RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640939.1

GRAMD1B-217, Transcript of GRAM domain containing 1B, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GRAMD1B, Length 1,212 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1B-217ENST00000640939 JPH4Q96JJ6 628 aa38.18■■■■□ 3.7
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa38.13■■■■□ 3.69
GRAMD1B-217ENST00000640939 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa38.04■■■■□ 3.68
GRAMD1B-217ENST00000640939 IQGAP2Q13576 1575 aa37.9■■■■□ 3.66
GRAMD1B-217ENST00000640939 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.86■■■■□ 3.65
GRAMD1B-217ENST00000640939 PRXQ9BXM0 1461 aa37.84■■■■□ 3.65
GRAMD1B-217ENST00000640939 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.8■■■■□ 3.64
GRAMD1B-217ENST00000640939 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.76■■■■□ 3.64
GRAMD1B-217ENST00000640939 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.73■■■■□ 3.63
GRAMD1B-217ENST00000640939 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.72■■■■□ 3.63
GRAMD1B-217ENST00000640939 EEA1Q15075 1411 aa37.7■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.69■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 DISP1Q96F81 1524 aa37.66■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 PTPRGP23470 1445 aa37.65■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.64■■■■□ 3.62
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADCY10Q96PN6 1610 aa37.61■■■■□ 3.61
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIAA0556O60303 1618 aa37.55■■■■□ 3.6
GRAMD1B-217ENST00000640939 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.51■■■■□ 3.6
GRAMD1B-217ENST00000640939 GOLGA3Q08378 1498 aa37.43■■■■□ 3.58
GRAMD1B-217ENST00000640939 UACAQ9BZF9 1416 aa37.38■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAPKBP1O60336 1514 aa37.38■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIF21BO75037 1637 aa37.38■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa37.34■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC2Q92887 1545 aa37.34■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.33■■■■□ 3.57
GRAMD1B-217ENST00000640939 EHMT2Q96KQ7 1210 aa37.28■■■■□ 3.56
GRAMD1B-217ENST00000640939 P3H3Q8IVL6 736 aa37.27■■■■□ 3.56
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCC10Q5T3U5 1492 aa37.26■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 FAM69CQ0P6D2 419 aa37.23■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLB1Q6P1J6 1458 aa37.23■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 SAMD9Q5K651 1589 aa37.21■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 DIP2BQ9P265 1576 aa37.21■■■■□ 3.55
GRAMD1B-217ENST00000640939 KDM5BQ9UGL1 1544 aa37.17■■■■□ 3.54
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCA8O94911 1581 aa37.16■■■■□ 3.54
GRAMD1B-217ENST00000640939 ASXL2Q76L83 1435 aa37.15■■■■□ 3.54
GRAMD1B-217ENST00000640939 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
GRAMD1B-217ENST00000640939 UBTFP17480 764 aaKnown RBP37.12■■■■□ 3.53
GRAMD1B-217ENST00000640939 FHOD3Q2V2M9 1422 aa37.02■■■■□ 3.52
GRAMD1B-217ENST00000640939 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.97■■■■□ 3.51
GRAMD1B-217ENST00000640939 TSPOAP1O95153 1857 aa36.96■■■■□ 3.51
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARID3CA6NKF2 412 aa36.95■■■■□ 3.51
GRAMD1B-217ENST00000640939 GLI2P10070 1586 aa36.92■■■■□ 3.5
GRAMD1B-217ENST00000640939 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.92■■■■□ 3.5
GRAMD1B-217ENST00000640939 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.92■■■■□ 3.5
GRAMD1B-217ENST00000640939 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.9■■■■□ 3.5
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP10BO94823 1461 aa36.86■■■■□ 3.49
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.8■■■■□ 3.48
GRAMD1B-217ENST00000640939 KCNH8Q96L42 1107 aa36.79■■■■□ 3.48
GRAMD1B-217ENST00000640939 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
GRAMD1B-217ENST00000640939 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.78■■■■□ 3.48
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.77■■■■□ 3.48
GRAMD1B-217ENST00000640939 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.73■■■■□ 3.47
GRAMD1B-217ENST00000640939 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
GRAMD1B-217ENST00000640939 KDM6BO15054 1643 aa36.69■■■■□ 3.46
GRAMD1B-217ENST00000640939 FMN1Q68DA7 1419 aa36.63■■■■□ 3.45
GRAMD1B-217ENST00000640939 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.62■■■■□ 3.45
GRAMD1B-217ENST00000640939 CD109Q6YHK3 1445 aa36.59■■■■□ 3.45
GRAMD1B-217ENST00000640939 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.59■■■■□ 3.45
GRAMD1B-217ENST00000640939 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.57■■■■□ 3.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 HECW1Q76N89 1606 aa36.52■■■■□ 3.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa36.51■■■■□ 3.44
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.5■■■■□ 3.43
GRAMD1B-217ENST00000640939 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.49■■■■□ 3.43
GRAMD1B-217ENST00000640939 CLIP1P30622 1438 aa36.49■■■■□ 3.43
GRAMD1B-217ENST00000640939 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
GRAMD1B-217ENST00000640939 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP36.38■■■■□ 3.41
GRAMD1B-217ENST00000640939 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa36.37■■■■□ 3.41
GRAMD1B-217ENST00000640939 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa36.34■■■■□ 3.41
GRAMD1B-217ENST00000640939 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa36.31■■■■□ 3.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP36.3■■■■□ 3.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 TTC37Q6PGP7 1564 aa36.27■■■■□ 3.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 CEP162Q5TB80 1403 aa36.27■■■■□ 3.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
GRAMD1B-217ENST00000640939 FYCO1Q9BQS8 1478 aa36.24■■■■□ 3.39
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARAP3Q8WWN8 1544 aa36.2■■■■□ 3.39
GRAMD1B-217ENST00000640939 CCDC18Q5T9S5 1454 aa36.2■■■■□ 3.39
GRAMD1B-217ENST00000640939 NEO1Q92859 1461 aa36.2■■■■□ 3.39
GRAMD1B-217ENST00000640939 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
GRAMD1B-217ENST00000640939 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.17■■■■□ 3.38
GRAMD1B-217ENST00000640939 KIF14Q15058 1648 aa36.17■■■■□ 3.38
GRAMD1B-217ENST00000640939 FANCAO15360 1455 aa36.11■■■■□ 3.37
GRAMD1B-217ENST00000640939 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP36.11■■■■□ 3.37
GRAMD1B-217ENST00000640939 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.07■■■■□ 3.37
GRAMD1B-217ENST00000640939 RAPGEF3O95398 923 aa36.07■■■■□ 3.36
GRAMD1B-217ENST00000640939 PLCH2O75038 1416 aa36.07■■■■□ 3.36
GRAMD1B-217ENST00000640939 AKNAQ7Z591 1439 aa36.07■■■■□ 3.36
GRAMD1B-217ENST00000640939 MYO5CQ9NQX4 1742 aa36.05■■■■□ 3.36
GRAMD1B-217ENST00000640939 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.01■■■■□ 3.35
GRAMD1B-217ENST00000640939 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.99■■■■□ 3.35
GRAMD1B-217ENST00000640939 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
GRAMD1B-217ENST00000640939 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.93■■■■□ 3.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 RICTORQ6R327 1708 aa35.93■■■■□ 3.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.92■■■■□ 3.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 ADGRL1O94910 1474 aa35.92■■■■□ 3.34
GRAMD1B-217ENST00000640939 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms