RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		28.72	■■■□□ 2.19
SPIN3-238	ENST00000640421	NUP160	Q12769	1436 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SPIN3-238	ENST00000640421	CEP162	Q5TB80	1403 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SPIN3-238	ENST00000640421	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		28.59	■■■□□ 2.17
SPIN3-238	ENST00000640421	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
SPIN3-238	ENST00000640421	IQGAP2	Q13576	1575 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SPIN3-238	ENST00000640421	CLIP1	P30622	1438 aa		28.52	■■■□□ 2.16
SPIN3-238	ENST00000640421	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.48	■■■□□ 2.15
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SPIN3-238	ENST00000640421	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		28.44	■■■□□ 2.14
SPIN3-238	ENST00000640421	SAMD9	Q5K651	1589 aa		28.41	■■■□□ 2.14
SPIN3-238	ENST00000640421	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.39	■■■□□ 2.14
SPIN3-238	ENST00000640421	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		28.38	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	DISP1	Q96F81	1524 aa		28.36	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	P3H3	Q8IVL6	736 aa		28.34	■■■□□ 2.13
SPIN3-238	ENST00000640421	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		28.32	■■■□□ 2.12
SPIN3-238	ENST00000640421	KIAA0556	O60303	1618 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SPIN3-238	ENST00000640421	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	28.28	■■■□□ 2.12
SPIN3-238	ENST00000640421	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.26	■■■□□ 2.11
SPIN3-238	ENST00000640421	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		28.21	■■■□□ 2.11
SPIN3-238	ENST00000640421	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		28.19	■■■□□ 2.1
SPIN3-238	ENST00000640421	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	28.1	■■■□□ 2.09
SPIN3-238	ENST00000640421	FMN1	Q68DA7	1419 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SPIN3-238	ENST00000640421	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	28.08	■■■□□ 2.09
SPIN3-238	ENST00000640421	PTPRG	P23470	1445 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SPIN3-238	ENST00000640421	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SPIN3-238	ENST00000640421	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		28	■■■□□ 2.07
SPIN3-238	ENST00000640421	ARHGEF11	O15085	1522 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SPIN3-238	ENST00000640421	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		27.99	■■■□□ 2.07
SPIN3-238	ENST00000640421	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		27.95	■■■□□ 2.07
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCA8	O94911	1581 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		27.94	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		27.91	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	HECW1	Q76N89	1606 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
SPIN3-238	ENST00000640421	UACA	Q9BZF9	1416 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SPIN3-238	ENST00000640421	ARID3C	A6NKF2	412 aa		27.83	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	TIAM1	Q13009	1591 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCC2	Q92887	1545 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	PPARGC1B	Q86YN6	1023 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	MAP3K1	Q13233	1512 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	APLP2	Q06481	763 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SPIN3-238	ENST00000640421	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SPIN3-238	ENST00000640421	ATP10B	O94823	1461 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SPIN3-238	ENST00000640421	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SPIN3-238	ENST00000640421	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SPIN3-238	ENST00000640421	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		27.69	■■■□□ 2.02
SPIN3-238	ENST00000640421	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		27.66	■■■□□ 2.02
SPIN3-238	ENST00000640421	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
SPIN3-238	ENST00000640421	HNRNPUL2-BSCL2	H3BQZ7	746 aa	Predicted RBP	27.64	■■■□□ 2.01
SPIN3-238	ENST00000640421	HNRNPUL2	Q1KMD3	747 aa	Known RBP	27.64	■■■□□ 2.01
SPIN3-238	ENST00000640421	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		27.59	■■■□□ 2.01
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SPIN3-238	ENST00000640421	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		27.58	■■■□□ 2.01
SPIN3-238	ENST00000640421	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
SPIN3-238	ENST00000640421	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	27.53	■■■□□ 2
SPIN3-238	ENST00000640421	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		27.49	■■□□□ 1.99
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF14	Q15058	1648 aa		27.48	■■□□□ 1.99
SPIN3-238	ENST00000640421	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	27.47	■■□□□ 1.99
SPIN3-238	ENST00000640421	NCOA2	Q15596	1464 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SPIN3-238	ENST00000640421	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	27.44	■■□□□ 1.98
SPIN3-238	ENST00000640421	ASXL2	Q76L83	1435 aa		27.43	■■□□□ 1.98
SPIN3-238	ENST00000640421	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		27.43	■■□□□ 1.98
SPIN3-238	ENST00000640421	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SPIN3-238	ENST00000640421	MAPKBP1	O60336	1514 aa		27.36	■■□□□ 1.97
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		27.36	■■□□□ 1.97
SPIN3-238	ENST00000640421	KCNH8	Q96L42	1107 aa		27.35	■■□□□ 1.97
SPIN3-238	ENST00000640421	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	27.32	■■□□□ 1.96
SPIN3-238	ENST00000640421	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		27.32	■■□□□ 1.96
SPIN3-238	ENST00000640421	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		27.29	■■□□□ 1.96
SPIN3-238	ENST00000640421	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		27.26	■■□□□ 1.96
SPIN3-238	ENST00000640421	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		27.26	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	RRBP1	Q9P2E9	1410 aa	Known RBP	27.26	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		27.25	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		27.23	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		27.21	■■□□□ 1.95
SPIN3-238	ENST00000640421	PREX2	Q70Z35	1606 aa		27.19	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		27.19	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		27.18	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	MIA2	Q96PC5	1412 aa		27.17	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	DIP2B	Q9P265	1576 aa		27.16	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		27.16	■■□□□ 1.94
SPIN3-238	ENST00000640421	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	27.13	■■□□□ 1.93
SPIN3-238	ENST00000640421	PLCH2	O75038	1416 aa		27.12	■■□□□ 1.93
SPIN3-238	ENST00000640421	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		27.12	■■□□□ 1.93
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	27.12	■■□□□ 1.93

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