RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638121.1

CHML-204, Transcript of CHM like, Rab escort protein 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CHML, Length 920 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHML-204ENST00000638121 ERCC6L2Q5T890 1561 aa43.28■■■■■ 4.52
CHML-204ENST00000638121 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa43.25■■■■■ 4.51
CHML-204ENST00000638121 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.21■■■■■ 4.51
CHML-204ENST00000638121 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
CHML-204ENST00000638121 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.13■■■■■ 4.49
CHML-204ENST00000638121 PRXQ9BXM0 1461 aa43.01■■■■■ 4.48
CHML-204ENST00000638121 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43■■■■■ 4.47
CHML-204ENST00000638121 EEA1Q15075 1411 aa42.97■■■■■ 4.47
CHML-204ENST00000638121 IQGAP2Q13576 1575 aa42.96■■■■■ 4.47
CHML-204ENST00000638121 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
CHML-204ENST00000638121 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa42.81■■■■■ 4.44
CHML-204ENST00000638121 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa42.76■■■■■ 4.44
CHML-204ENST00000638121 UGGT2Q9NYU1 1516 aa42.73■■■■■ 4.43
CHML-204ENST00000638121 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.71■■■■■ 4.43
CHML-204ENST00000638121 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.68■■■■■ 4.42
CHML-204ENST00000638121 DISP1Q96F81 1524 aa42.68■■■■■ 4.42
CHML-204ENST00000638121 PTPRGP23470 1445 aa42.68■■■■■ 4.42
CHML-204ENST00000638121 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP42.65■■■■■ 4.42
CHML-204ENST00000638121 KIAA0556O60303 1618 aa42.56■■■■■ 4.4
CHML-204ENST00000638121 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.52■■■■■ 4.4
CHML-204ENST00000638121 KIF21BO75037 1637 aa42.51■■■■■ 4.4
CHML-204ENST00000638121 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.4
CHML-204ENST00000638121 GOLGA3Q08378 1498 aa42.5■■■■■ 4.39
CHML-204ENST00000638121 UACAQ9BZF9 1416 aa42.37■■■■■ 4.37
CHML-204ENST00000638121 EHMT2Q96KQ7 1210 aa42.33■■■■■ 4.37
CHML-204ENST00000638121 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa42.32■■■■■ 4.37
CHML-204ENST00000638121 P3H3Q8IVL6 736 aa42.28■■■■■ 4.36
CHML-204ENST00000638121 MAPKBP1O60336 1514 aa42.28■■■■■ 4.36
CHML-204ENST00000638121 ABCC2Q92887 1545 aa42.28■■■■■ 4.36
CHML-204ENST00000638121 UBTFP17480 764 aaKnown RBP42.25■■■■■ 4.35
CHML-204ENST00000638121 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
CHML-204ENST00000638121 SAMD9Q5K651 1589 aa42.22■■■■■ 4.35
CHML-204ENST00000638121 PLB1Q6P1J6 1458 aa42.17■■■■■ 4.34
CHML-204ENST00000638121 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.13■■■■■ 4.34
CHML-204ENST00000638121 KDM5BQ9UGL1 1544 aa42.11■■■■■ 4.33
CHML-204ENST00000638121 ABCA8O94911 1581 aa42.11■■■■■ 4.33
CHML-204ENST00000638121 KIF13AQ9H1H9 1805 aa42.11■■■■■ 4.33
CHML-204ENST00000638121 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.1■■■■■ 4.33
CHML-204ENST00000638121 ASXL2Q76L83 1435 aa42.04■■■■■ 4.32
CHML-204ENST00000638121 DIP2BQ9P265 1576 aa42.03■■■■■ 4.32
CHML-204ENST00000638121 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP42.02■■■■■ 4.32
CHML-204ENST00000638121 EFCAB5A4FU69 1503 aa42.01■■■■■ 4.32
CHML-204ENST00000638121 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42.01■■■■■ 4.32
CHML-204ENST00000638121 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa41.86■■■■■ 4.29
CHML-204ENST00000638121 ARID3CA6NKF2 412 aa41.84■■■■■ 4.29
CHML-204ENST00000638121 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa41.8■■■■■ 4.28
CHML-204ENST00000638121 ATP10BO94823 1461 aa41.79■■■■■ 4.28
CHML-204ENST00000638121 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.79■■■■■ 4.28
CHML-204ENST00000638121 GLI2P10070 1586 aa41.79■■■■■ 4.28
CHML-204ENST00000638121 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.79■■■■■ 4.28
