RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP42.49■■■■■ 4.39
CAPNS1-216ENST00000628306 IGF1RP08069 1367 aa42.32■■■■■ 4.37
CAPNS1-216ENST00000628306 ADCY10Q96PN6 1610 aa42.26■■■■■ 4.36
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC10Q5T3U5 1492 aa42.26■■■■■ 4.36
CAPNS1-216ENST00000628306 MAPKBP1O60336 1514 aa42.25■■■■■ 4.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa42.25■■■■■ 4.35
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF27Q86VH2 1401 aa42.18■■■■■ 4.34
CAPNS1-216ENST00000628306 CUL7Q14999 1698 aa42.17■■■■■ 4.34
CAPNS1-216ENST00000628306 DIP2BQ9P265 1576 aa42.16■■■■■ 4.34
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM69CQ0P6D2 419 aa42.15■■■■■ 4.34
CAPNS1-216ENST00000628306 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP42.07■■■■■ 4.33
CAPNS1-216ENST00000628306 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa41.96■■■■■ 4.31
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRGP23470 1445 aa41.89■■■■■ 4.3
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM6BO15054 1643 aa41.81■■■■■ 4.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.8■■■■■ 4.28
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPOAP1O95153 1857 aa41.79■■■■■ 4.28
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCC2Q92887 1545 aa41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-216ENST00000628306 IQGAP2Q13576 1575 aa41.77■■■■■ 4.28
CAPNS1-216ENST00000628306 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa41.74■■■■■ 4.27
CAPNS1-216ENST00000628306 DISP1Q96F81 1524 aa41.69■■■■■ 4.26
CAPNS1-216ENST00000628306 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
CAPNS1-216ENST00000628306 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa41.67■■■■■ 4.26
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa41.66■■■■■ 4.26
CAPNS1-216ENST00000628306 ASXL2Q76L83 1435 aa41.65■■■■■ 4.26
CAPNS1-216ENST00000628306 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
CAPNS1-216ENST00000628306 GLI2P10070 1586 aa41.61■■■■■ 4.25
CAPNS1-216ENST00000628306 PLB1Q6P1J6 1458 aa41.59■■■■■ 4.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UACAQ9BZF9 1416 aa41.58■■■■■ 4.25
CAPNS1-216ENST00000628306 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.55■■■■■ 4.24
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa41.53■■■■■ 4.24
CAPNS1-216ENST00000628306 KDM5BQ9UGL1 1544 aa41.5■■■■■ 4.23
CAPNS1-216ENST00000628306 KIAA0556O60303 1618 aa41.43■■■■■ 4.22
CAPNS1-216ENST00000628306 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CAPNS1-216ENST00000628306 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41.4■■■■■ 4.22
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
CAPNS1-216ENST00000628306 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa41.38■■■■■ 4.21
CAPNS1-216ENST00000628306 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa41.2■■■■■ 4.19
CAPNS1-216ENST00000628306 ADGRL1O94910 1474 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR7Q9Y4E6 1490 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPNS1-216ENST00000628306 TEX14Q8IWB6 1497 aa41.17■■■■■ 4.18
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA8O94911 1581 aa41.11■■■■■ 4.17
CAPNS1-216ENST00000628306 PRXQ9BXM0 1461 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA3Q08378 1498 aa41.05■■■■■ 4.16
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa40.98■■■■■ 4.15
CAPNS1-216ENST00000628306 CD109Q6YHK3 1445 aa40.94■■■■■ 4.14
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP43Q8NDM7 1665 aa40.94■■■■■ 4.14
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNH8Q96L42 1107 aa40.86■■■■■ 4.13
CAPNS1-216ENST00000628306 ATP10BO94823 1461 aa40.76■■■■■ 4.12
CAPNS1-216ENST00000628306 HECW2Q9P2P5 1572 aa40.75■■■■■ 4.11
CAPNS1-216ENST00000628306 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CAPNS1-216ENST00000628306 P3H3Q8IVL6 736 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPNS1-216ENST00000628306 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPNS1-216ENST00000628306 SAMD9Q5K651 1589 aa40.68■■■■■ 4.1
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID3CA6NKF2 412 aa40.66■■■■■ 4.1
CAPNS1-216ENST00000628306 KIF21BO75037 1637 aa40.61■■■■■ 4.09
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.61■■■■■ 4.09
CAPNS1-216ENST00000628306 CSRNP3Q8WYN3 585 aa40.57■■■■■ 4.08
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.53■■■■■ 4.08
CAPNS1-216ENST00000628306 PHLDB1Q86UU1 1377 aa40.46■■■■■ 4.07
CAPNS1-216ENST00000628306 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP40.42■■■■■ 4.06
CAPNS1-216ENST00000628306 NEO1Q92859 1461 aa40.41■■■■■ 4.06
CAPNS1-216ENST00000628306 RAPGEF3O95398 923 aa40.39■■■■■ 4.06
CAPNS1-216ENST00000628306 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa40.38■■■■■ 4.06
CAPNS1-216ENST00000628306 ADAMTSL3P82987 1691 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPNS1-216ENST00000628306 FHOD3Q2V2M9 1422 aa40.35■■■■■ 4.05
CAPNS1-216ENST00000628306 EEA1Q15075 1411 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPNS1-216ENST00000628306 PTPRMP28827 1452 aa40.27■■■■■ 4.04
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
CAPNS1-216ENST00000628306 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.2■■■■■ 4.03
CAPNS1-216ENST00000628306 RICTORQ6R327 1708 aa40.14■■■■■ 4.02
CAPNS1-216ENST00000628306 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP40.14■■■■■ 4.026e-24■■□□□ 13
CAPNS1-216ENST00000628306 MADDQ8WXG6 1647 aa40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.12■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEKHD1A6NEE1 506 aa40.11■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 EFCAB5A4FU69 1503 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 AKNAQ7Z591 1439 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.09■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 TTC37Q6PGP7 1564 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPNS1-216ENST00000628306 FANCAO15360 1455 aa40.07■■■■■ 4
CAPNS1-216ENST00000628306 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa40■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.99■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa39.98■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 LMTK3Q96Q04 1460 aa39.97■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
CAPNS1-216ENST00000628306 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.93■■■■□ 3.98
CAPNS1-216ENST00000628306 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
CAPNS1-216ENST00000628306 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.87■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 PLCH2O75038 1416 aa39.85■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 HECW1Q76N89 1606 aa39.85■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 CHIC1Q5VXU3 224 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO41Q8TF61 875 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.84■■■■□ 3.97
CAPNS1-216ENST00000628306 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.81■■■■□ 3.96
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa39.79■■■■□ 3.96
CAPNS1-216ENST00000628306 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.78■■■■□ 3.96
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