RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639221.1

SLC35A3-216, Transcript of solute carrier family 35 member A3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SLC35A3, Length 1,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A3-216ENST00000639221 SHROOM2Q13796 1616 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC35A3-216ENST00000639221 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa37.61■■■■□ 3.61
SLC35A3-216ENST00000639221 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.57■■■■□ 3.6
SLC35A3-216ENST00000639221 EEA1Q15075 1411 aa37.49■■■■□ 3.59
SLC35A3-216ENST00000639221 CHIC1Q5VXU3 224 aa37.48■■■■□ 3.59
SLC35A3-216ENST00000639221 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.47■■■■□ 3.59
SLC35A3-216ENST00000639221 CSRNP3Q8WYN3 585 aa37.44■■■■□ 3.58
SLC35A3-216ENST00000639221 PRXQ9BXM0 1461 aa37.39■■■■□ 3.58
SLC35A3-216ENST00000639221 IQGAP2Q13576 1575 aa37.37■■■■□ 3.57
SLC35A3-216ENST00000639221 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa37.34■■■■□ 3.57
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP37.26■■■■□ 3.56
SLC35A3-216ENST00000639221 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.19■■■■□ 3.54
SLC35A3-216ENST00000639221 TNIKQ9UKE5 1360 aa37.16■■■■□ 3.54
SLC35A3-216ENST00000639221 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC35A3-216ENST00000639221 PTPRGP23470 1445 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC35A3-216ENST00000639221 UGGT2Q9NYU1 1516 aa37.15■■■■□ 3.54
SLC35A3-216ENST00000639221 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP37.12■■■■□ 3.53
SLC35A3-216ENST00000639221 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP37.09■■■■□ 3.53
SLC35A3-216ENST00000639221 GOLGA3Q08378 1498 aa37.07■■■■□ 3.52
SLC35A3-216ENST00000639221 DISP1Q96F81 1524 aa37.05■■■■□ 3.52
SLC35A3-216ENST00000639221 KIAA0556O60303 1618 aa36.98■■■■□ 3.51
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF21BO75037 1637 aa36.97■■■■□ 3.51
SLC35A3-216ENST00000639221 ADCY10Q96PN6 1610 aa36.89■■■■□ 3.5
SLC35A3-216ENST00000639221 UACAQ9BZF9 1416 aa36.87■■■■□ 3.49
SLC35A3-216ENST00000639221 UBTFP17480 764 aaKnown RBP36.84■■■■□ 3.49
SLC35A3-216ENST00000639221 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa36.82■■■■□ 3.48
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC2Q92887 1545 aa36.78■■■■□ 3.48
SLC35A3-216ENST00000639221 MAPKBP1O60336 1514 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC35A3-216ENST00000639221 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.76■■■■□ 3.48
SLC35A3-216ENST00000639221 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
SLC35A3-216ENST00000639221 P3H3Q8IVL6 736 aa36.74■■■■□ 3.47
SLC35A3-216ENST00000639221 SAMD9Q5K651 1589 aa36.67■■■■□ 3.46
SLC35A3-216ENST00000639221 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.63■■■■□ 3.45
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCC10Q5T3U5 1492 aa36.62■■■■□ 3.45
SLC35A3-216ENST00000639221 PLB1Q6P1J6 1458 aa36.62■■■■□ 3.45
SLC35A3-216ENST00000639221 KDM5BQ9UGL1 1544 aa36.61■■■■□ 3.45
SLC35A3-216ENST00000639221 EFCAB5A4FU69 1503 aa36.6■■■■□ 3.45
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCA8O94911 1581 aa36.57■■■■□ 3.44
SLC35A3-216ENST00000639221 ASXL2Q76L83 1435 aa36.55■■■■□ 3.44
SLC35A3-216ENST00000639221 FHOD3Q2V2M9 1422 aa36.5■■■■□ 3.43
SLC35A3-216ENST00000639221 DIP2BQ9P265 1576 aa36.49■■■■□ 3.43
SLC35A3-216ENST00000639221 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.48■■■■□ 3.43
SLC35A3-216ENST00000639221 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa36.39■■■■□ 3.42
SLC35A3-216ENST00000639221 WDR7Q9Y4E6 1490 aa36.37■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP36.35■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP36.35■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 ARID3CA6NKF2 412 aa36.34■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 GLI2P10070 1586 aa36.33■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 FMN1Q68DA7 1419 aa36.33■■■■□ 3.41