CHML-204ENST00000638121 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
CHML-204ENST00000638121 TSPOAP1O95153 1857 aa41.7■■■■■ 4.27
CHML-204ENST00000638121 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
CHML-204ENST00000638121 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
CHML-204ENST00000638121 KCNH8Q96L42 1107 aa41.67■■■■■ 4.26
CHML-204ENST00000638121 FMN1Q68DA7 1419 aa41.65■■■■■ 4.26
CHML-204ENST00000638121 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.58■■■■■ 4.25
CHML-204ENST00000638121 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CHML-204ENST00000638121 CLIP1P30622 1438 aa41.52■■■■■ 4.24
CHML-204ENST00000638121 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHML-204ENST00000638121 PLEKHD1A6NEE1 506 aa41.46■■■■■ 4.23
CHML-204ENST00000638121 CD109Q6YHK3 1445 aa41.45■■■■■ 4.23
CHML-204ENST00000638121 HECW1Q76N89 1606 aa41.45■■■■■ 4.23
CHML-204ENST00000638121 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.44■■■■■ 4.22
CHML-204ENST00000638121 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.42■■■■■ 4.22
CHML-204ENST00000638121 KDM6BO15054 1643 aa41.42■■■■■ 4.22
CHML-204ENST00000638121 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CHML-204ENST00000638121 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.39■■■■■ 4.22
CHML-204ENST00000638121 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.35■■■■■ 4.21
CHML-204ENST00000638121 ABCA9Q8IUA7 1624 aa41.33■■■■■ 4.21
CHML-204ENST00000638121 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.31■■■■■ 4.2
CHML-204ENST00000638121 CEP162Q5TB80 1403 aa41.29■■■■■ 4.2
CHML-204ENST00000638121 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.28■■■■■ 4.2
CHML-204ENST00000638121 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
CHML-204ENST00000638121 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.2■■■■■ 4.19
CHML-204ENST00000638121 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
CHML-204ENST00000638121 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.18■■■■■ 4.18
CHML-204ENST00000638121 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.15■■■■■ 4.18
CHML-204ENST00000638121 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP41.14■■■■■ 4.182e-7■■□□□ 11.4
CHML-204ENST00000638121 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
CHML-204ENST00000638121 TTC37Q6PGP7 1564 aa41.07■■■■■ 4.16
CHML-204ENST00000638121 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.05■■■■■ 4.16
CHML-204ENST00000638121 NEO1Q92859 1461 aa41.02■■■■■ 4.16
CHML-204ENST00000638121 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.99■■■■■ 4.15
CHML-204ENST00000638121 KIF14Q15058 1648 aa40.98■■■■■ 4.15
CHML-204ENST00000638121 FANCAO15360 1455 aa40.92■■■■■ 4.14
CHML-204ENST00000638121 PLCH2O75038 1416 aa40.92■■■■■ 4.14
CHML-204ENST00000638121 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.87■■■■■ 4.13
CHML-204ENST00000638121 AKNAQ7Z591 1439 aa40.87■■■■■ 4.13
CHML-204ENST00000638121 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.84■■■■■ 4.13
CHML-204ENST00000638121 RAPGEF3O95398 923 aa40.83■■■■■ 4.13
CHML-204ENST00000638121 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.81■■■■■ 4.12
CHML-204ENST00000638121 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.8■■■■■ 4.12
CHML-204ENST00000638121 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.76■■■■■ 4.12
CHML-204ENST00000638121 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.75■■■■■ 4.11
CHML-204ENST00000638121 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.72■■■■■ 4.11
CHML-204ENST00000638121 ADGRL1O94910 1474 aa40.7■■■■■ 4.11
CHML-204ENST00000638121 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.69■■■■■ 4.11
CHML-204ENST00000638121 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.67■■■■■ 4.1
CHML-204ENST00000638121 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP40.66■■■■■ 4.1
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