000641643 FMN1Q68DA7 1419 aa36.34■■■■□ 3.41
SYT6-210ENST00000641643 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.33■■■■□ 3.41
SYT6-210ENST00000641643 KDM6BO15054 1643 aa36.29■■■■□ 3.4
SYT6-210ENST00000641643 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.28■■■■□ 3.4
SYT6-210ENST00000641643 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.28■■■■□ 3.4
SYT6-210ENST00000641643 CD109Q6YHK3 1445 aa36.27■■■■□ 3.4
SYT6-210ENST00000641643 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.4
SYT6-210ENST00000641643 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.25■■■■□ 3.39
SYT6-210ENST00000641643 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.21■■■■□ 3.39
SYT6-210ENST00000641643 CLIP1P30622 1438 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT6-210ENST00000641643 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.16■■■■□ 3.38
SYT6-210ENST00000641643 HECW1Q76N89 1606 aa36.14■■■■□ 3.38
SYT6-210ENST00000641643 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.1■■■■□ 3.37
SYT6-210ENST00000641643 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.08■■■■□ 3.37
SYT6-210ENST00000641643 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.37
SYT6-210ENST00000641643 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.03■■■■□ 3.36
SYT6-210ENST00000641643 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36■■■■□ 3.35
SYT6-210ENST00000641643 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.94■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.93■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.93■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 CEP162Q5TB80 1403 aa35.92■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.91■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.89■■■■□ 3.34
SYT6-210ENST00000641643 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.88■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 NEO1Q92859 1461 aa35.87■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.85■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.84■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.83■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.83■■■■□ 3.33
SYT6-210ENST00000641643 FANCAO15360 1455 aa35.76■■■■□ 3.32
SYT6-210ENST00000641643 KIF14Q15058 1648 aa35.76■■■■□ 3.32
SYT6-210ENST00000641643 RAPGEF3O95398 923 aa35.73■■■■□ 3.31
SYT6-210ENST00000641643 PLCH2O75038 1416 aa35.73■■■■□ 3.31
SYT6-210ENST00000641643 AKNAQ7Z591 1439 aa35.72■■■■□ 3.31
SYT6-210ENST00000641643 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.71■■■■□ 3.31
SYT6-210ENST00000641643 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.67■■■■□ 3.3
SYT6-210ENST00000641643 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
SYT6-210ENST00000641643 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.63■■■■□ 3.29
SYT6-210ENST00000641643 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.6■■■■□ 3.29
SYT6-210ENST00000641643 ADGRL1O94910 1474 aa35.58■■■■□ 3.29
SYT6-210ENST00000641643 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.57■■■■□ 3.28
SYT6-210ENST00000641643 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.57■■■■□ 3.28
SYT6-210ENST00000641643 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.55■■■■□ 3.28
SYT6-210ENST00000641643 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.53■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms