RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628044.1

PFKL-212, Transcript of phosphofructokinase, liver type, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene PFKL, Length 129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKL-212ENST00000628044 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.52■■■■□ 3.28
PFKL-212ENST00000628044 CUL7Q14999 1698 aa35.51■■■■□ 3.28
PFKL-212ENST00000628044 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa35.42■■■■□ 3.26
PFKL-212ENST00000628044 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.4■■■■□ 3.26
PFKL-212ENST00000628044 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP35.24■■■■□ 3.23
PFKL-212ENST00000628044 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa35.13■■■■□ 3.21
PFKL-212ENST00000628044 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa35.1■■■■□ 3.21
PFKL-212ENST00000628044 IQGAP2Q13576 1575 aa35.09■■■■□ 3.21
PFKL-212ENST00000628044 PTPRGP23470 1445 aa35.08■■■■□ 3.21
PFKL-212ENST00000628044 ADCY10Q96PN6 1610 aa35.06■■■■□ 3.2
PFKL-212ENST00000628044 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
PFKL-212ENST00000628044 TNIKQ9UKE5 1360 aa35.03■■■■□ 3.2
PFKL-212ENST00000628044 MAPKBP1O60336 1514 aa35.02■■■■□ 3.2
PFKL-212ENST00000628044 FAM69CQ0P6D2 419 aa35■■■■□ 3.19
PFKL-212ENST00000628044 ABCC10Q5T3U5 1492 aa34.97■■■■□ 3.19
PFKL-212ENST00000628044 KIF13AQ9H1H9 1805 aa34.95■■■■□ 3.18
PFKL-212ENST00000628044 DISP1Q96F81 1524 aa34.89■■■■□ 3.18
PFKL-212ENST00000628044 UGGT2Q9NYU1 1516 aa34.87■■■■□ 3.17
PFKL-212ENST00000628044 DIP2BQ9P265 1576 aa34.85■■■■□ 3.17
PFKL-212ENST00000628044 ABCC2Q92887 1545 aa34.84■■■■□ 3.17
PFKL-212ENST00000628044 UACAQ9BZF9 1416 aa34.81■■■■□ 3.16
PFKL-212ENST00000628044 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa34.78■■■■□ 3.16
PFKL-212ENST00000628044 PRXQ9BXM0 1461 aa34.76■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 KIAA0556O60303 1618 aa34.75■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.71■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa34.7■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 ASXL2Q76L83 1435 aa34.7■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 PLB1Q6P1J6 1458 aa34.7■■■■□ 3.15
PFKL-212ENST00000628044 GOLGA3Q08378 1498 aa34.69■■■■□ 3.14
PFKL-212ENST00000628044 CSRNP3Q8WYN3 585 aa34.62■■■■□ 3.13
PFKL-212ENST00000628044 KDM5BQ9UGL1 1544 aa34.61■■■■□ 3.13
PFKL-212ENST00000628044 TSPOAP1O95153 1857 aa34.54■■■■□ 3.12
PFKL-212ENST00000628044 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP34.53■■■■□ 3.12
PFKL-212ENST00000628044 KDM6BO15054 1643 aa34.52■■■■□ 3.12
PFKL-212ENST00000628044 EEA1Q15075 1411 aa34.52■■■■□ 3.12
PFKL-212ENST00000628044 GLI2P10070 1586 aa34.52■■■■□ 3.12
PFKL-212ENST00000628044 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP34.5■■■■□ 3.11
PFKL-212ENST00000628044 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP34.46■■■■□ 3.11
PFKL-212ENST00000628044 ABCA8O94911 1581 aa34.4■■■■□ 3.1
PFKL-212ENST00000628044 WDR7Q9Y4E6 1490 aa34.4■■■■□ 3.1
PFKL-212ENST00000628044 P3H3Q8IVL6 736 aa34.39■■■■□ 3.1
PFKL-212ENST00000628044 TEX14Q8IWB6 1497 aa34.33■■■■□ 3.09
PFKL-212ENST00000628044 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa34.31■■■■□ 3.08
PFKL-212ENST00000628044 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
PFKL-212ENST00000628044 KCNH8Q96L42 1107 aa34.28■■■■□ 3.08
PFKL-212ENST00000628044 SAMD9Q5K651 1589 aa34.25■■■■□ 3.07
PFKL-212ENST00000628044 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP34.25■■■■□ 3.07
PFKL-212ENST00000628044 ARID3CA6NKF2 412 aa34.24■■■■□ 3.07