SLC35A3-216ENST00000639221 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP36.32■■■■□ 3.4
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa36.31■■■■□ 3.4
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP10BO94823 1461 aa36.31■■■■□ 3.4
SLC35A3-216ENST00000639221 KCNH8Q96L42 1107 aa36.26■■■■□ 3.4
SLC35A3-216ENST00000639221 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
SLC35A3-216ENST00000639221 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP36.2■■■■□ 3.39
SLC35A3-216ENST00000639221 TSPOAP1O95153 1857 aa36.18■■■■□ 3.38
SLC35A3-216ENST00000639221 PLEKHD1A6NEE1 506 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC35A3-216ENST00000639221 CLIP1P30622 1438 aa36.16■■■■□ 3.38
SLC35A3-216ENST00000639221 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.12■■■■□ 3.37
SLC35A3-216ENST00000639221 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.1■■■■□ 3.37
SLC35A3-216ENST00000639221 CD109Q6YHK3 1445 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC35A3-216ENST00000639221 HECW1Q76N89 1606 aa36.08■■■■□ 3.37
SLC35A3-216ENST00000639221 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP36.06■■■■□ 3.36
SLC35A3-216ENST00000639221 CFAP43Q8NDM7 1665 aa36.03■■■■□ 3.36
SLC35A3-216ENST00000639221 KDM6BO15054 1643 aa36.01■■■■□ 3.35
SLC35A3-216ENST00000639221 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa35.97■■■■□ 3.35
SLC35A3-216ENST00000639221 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
SLC35A3-216ENST00000639221 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa35.96■■■■□ 3.35
SLC35A3-216ENST00000639221 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
SLC35A3-216ENST00000639221 CEP162Q5TB80 1403 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC35A3-216ENST00000639221 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.93■■■■□ 3.34
SLC35A3-216ENST00000639221 ABCA9Q8IUA7 1624 aa35.91■■■■□ 3.34
SLC35A3-216ENST00000639221 CCDC18Q5T9S5 1454 aa35.88■■■■□ 3.33
SLC35A3-216ENST00000639221 FYCO1Q9BQS8 1478 aa35.86■■■■□ 3.33
SLC35A3-216ENST00000639221 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP35.85■■■■□ 3.33
SLC35A3-216ENST00000639221 PHLDB1Q86UU1 1377 aa35.83■■■■□ 3.33
SLC35A3-216ENST00000639221 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
SLC35A3-216ENST00000639221 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP35.73■■■■□ 3.31
SLC35A3-216ENST00000639221 NEO1Q92859 1461 aa35.73■■■■□ 3.31
SLC35A3-216ENST00000639221 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
SLC35A3-216ENST00000639221 KIF14Q15058 1648 aa35.68■■■■□ 3.3
SLC35A3-216ENST00000639221 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC35A3-216ENST00000639221 ARAP3Q8WWN8 1544 aa35.66■■■■□ 3.3
SLC35A3-216ENST00000639221 TTC37Q6PGP7 1564 aa35.64■■■■□ 3.3
SLC35A3-216ENST00000639221 CFAP74Q9C0B2 1584 aa35.62■■■■□ 3.29
SLC35A3-216ENST00000639221 FANCAO15360 1455 aa35.61■■■■□ 3.29
SLC35A3-216ENST00000639221 PLCH2O75038 1416 aa35.6■■■■□ 3.29
SLC35A3-216ENST00000639221 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.57■■■■□ 3.28
SLC35A3-216ENST00000639221 AKNAQ7Z591 1439 aa35.56■■■■□ 3.28
SLC35A3-216ENST00000639221 MTUS2Q5JR59 1369 aa35.54■■■■□ 3.28
SLC35A3-216ENST00000639221 VPS8Q8N3P4 1428 aa35.53■■■■□ 3.28
SLC35A3-216ENST00000639221 MYO5CQ9NQX4 1742 aa35.52■■■■□ 3.28
SLC35A3-216ENST00000639221 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.48■■■■□ 3.27
SLC35A3-216ENST00000639221 RAPGEF3O95398 923 aa35.48■■■■□ 3.27
SLC35A3-216ENST00000639221 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
SLC35A3-216ENST00000639221 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.45■■■■□ 3.27
SLC35A3-216ENST00000639221 ADGRL1O94910 1474 aa35.43■■■■□ 3.26
SLC35A3-216ENST00000639221 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.39■■■■□ 3.26
SLC35A3-216ENST00000639221 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa35.37■■■■□ 3.25
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