RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628593.1

SETD9-211, Transcript of SET domain containing 9, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SETD9, Length 1,306 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD9-211ENST00000628593 EEA1Q15075 1411 aa36.48■■■■□ 3.43
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SETD9-211ENST00000628593 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
SETD9-211ENST00000628593 JPH4Q96JJ6 628 aa36.47■■■■□ 3.43
SETD9-211ENST00000628593 ARAP1Q96P48 1450 aa36.45■■■■□ 3.43
SETD9-211ENST00000628593 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.42■■■■□ 3.42
SETD9-211ENST00000628593 SHROOM2Q13796 1616 aa36.41■■■■□ 3.42
SETD9-211ENST00000628593 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.4■■■■□ 3.42
SETD9-211ENST00000628593 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.36■■■■□ 3.41
SETD9-211ENST00000628593 IQGAP2Q13576 1575 aa36.21■■■■□ 3.39
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SETD9-211ENST00000628593 KIF21BO75037 1637 aa36.06■■■■□ 3.36
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SETD9-211ENST00000628593 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa36.03■■■■□ 3.36
SETD9-211ENST00000628593 EHMT2Q96KQ7 1210 aa36.01■■■■□ 3.35
SETD9-211ENST00000628593 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa36■■■■□ 3.35
SETD9-211ENST00000628593 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.97■■■■□ 3.35
SETD9-211ENST00000628593 PTPRGP23470 1445 aa35.94■■■■□ 3.34
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SETD9-211ENST00000628593 GOLGA3Q08378 1498 aa35.92■■■■□ 3.34
SETD9-211ENST00000628593 KIAA0556O60303 1618 aa35.89■■■■□ 3.34
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SETD9-211ENST00000628593 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.72■■■■□ 3.31
SETD9-211ENST00000628593 SAMD9Q5K651 1589 aa35.69■■■■□ 3.3
SETD9-211ENST00000628593 UACAQ9BZF9 1416 aa35.69■■■■□ 3.3
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SETD9-211ENST00000628593 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.61■■■■□ 3.29
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SETD9-211ENST00000628593 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
SETD9-211ENST00000628593 EFCAB5A4FU69 1503 aa35.54■■■■□ 3.28
SETD9-211ENST00000628593 ABCA8O94911 1581 aa35.52■■■■□ 3.28
SETD9-211ENST00000628593 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa35.49■■■■□ 3.27
SETD9-211ENST00000628593 MAPKBP1O60336 1514 aa35.47■■■■□ 3.27
SETD9-211ENST00000628593 KDM5BQ9UGL1 1544 aa35.47■■■■□ 3.27
SETD9-211ENST00000628593 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa35.43■■■■□ 3.26
SETD9-211ENST00000628593 ASXL2Q76L83 1435 aa35.36■■■■□ 3.25
SETD9-211ENST00000628593 ARID3CA6NKF2 412 aa35.34■■■■□ 3.25
SETD9-211ENST00000628593 ABCC10Q5T3U5 1492 aa35.33■■■■□ 3.25
SETD9-211ENST00000628593 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP35.31■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 CLIP1P30622 1438 aa35.31■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa35.3■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 FAM69CQ0P6D2 419 aa35.3■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 ATP10BO94823 1461 aa35.28■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP35.28■■■■□ 3.24
SETD9-211ENST00000628593 FMN1Q68DA7 1419 aa35.26■■■■□ 3.23
SETD9-211ENST00000628593 DIP2BQ9P265 1576 aa35.23■■■■□ 3.23
SETD9-211ENST00000628593 CEP162Q5TB80 1403 aa35.2■■■■□ 3.22
SETD9-211ENST00000628593 WDR7Q9Y4E6 1490 aa35.17■■■■□ 3.22
SETD9-211ENST00000628593 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP35.14■■■■□ 3.22
SETD9-211ENST00000628593 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.14■■■■□ 3.22
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SETD9-211ENST00000628593 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.87■■■■□ 3.17
SETD9-211ENST00000628593 CD109Q6YHK3 1445 aa34.85■■■■□ 3.17
SETD9-211ENST00000628593 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa34.82■■■■□ 3.16
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SETD9-211ENST00000628593 CCDC18Q5T9S5 1454 aa34.81■■■■□ 3.16
SETD9-211ENST00000628593 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.8■■■■□ 3.16
SETD9-211ENST00000628593 TSPOAP1O95153 1857 aa34.79■■■■□ 3.16
SETD9-211ENST00000628593 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.76■■■■□ 3.16
SETD9-211ENST00000628593 ABCA9Q8IUA7 1624 aa34.75■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP34.75■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 VPS8Q8N3P4 1428 aa34.74■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.73■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.72■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP34.7■■■■□ 3.15
SETD9-211ENST00000628593 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.64■■■■□ 3.14
SETD9-211ENST00000628593 TTC37Q6PGP7 1564 aa34.63■■■■□ 3.13
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SETD9-211ENST00000628593 PLCH2O75038 1416 aa34.53■■■■□ 3.12
SETD9-211ENST00000628593 MTUS2Q5JR59 1369 aa34.52■■■■□ 3.12
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SETD9-211ENST00000628593 FANCAO15360 1455 aa34.47■■■■□ 3.11
SETD9-211ENST00000628593 ARAP3Q8WWN8 1544 aa34.45■■■■□ 3.11
SETD9-211ENST00000628593 TIAM1Q13009 1591 aa34.45■■■■□ 3.1
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SETD9-211ENST00000628593 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa34.4■■■■□ 3.1
SETD9-211ENST00000628593 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa34.4■■■■□ 3.1
SETD9-211ENST00000628593 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP34.39■■■■□ 3.1
SETD9-211ENST00000628593 MAP3K1Q13233 1512 aa34.39■■■■□ 3.1
SETD9-211ENST00000628593 RAPGEF3O95398 923 aa34.37■■■■□ 3.09
SETD9-211ENST00000628593 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa34.35■■■■□ 3.09
SETD9-211ENST00000628593 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
SETD9-211ENST00000628593 MYO5CQ9NQX4 1742 aa34.33■■■■□ 3.09
SETD9-211ENST00000628593 ARHGAP5Q13017 1502 aa34.33■■■■□ 3.09
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