PFKL-212ENST00000628044 CD109Q6YHK3 1445 aa34.18■■■■□ 3.06
PFKL-212ENST00000628044 KIF21BO75037 1637 aa34.15■■■■□ 3.06
PFKL-212ENST00000628044 ATP10BO94823 1461 aa34.14■■■■□ 3.06
PFKL-212ENST00000628044 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.14■■■■□ 3.06
PFKL-212ENST00000628044 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa34.11■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 CFAP43Q8NDM7 1665 aa34.11■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP34.1■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa34.09■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 FHOD3Q2V2M9 1422 aa34.09■■■■□ 3.05
PFKL-212ENST00000628044 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa34.06■■■■□ 3.04
PFKL-212ENST00000628044 EFCAB5A4FU69 1503 aa34.03■■■■□ 3.04
PFKL-212ENST00000628044 UBTFP17480 764 aaKnown RBP34.02■■■■□ 3.04
PFKL-212ENST00000628044 EHMT2Q96KQ7 1210 aa34.01■■■■□ 3.03
PFKL-212ENST00000628044 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP33.99■■■■□ 3.03
PFKL-212ENST00000628044 ABCA9Q8IUA7 1624 aa33.9■■■■□ 3.02
PFKL-212ENST00000628044 ADGRL1O94910 1474 aa33.88■■■■□ 3.01
PFKL-212ENST00000628044 PLEKHD1A6NEE1 506 aa33.88■■■■□ 3.01
PFKL-212ENST00000628044 PHLDB1Q86UU1 1377 aa33.85■■■■□ 3.01
PFKL-212ENST00000628044 ARAP3Q8WWN8 1544 aa33.84■■■■□ 3.01
PFKL-212ENST00000628044 NEO1Q92859 1461 aa33.77■■■■□ 3
PFKL-212ENST00000628044 FMN1Q68DA7 1419 aa33.77■■■■□ 3
PFKL-212ENST00000628044 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP33.74■■■□□ 2.99
PFKL-212ENST00000628044 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa33.72■■■□□ 2.99
PFKL-212ENST00000628044 RAPGEF3O95398 923 aa33.68■■■□□ 2.98
PFKL-212ENST00000628044 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP33.68■■■□□ 2.98
PFKL-212ENST00000628044 HECW1Q76N89 1606 aa33.64■■■□□ 2.98
PFKL-212ENST00000628044 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP33.62■■■□□ 2.97
PFKL-212ENST00000628044 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP33.62■■■□□ 2.972e-13■■■■■ 105.7
PFKL-212ENST00000628044 FANCAO15360 1455 aa33.59■■■□□ 2.97
PFKL-212ENST00000628044 TTC37Q6PGP7 1564 aa33.56■■■□□ 2.96
PFKL-212ENST00000628044 AKNAQ7Z591 1439 aa33.56■■■□□ 2.96
PFKL-212ENST00000628044 CFAP74Q9C0B2 1584 aa33.55■■■□□ 2.96
PFKL-212ENST00000628044 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP33.54■■■□□ 2.96
PFKL-212ENST00000628044 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa33.5■■■□□ 2.95
PFKL-212ENST00000628044 PLCH2O75038 1416 aa33.46■■■□□ 2.95
PFKL-212ENST00000628044 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.46■■■□□ 2.95
PFKL-212ENST00000628044 CLIP1P30622 1438 aa33.44■■■□□ 2.94
PFKL-212ENST00000628044 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
PFKL-212ENST00000628044 KIF14Q15058 1648 aa33.39■■■□□ 2.94
PFKL-212ENST00000628044 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa33.39■■■□□ 2.94
PFKL-212ENST00000628044 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa33.39■■■□□ 2.94
PFKL-212ENST00000628044 RICTORQ6R327 1708 aa33.38■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa33.38■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.36■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 CCDC18Q5T9S5 1454 aa33.36■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP33.33■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa33.33■■■□□ 2.93
PFKL-212ENST00000628044 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.32■■■□□ 2.92
PFKL-212ENST00000628044 MYO5CQ9NQX4 1742 aa33.32■■■□□ 2.92
PFKL-212ENST00000628044 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.4 ms