RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640421.1

SPIN3-238, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,872 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-238	ENST00000640421	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		41.64	■■■■■ 4.26
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		36.58	■■■■□ 3.45
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCC9	O60706	1549 aa		35.1	■■■■□ 3.21
SPIN3-238	ENST00000640421	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	34.88	■■■■□ 3.17
SPIN3-238	ENST00000640421	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		34.48	■■■■□ 3.11
SPIN3-238	ENST00000640421	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		34.42	■■■■□ 3.1
SPIN3-238	ENST00000640421	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		34.23	■■■■□ 3.07
SPIN3-238	ENST00000640421	NACAD	O15069	1562 aa		34.18	■■■■□ 3.06
SPIN3-238	ENST00000640421	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		34.02	■■■■□ 3.04
SPIN3-238	ENST00000640421	SCRIB	Q14160	1630 aa		33.56	■■■□□ 2.96
SPIN3-238	ENST00000640421	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		33.53	■■■□□ 2.96
SPIN3-238	ENST00000640421	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.39	■■■□□ 2.94
SPIN3-238	ENST00000640421	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SPIN3-238	ENST00000640421	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.97	■■■□□ 2.87
SPIN3-238	ENST00000640421	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SPIN3-238	ENST00000640421	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
SPIN3-238	ENST00000640421	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SPIN3-238	ENST00000640421	SMARCA4	P51532	1647 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SPIN3-238	ENST00000640421	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SPIN3-238	ENST00000640421	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SPIN3-238	ENST00000640421	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SPIN3-238	ENST00000640421	WIZ	O95785	1651 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SPIN3-238	ENST00000640421	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		31.78	■■■□□ 2.68
SPIN3-238	ENST00000640421	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.76	■■■□□ 2.68
SPIN3-238	ENST00000640421	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPIN3-238	ENST00000640421	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.69	■■■□□ 2.66
SPIN3-238	ENST00000640421	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.56	■■■□□ 2.64
SPIN3-238	ENST00000640421	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.64
SPIN3-238	ENST00000640421	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		31.51	■■■□□ 2.63
SPIN3-238	ENST00000640421	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	31.51	■■■□□ 2.63
SPIN3-238	ENST00000640421	HMGXB3	Q12766	1538 aa		31.48	■■■□□ 2.63
SPIN3-238	ENST00000640421	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		31.18	■■■□□ 2.58
SPIN3-238	ENST00000640421	CFTR	P13569	1480 aa		30.71	■■■□□ 2.51
SPIN3-238	ENST00000640421	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.7	■■■□□ 2.5
SPIN3-238	ENST00000640421	NES	P48681	1621 aa		30.66	■■■□□ 2.5
SPIN3-238	ENST00000640421	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.58	■■■□□ 2.49
SPIN3-238	ENST00000640421	PRDM2	Q13029	1718 aa		30.53	■■■□□ 2.48
SPIN3-238	ENST00000640421	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		30.37	■■■□□ 2.45
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCC8	Q09428	1581 aa		30.36	■■■□□ 2.45
SPIN3-238	ENST00000640421	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.32	■■■□□ 2.44
SPIN3-238	ENST00000640421	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		30.3	■■■□□ 2.44
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.29	■■■□□ 2.44
SPIN3-238	ENST00000640421	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		30.22	■■■□□ 2.43
SPIN3-238	ENST00000640421	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.19	■■■□□ 2.42
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNJ1	O43426	1573 aa		30.14	■■■□□ 2.42
SPIN3-238	ENST00000640421	CUX1	P39880	1505 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SPIN3-238	ENST00000640421	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.11	■■■□□ 2.41
SPIN3-238	ENST00000640421	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	30.05	■■■□□ 2.4
SPIN3-238	ENST00000640421	TRIM41	Q8WV44	630 aa		30.05	■■■□□ 2.4
SPIN3-238	ENST00000640421	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.04	■■■□□ 2.4
SPIN3-238	ENST00000640421	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.02	■■■□□ 2.4
SPIN3-238	ENST00000640421	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		30	■■■□□ 2.39
SPIN3-238	ENST00000640421	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		30	■■■□□ 2.39
SPIN3-238	ENST00000640421	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.98	■■■□□ 2.39
SPIN3-238	ENST00000640421	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.96	■■■□□ 2.39
SPIN3-238	ENST00000640421	WDR62	O43379	1518 aa		29.89	■■■□□ 2.38
SPIN3-238	ENST00000640421	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		29.85	■■■□□ 2.37
SPIN3-238	ENST00000640421	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.81	■■■□□ 2.36
SPIN3-238	ENST00000640421	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.7	■■■□□ 2.35
SPIN3-238	ENST00000640421	CUX2	O14529	1486 aa		29.68	■■■□□ 2.34
SPIN3-238	ENST00000640421	SOGA1	O94964	1423 aa		29.66	■■■□□ 2.34
SPIN3-238	ENST00000640421	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
SPIN3-238	ENST00000640421	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		29.6	■■■□□ 2.33
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SPIN3-238	ENST00000640421	WDR97	A6NE52	1622 aa		29.57	■■■□□ 2.32
SPIN3-238	ENST00000640421	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.53	■■■□□ 2.32
SPIN3-238	ENST00000640421	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	29.51	■■■□□ 2.31
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF27	Q86VH2	1401 aa		29.45	■■■□□ 2.3
SPIN3-238	ENST00000640421	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.3
SPIN3-238	ENST00000640421	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.44	■■■□□ 2.3
SPIN3-238	ENST00000640421	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SPIN3-238	ENST00000640421	EEA1	Q15075	1411 aa		29.41	■■■□□ 2.3
SPIN3-238	ENST00000640421	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.37	■■■□□ 2.29
SPIN3-238	ENST00000640421	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SPIN3-238	ENST00000640421	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.32	■■■□□ 2.28
SPIN3-238	ENST00000640421	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		29.31	■■■□□ 2.28
SPIN3-238	ENST00000640421	IGF1R	P08069	1367 aa		29.29	■■■□□ 2.28
SPIN3-238	ENST00000640421	PBRM1	Q86U86	1689 aa		29.25	■■■□□ 2.27
SPIN3-238	ENST00000640421	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		29.21	■■■□□ 2.27
SPIN3-238	ENST00000640421	GRIN2B	Q13224	1484 aa		29.18	■■■□□ 2.26
SPIN3-238	ENST00000640421	PRX	Q9BXM0	1461 aa		29.15	■■■□□ 2.26
SPIN3-238	ENST00000640421	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	EHMT2	Q96KQ7	1210 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	KIF21B	O75037	1637 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	CUL7	Q14999	1698 aa		29.11	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		29.1	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		29.08	■■■□□ 2.25
SPIN3-238	ENST00000640421	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SPIN3-238	ENST00000640421	ADAMTS12	P58397	1594 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SPIN3-238	ENST00000640421	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	29.01	■■■□□ 2.24
SPIN3-238	ENST00000640421	GOLGA3	Q08378	1498 aa		29	■■■□□ 2.23
SPIN3-238	ENST00000640421	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		29	■■■□□ 2.23
SPIN3-238	ENST00000640421	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.91	■■■□□ 2.22
SPIN3-238	ENST00000640421	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
SPIN3-238	ENST00000640421	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SPIN3-238	ENST00000640421	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
SPIN3-238	ENST00000640421	FBLN2	P98095	1184 aa		28.81	■■■□□ 2.2
SPIN3-238	ENST00000640421	CHD1	O14646	1710 aa		28.8	■■■□□ 2.2
SPIN3-238	ENST00000640421	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		28.79	■■■□□ 2.2
SPIN3-238	ENST00000640421	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.72	■■■□□ 2.19

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