RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626162.2

PCBP1-AS1-288, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 696 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CEP170Q5SW79 1584 aa14.95□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CLIP1P30622 1438 aa14.94□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa14.93□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa14.91□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CHD1O14646 1710 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ARAP1Q96P48 1450 aa14.89□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 IQGAP2Q13576 1575 aa14.88□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 UGGT2Q9NYU1 1516 aa14.87□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CLASP1Q7Z460 1538 aa14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 SAMD9Q5K651 1589 aa14.84□□□□□ -0.03
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 EFCAB5A4FU69 1503 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 DISP1Q96F81 1524 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 JPH4Q96JJ6 628 aa14.82□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 FHOD3Q2V2M9 1422 aa14.81□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 P3H3Q8IVL6 736 aa14.8□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 VPS8Q8N3P4 1428 aa14.79□□□□□ -0.04
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 SHROOM2Q13796 1616 aa14.77□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 OSCARQ8IYS5 282 aa14.76□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KIAA0556O60303 1618 aa14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.72□□□□□ -0.05
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa14.7□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 FMN1Q68DA7 1419 aa14.68□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa14.67□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 FYCO1Q9BQS8 1478 aa14.63□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PTPRGP23470 1445 aa14.62□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PLB1Q6P1J6 1458 aa14.61□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ABCA8O94911 1581 aa14.6□□□□□ -0.07
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MAP3K1Q13233 1512 aa14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TIAM1Q13009 1591 aa14.55□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 UACAQ9BZF9 1416 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ARHGEF11O15085 1522 aa14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 HECW1Q76N89 1606 aa14.53□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.52□□□□□ -0.08
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.51□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ATP10BO94823 1461 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CCDC18Q5T9S5 1454 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CFAP43Q8NDM7 1665 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ARID3CA6NKF2 412 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 APLP2Q06481 763 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ABCC2Q92887 1545 aa14.5□□□□□ -0.09
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.45□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.44□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MTUS2Q5JR59 1369 aa14.41□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa14.41□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PHLDB1Q86UU1 1377 aa14.39□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.38□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 NCOA2Q15596 1464 aa14.37□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PLEKHD1A6NEE1 506 aa14.35□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.35□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.33□□□□□ -0.11
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.33□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KIF14Q15058 1648 aa14.32□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa14.3□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ASXL2Q76L83 1435 aa14.3□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.29□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.28□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.27□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CCNB3Q8WWL7 1395 aa14.27□□□□□ -0.12
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.25□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 KCNH8Q96L42 1107 aa14.24□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MAPKBP1O60336 1514 aa14.24□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 MIA2Q96PC5 1412 aa14.24□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.22□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 TTC37Q6PGP7 1564 aa14.22□□□□□ -0.13
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PLCH2O75038 1416 aa14.18□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PTPRKQ15262 1439 aa14.16□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.16□□□□□ -0.14
PCBP1-AS1-288ENST00000626162 PREX2Q70Z35 1606 aa14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms